| Category | 3.3 modification reduction |
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| Product | putative oxidoreductase |
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| Product (GenBank) | third ring cyclase |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | elmJ |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | |
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| Reference | - ACC
- Q9L4X8
- PmId
[11325225] Cloning, sequencing, and heterologous expression of the elmGHIJ genes involved in the biosynthesis of the polyketide antibiotic elloramycin from Streptomyces olivaceus Tu2353. (J Nat Prod. , 2001)
[18310024] Biosynthesis of elloramycin in Streptomyces olivaceus requires glycosylation by enzymes encoded outside the aglycon cluster. (Microbiology. , 2008) - comment
- [PMID: 11325225](2001)
Elloramycin A産生に関連するcosmid clone 16F4からのelmGHIJを同定。
elmJに関しては配列解析のみ。
ElmJは機能が謎なままであるTcmJ, SchB, WhiE-ORFII, CurCに似ている。
他の報告で、S. glaucescensでのtetracenomycin C産生にTcmJは必須ではないが、深く影響しうることが示されている。また、TcmJは構成的タンパクの中で相互作用を促進することによりtetracenomycin PKS多タンパク質複合体の最適活性を供給しうるという推測が導かれている。
高いAA配列保存性に基づき、ElmJに同じ役割が提唱される。それはElmJがelloramycin PKSとの相互作用によりelloramycin Aの産生を拡大しうるというもの。
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[PMID: 18310024](2008)
elloramycin clusterの同定論文。
elmJについては配列解析のみ。
elmJ: Third ring cyclase
cyclases ElmI (4th ring), ElmJ(3rd ring) と monooxygenase ElmHの作用により、tetracyclic生合成中間体tetracenomycin D3が生成されるだろうと述べている。
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| Related Reference | - ACC
- P16558
- PmId
[8244926] The tcmVI region of the tetracenomycin C biosynthetic gene cluster of Streptomyces glaucescens encodes the tetracenomycin F1 monooxygenase, tetracenomycin F2 cyclase, and, most likely, a second cyclase. (J Bacteriol. , 1993)
[8248801] Enzymatic synthesis of a bacterial polyketide from acetyl and malonyl coenzyme A. (Science. , 1993)
[9609708] Reconstitution of the iterative type II polyketide synthase for tetracenomycin F2 biosynthesis. (Biochemistry. , 1998) - comment
- Blast 2nd, id67%, 2e-41
Streptomyces glaucescens_tcmJ
Tetracenomycin polyketide synthesis protein tcmJ
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[PMID:8244926](1993)
tcmH, tcmI, tcmJの同定論文。
・tcmH はtetracenomycin(TCM) F1 → TCM D3 へ変換するC-5 monooxygenaseをコードする。
・tcmI はTCM F2 → TCM F1 へ変換するD-ring cyclaseをコードする。
・tcmJ はTCM F2の生合成で働くB-ring cyclaseをおそらくコードする。TCM F2の生合成で、TcmNのN末domain（tcmN177 geneによってコードされる）はTcmJより遅くに働く。
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[PMID: 8248801](1993)
TcmKLMNにTcmJを追加すると4倍以上の全活性増加が見られた。
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[PMIDなし, JACS, 1995, 117, 6811-6821]
elmGHIJの同定論文[PMID: 11325225](2001)で、ElmJの機能提唱のために引用されている。
act PKS geneとtcm PKS gene, tcmN, tcmJを組み合わせたplasmidを導入して、その産物を確認している。
tcmJ geneは代謝産物量に影響しうるが、その生合成には必須ではない。
この結果は[PMID:8244926]での報告と一致するとのこと。
TcmJの機能は謎なままであるが、TcmN と TcmJは相加的に作用すると考えられている。TcmN は、PKS複合体形成を促進させることで、または、cyclase TcmNをPKS複合体へ結合させることで、最適な活性を供給すると予測している。
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[PMID: 9609708](1998) abstract
機能不明なTcmJはtetracenomycin F2の産生を非常に増やすが、再構成されたシステムにおいてcyclaseとしてTcmN(1st and 2nd ring cyclase)を置換できなかった。
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- ACC
- P23157
- PmId
[15701630] A novel quinone-forming monooxygenase family involved in modification of aromatic polyketides. (J Biol Chem. , 2005) - comment
- Blast 6th, id54%, 8e-32
Streptomyces coelicolor_SCO5319
16.7 kDa protein in whiE locus(WhiE ORF II)
type III PKSに隣接して存在し、cupin superfamilyに属するMomAは、1,3,6,8-tetrahydroxynaphthalene (THN) → flaviolin へのmonooxygenationを触媒する。加えて基質としていくつかのpolyketidesを使用し、対応するquinoneを形成する。
MomAとAA配列類似のあるWhiE-ORFII はtype II minimal PKSの上流に隣接し、MomAと同様にTHNのmonooxygenationを触媒した。
よってcupin superfamilyに属する新規クラスのquinone形成monooxygenasesは、types II and III のPKSsによって合成された芳香族polyketidesの修飾に関連する。
WhiE-ORFII とAA配列類似のあるTcmJについても考察していて、PKS componentとの接着剤として働くarchitectural proteinというこれまでの提唱とは異なり、後期修飾段階に関連すると想定している。
ElmJ, TcmJ, GrhSを含んだalignmentあり。
ElmJにおけるCupin motif内の重要なsitesは、各motifで4/5, 3/4保存されている。
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Ello_00090
Location
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