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Kirro_00330 : CDS information

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Organism
StrainTü365
Entry nameKirromycin
Contig
Start / Stop / Direction92,721 / 93,677 / + [in whole cluster]
92,721 / 93,677 / + [in contig]
Location92721..93677 [in whole cluster]
92721..93677 [in contig]
TypeCDS
Length957 bp (318 aa)
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Category3.2 modification methylation
Productputative methyltransferase
Product (GenBank)putative SAM-dependent methyltransferase
Gene
Gene (GenBank)kirM
EC number2.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[18291322] Molecular analysis of the kirromycin biosynthetic gene cluster revealed beta-alanine as precursor of the pyridone moiety. (Chem Biol. , 2008)
comment
kirromycin生合成gene clusterの報告。

C-20で唯一のO-methyl基が存在することから、KirMはその形成に関与しているかもしれないと予測している。

本ORFは機能解析実験されていない。
Related Reference
ACC
Q54303
NITE
Rapam_00180
PmId
[11372782] Deletion of rapQONML from the rapamycin gene cluster of Streptomyces hygroscopicus gives production of the 16-O-desmethyl-27-desmethoxy analog. (J Antibiot (Tokyo). , 2001)
[16990929] Rapamycin biosynthesis: Elucidation of gene product function. (Org Biomol Chem. , 2006)
comment
Streptomyces hygroscopicus_methyltransferase(rapM)

[PMID: 11372782]
rapQONMLのdeletion mutantはpipecolateを添加すると、rapamycinの代わりにanalog 16-O-desmethyl-27-desmethoxyrapamycinを産生した。これは、rapNによってコードされるP450 hydroxylaseがC-27に特異的で、rapQとrapM によってコードされるO-methyltransferasesがC-16 and C-27でのhydroxyl基をメチル化することを示す。

--
[PMID: 16990929]
rapKIJMNOQL deletion mutant S.hygroscopicus MG2-10をrapMで相補すると、C-16でのみO-methylationされたpre-rapamycin(PKSから放出された後の最初の中間体。未修飾aglycon.)が得られる。
また、rapMを発現したS.lividans TK24株にpre-rapamycinを与えると、同じ化合物が得られた。

rapKIJMNOQL deletion mutant S.hygroscopicus MG2-10をrapMNOで相補すると、C-27でhydroxylateされ、C-16でmethylateされたpre-rapamycinを蓄積。

よって、RapMはC-16に特異的なO-methylationを担う。

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selected fasta
>putative methyltransferase [putative SAM-dependent methyltransferase]
MSQPDVMTAFTAGLADINLDESRAPRSGAEAAGMKSASSSIYDMAATLSGRGELWNWGMY
DPGLAAEIEARLPGFTDFGTDGFSEQLYYLALRDLPDGLDGCADRTVLEVGCGTGEGLNF
LSRLVPGARMTGLDLSPKAVARAEATLARGETLRFVQGDAEKLPFEDSSVDVLINIESSH
TYPDLGRFLHEAARVLRPGGTLSHIDVFTRQRLRTMRGITEEMPQLKWITDHDVSAEVRA
AVRRRMAPGSRFRRTLDRQRMNPLVRTIATHSQILMFGGMFAGYRPPSSVKVLSRLGLVP
WMSGLPMESYRHQVAVRV
selected fasta
>putative methyltransferase [putative SAM-dependent methyltransferase]
ATGAGCCAACCCGATGTGATGACCGCCTTCACCGCCGGTCTCGCGGACATCAACCTCGAC
GAGTCCAGAGCACCCCGCTCGGGGGCCGAGGCCGCCGGGATGAAATCCGCCAGTTCCTCC
ATCTACGACATGGCGGCCACCCTGTCCGGTCGCGGTGAGCTGTGGAACTGGGGGATGTAC
GACCCCGGTCTGGCGGCCGAGATCGAGGCCCGGCTGCCCGGGTTCACCGACTTCGGCACC
GACGGGTTCAGCGAGCAGCTCTACTACCTGGCCCTGCGCGACCTGCCCGACGGTCTGGAC
GGGTGCGCCGACCGGACGGTTCTGGAGGTGGGCTGCGGGACGGGCGAAGGGCTCAACTTC
CTGTCCCGCCTCGTCCCCGGCGCCCGGATGACCGGCCTCGACCTGTCGCCGAAGGCGGTC
GCCCGGGCCGAGGCCACGCTGGCGCGGGGTGAGACCCTGCGCTTCGTCCAGGGCGACGCC
GAGAAGCTGCCGTTCGAGGACTCCTCGGTGGATGTGCTGATCAACATCGAGAGCTCGCAC
ACGTATCCCGATCTGGGCCGCTTTCTGCACGAGGCCGCGCGGGTGCTGCGGCCGGGCGGG
ACGCTGTCGCACATCGACGTGTTCACCCGCCAGCGGCTGCGGACGATGCGGGGGATCACC
GAGGAGATGCCCCAGCTGAAGTGGATCACCGATCACGACGTCTCCGCCGAGGTCCGCGCC
GCGGTGCGCCGCCGGATGGCCCCGGGCAGCCGCTTCCGCCGCACGCTCGACCGGCAGCGG
ATGAACCCGCTGGTGCGCACGATCGCCACGCACAGTCAGATCCTGATGTTCGGCGGCATG
TTCGCCGGCTACCGGCCGCCCTCCTCGGTCAAGGTACTCAGCCGGCTCGGCCTCGTGCCG
TGGATGAGCGGCCTGCCGATGGAGAGCTACCGGCACCAGGTCGCCGTCCGAGTCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR013216 Methyltransferase type 11 (Domain)
[108-202] 2.8e-24 PF08241
PF08241   Methyltransf_11
SignalP
[1-31] 0.227 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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