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Chro_00200 : CDS information

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Organism
StrainATCC 13273 (=NBRC 3746)
Entry nameChromomycin
Contig
Start / Stop / Direction21,346 / 22,329 / + [in whole cluster]
21,346 / 22,329 / + [in contig]
Location21346..22329 [in whole cluster]
21346..22329 [in contig]
TypeCDS
Length984 bp (327 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative C-4' ketoreductase
Product (GenBank)side-chain ketoreductase
Gene
Gene (GenBank)cmmWI
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[15112992] Biosynthesis of the antitumor chromomycin A3 in Streptomyces griseus: analysis of the gene cluster and rational design of novel chromomycin analogs. (Chem Biol. , 2004)
comment
aureolic acid type antitumor drug chromomycin A3の生合成gene clusterの同定論文。

CmmWI : Ketoreductase

mithramycin生合成においてC3-側鎖に影響するketoreduction stepに関連することが証明されたketoreductase_MtmWに似ている。

cmmWI mutantはmithramycin非産生、抗癌活性がありC3-側鎖のみが異なる新規化合物を蓄積する。
よって側鎖形成に関与することが確認され、側鎖C-4'のketo基還元を担うと考えられている。

またこれら蓄積化合物はすべてchromomycin A3と同様にglycosylateされているので、C-3側鎖形成は最終stepであると考えられる。
Related Reference
ACC
Q194Q1
NITE
Mith_00240
PmId
[12733914] Mithramycin SK, a novel antitumor drug with improved therapeutic index, mithramycin SA, and demycarosyl-mithramycin SK: three new products generated in the mithramycin producer Streptomyces argillaceus through combinatorial biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2003)
[16571899] Novel GC-rich DNA-binding compound produced by a genetically engineered mutant of the mithramycin producer Streptomyces argillaceus exhibits improved transcriptional repressor activity: implications for cancer therapy. (Nucleic Acids Res. , 2006)
comment
Blast 2nd, id64%, 1e-105
Streptomyces argillaceus_mtmW
Putative side chain reductase

---
[PMID:12733914](2003) abstract
mithramycin生合成の最終ステップにおいて、C-3 pentyl側鎖のketo基はketoreductase MtmWによって二級アルコールへと還元されると提唱された。

mtmW不活化mutantは3つの新規mithramycin類似体を蓄積。これらはmithramycinより短くて構造の異なるC-3側鎖を有することから、MtmWの提唱される役割は間接的に確認された。

主要蓄積物mithramycin SKはmithramycinと比べて改善された治療係数を示した。

---
[PMID:16571899](2006)
上記論文と同じmtmW mutantから、抽出条件を変更して新規産物mithramycin SDKを分離。
mithramycin SKに似ているが、C-3側鎖のC-2'にOH基ではなくketo基を含む。

ketoreductase MtmW がないとmithramycin SK and SDKをもたらす短いC-3側鎖の再編成について、formic acid(SK) or formaldehyde(SDK)の除去による経路を提唱している。

上記論文で13C取り込み実験が行われ、C-3'がSKの形成の際に切りとられたことが証明されているとの引用記載あり。

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selected fasta
>putative C-4' ketoreductase [side-chain ketoreductase]
MEHRYLGRSGLRISEIVFGNLLYPQDSTPDGTVLGCLRTALDEGVTTFDTADIYGMGRSE
ELLGRALAGEPRDGVVICTKVFFPAGNGPNGSGLSRKHVREGLEASLRRLDTDYVDLYTA
HRYDPNTPLEETMLAFADLVRAGKVLYMGVSEWTPEQIGEAAALAKELGVHLIYNMPQYS
ALWREPEARVMPACERLGIGVVPYFTLAQGVLSGKYLPGRPAPEDSRGGAELIGGRARFM
RRFLADDVLERVQRLAGPASEAGLTLSQLAMAWVLRQPGVAGAVVGASRPEQVRENAAAS
GVKLDPGLVERIDEVLGPVAEYGAADA
selected fasta
>putative C-4' ketoreductase [side-chain ketoreductase]
ATGGAACACCGGTACCTGGGGCGCAGCGGACTGCGCATCAGCGAGATCGTCTTCGGCAAT
CTGCTCTATCCGCAGGACAGCACGCCCGACGGGACGGTGCTCGGCTGTCTGCGCACGGCG
CTGGACGAGGGCGTCACGACGTTCGACACCGCGGACATCTACGGGATGGGGCGTTCGGAG
GAGCTCCTGGGCAGGGCCCTCGCCGGCGAGCCGCGTGACGGGGTGGTGATCTGTACCAAG
GTCTTCTTCCCGGCTGGTAACGGGCCGAACGGCTCGGGGCTCTCCCGCAAACACGTCCGT
GAAGGTCTCGAAGCCTCGCTGCGGCGGCTGGACACCGACTACGTCGACCTCTACACGGCC
CATCGCTACGACCCGAACACCCCGCTGGAAGAGACCATGCTCGCCTTCGCTGACCTGGTG
CGCGCCGGCAAGGTCCTCTACATGGGAGTCTCGGAATGGACCCCCGAGCAGATCGGCGAG
GCGGCGGCACTGGCGAAGGAGCTGGGGGTCCACCTCATCTACAACATGCCCCAGTACTCG
GCGCTCTGGCGTGAGCCCGAGGCGCGGGTGATGCCCGCCTGCGAGCGCCTCGGCATCGGG
GTGGTGCCCTACTTCACCCTCGCCCAGGGGGTGCTGAGCGGAAAGTACCTGCCCGGCAGG
CCAGCGCCCGAGGACTCACGGGGCGGTGCCGAACTGATCGGCGGCCGGGCCAGGTTCATG
CGGCGCTTCCTTGCGGACGATGTGCTCGAGCGGGTCCAGCGGCTGGCGGGGCCCGCCTCG
GAGGCGGGGCTGACGCTCTCCCAGCTCGCCATGGCCTGGGTGCTGCGGCAGCCGGGCGTG
GCGGGCGCCGTCGTCGGGGCGTCCCGGCCGGAGCAGGTGAGGGAGAACGCCGCGGCCTCC
GGGGTGAAACTCGACCCCGGCCTGGTGGAGCGGATCGACGAGGTGCTCGGCCCGGTGGCG
GAGTACGGGGCGGCCGATGCGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR023210 NADP-dependent oxidoreductase domain (Domain)
[1-317] 7.79999999999999e-94 G3DSA:3.20.20.100
G3DSA:3.20.20.100   Aldo/ket_red
[1-324] 1.3000049540733e-93 SSF51430
SSF51430   Aldo/ket_red
[15-315] 5.59999999999999e-72 PF00248
PF00248   Aldo_ket_red
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Chro_00190 Chro_00190   Chro_00210 Chro_00210
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