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Kirro_00210 : CDS information

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Organism
StrainTü365
Entry nameKirromycin
Contig
Start / Stop / Direction24,631 / 23,876 / - [in whole cluster]
24,631 / 23,876 / - [in contig]
Locationcomplement(23876..24631) [in whole cluster]
complement(23876..24631) [in contig]
TypeCDS
Length756 bp (251 aa)
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Category1.4 Other
Productphosphopantetheinyl transferase
Product (GenBank)putative Sfp type phosphopantetheinyl transferase
Gene
Gene (GenBank)kirP
EC number2.7.8.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[18291322] Molecular analysis of the kirromycin biosynthetic gene cluster revealed beta-alanine as precursor of the pyridone moiety. (Chem Biol. , 2008)
[21401713] The phosphopantetheinyl transferase KirP activates the ACP and PCP domains of the kirromycin NRPS/PKS of Streptomyces collinus Tu 365. (FEMS Microbiol Lett. , 2011)
comment
[PMID: 18291322]
kirromycin生合成gene clusterの報告。

相同性より機能付けをしている。

[PMID:21401713]
KirPの機能解析論文。

kirP不活性株の解析からKirPはkirromycin生合成に関与していると示唆されたが、同時にゲノムに存在する別のPPTaseにより弱いが相補できることも示された。
in vitroでphosphopantetheinylation assayを見ている。
kirromycin PKS/NRPSのacyl carrier protein とpetidyl carrier domainsの両方に対して活性を示した。
KirPの天然基質であるCoAに加えて、アポ体形成のためのcarrier proteinへacyl-phosphopantetheinyl基をtransferすることを確認した。
motif P3の保存配列FSxKESLxK と系統解析から、Sfp-type PPTasesのF/KES subfamilyに属すると示された。

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selected fasta
>phosphopantetheinyl transferase [putative Sfp type phosphopantetheinyl transferase]
MITGSVGTGLLSALLPSGVAVAELFADPPHIDLHPQEAAVVAGAVDKRRREFAAVRLCAR
AALRRIGATPGPIVPGPKGAPQWPDGVVGSMTHCDGYRAAAVAHRTMFASIGIDAEPHAA
LPEGVEKLTALPEERTALSRLAVTHPRVHWDRLLFSAKESVYKAWFPLTGRWLDFMECAI
TPDPECHTFTADFTVPGPVVGEDRINRFTGRWHAGGDARHVVTAVTVPWPAGKWGGANRS
PESLGVYAGGR
selected fasta
>phosphopantetheinyl transferase [putative Sfp type phosphopantetheinyl transferase]
GTGATCACGGGATCCGTCGGCACCGGATTGCTGAGCGCCCTCCTCCCCTCCGGTGTCGCC
GTTGCCGAACTGTTCGCCGATCCACCGCACATCGACCTGCATCCGCAGGAGGCGGCCGTC
GTGGCCGGCGCGGTCGACAAGCGCCGCCGCGAGTTCGCCGCCGTCCGTCTGTGCGCCCGC
GCGGCGCTGAGACGCATCGGAGCGACACCCGGACCGATCGTGCCGGGCCCCAAGGGTGCA
CCGCAGTGGCCGGACGGGGTGGTCGGCAGCATGACGCACTGTGACGGCTACCGAGCGGCG
GCGGTAGCTCATCGCACTATGTTCGCCTCGATCGGTATCGACGCCGAGCCGCATGCCGCT
CTGCCCGAGGGCGTGGAGAAGCTGACCGCGCTGCCCGAGGAGCGAACGGCACTGAGTCGG
CTGGCGGTCACCCACCCTCGCGTCCACTGGGACCGGCTGCTGTTCAGCGCCAAGGAGAGC
GTTTACAAGGCGTGGTTCCCCCTGACCGGCCGCTGGCTGGACTTCATGGAATGCGCCATC
ACGCCCGATCCGGAATGTCATACCTTCACGGCCGACTTCACCGTGCCCGGACCGGTCGTC
GGCGAAGACCGGATCAACAGGTTCACCGGACGCTGGCACGCCGGGGGTGACGCTCGGCAT
GTCGTCACCGCTGTCACCGTGCCGTGGCCCGCCGGAAAGTGGGGCGGCGCAAACCGGTCG
CCCGAGAGCCTCGGCGTCTACGCAGGAGGACGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR003542 Enterobactin synthetase-like, component D (Family)
[46-66] 6.09999977126211e-27 PR01399 [76-94] 6.09999977126211e-27 PR01399 [153-169] 6.09999977126211e-27 PR01399
PR01399   ENTSNTHTASED
IPR008278 4'-phosphopantetheinyl transferase (Domain)
[108-185] 6.1e-07 G3DSA:3.90.470.20
G3DSA:3.90.470.20   G3DSA:3.90.470.20
[110-179] 1.9e-13 PF01648
PF01648   ACPS
[107-229] 1.39999892049878e-12 SSF56214
SSF56214   4-PPT_transf
SignalP
[1-26] 0.996 Signal
Bacteria, Gram-positive   
[1-26] 0.99 Signal
Eukaryota   
[1-22] 0.999 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM No significant hit
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