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Ncarz_00020 : CDS information

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Organism
StrainATCC 15944
Entry nameNeocarzinostatin
Contig
Start / Stop / Direction11,170 / 12,750 / + [in whole cluster]
11,170 / 12,750 / + [in contig]
Location11170..12750 [in whole cluster]
11170..12750 [in contig]
TypeCDS
Length1,581 bp (526 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productputative aminotransferase
Product (GenBank)aminotransferase
GenencsC3
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • deoxy aminosugar
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[15797213] The neocarzinostatin biosynthetic gene cluster from Streptomyces carzinostaticus ATCC 15944 involving two iterative type I polyketide synthases. (Chem Biol. , 2005)
comment
Neocarzinostatin生合成遺伝子クラスターの報告。

ncsC3: Ammonia lyase/transferase

種々のhistidine or phenylalanine ammonia lyasesとC-1027生合成におけるaminomutase SgcC4に似ているNcsC3は、deoxysugar生合成においてC-2でアミノ基を取り込む。

histidineまたはphenylalanine ammonia lyasesで高く保存されたAla-Ser-Gly motifが完全に保存されていないことからlyaseとしての機能はないと推察。

相同性より機能付けしている。
Related Reference
ACC
Q8GMG0
NITE
C1027_00330
PmId
[12785829] A novel 4-methylideneimidazole-5-one-containing tyrosine aminomutase in enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2003)
[14580219] Kinetic analysis of the 4-methylideneimidazole-5-one-containing tyrosine aminomutase in enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthesis. (Biochemistry. , 2003)
comment
Streptomyces globisporus
Putative ammonia lyase/transferase

[PMID:12785829]
SgcC4の欠損株作製によりC-1027生産に必須であることを示した。また、E.coliで発現、精製。過剰発現株作製。酵素学的な解析から、SgcC4はl-tyrosineを(S)-beta-tyrosineへ変換する酵素tyrosine aminomutaseであることが証明された。また、MIO-mediated 2,3-aminomutase activityにcritical roleを示すAla-Ser-Gly motifのS153をalanineに置換したmutantの解析から、SgcC4は活性のためにMIOを要求する新規のaminomutaseであるとしている。


[PMID:14580219]
site-directed mutagenesis実験から、SgcC4は中間体として4-hydroxycinnamateを経由してL-tyrosineを(S)-beta-tyrosinへ変換されることを示した。また、SgcC4はbeta-tyrosine racemase activityも検出されたが、alpha-tyrosine racemase activityは検出されなかった。

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selected fasta
>putative aminotransferase [aminotransferase]
MTTAETATGPVVVDGESLSVDALRQVAESGTPVKVHTEAMEKVLRSRASLESMIIRGEPV
PGAVGGDGRESPPGIDVARESERQTNLVRSHSVGVGPLYAEDEARAMVTARLNSLAKGHS
AVRPDILDRMVLYLNEGIIPAVPEIGSSGPVDLVPLAHVASTLIGEGHVLHDGRRQETRR
VLGAMGVAPLRLGVKEGTALINGTSGTVGLGALVVARALDQVRQAEIASAFFDDAVRGSD
SPFLAEGHDTARPHRGQIDSAANLRDLLADSRGRRETEHGGAVLGFPGPQVPGFYTARTV
PQVLGAARDALRHATEELEAELNSANDEPLFLPDGKVLHGGTAQGRAVALALEFVAIALS
HVGELAERQIDRMLTRRPASGVARYLVAADPTLHHGFAGVGHTARALTAENLAVGTAAAQ
VVTAFGDDRPTAGTGLLAARNARRVLQNNDRIIAIGLIVAAQAADLARRFDDLSRANMAT
YDMVRSLVPSLGVDRSMAQDVELIATALSRAEFLHLLLRQEGIVLR
selected fasta
>putative aminotransferase [aminotransferase]
GTGACCACAGCTGAGACCGCCACTGGTCCGGTCGTCGTCGACGGCGAGAGCCTCAGCGTC
GATGCCCTGCGTCAGGTCGCGGAGTCAGGGACCCCCGTGAAGGTCCACACCGAAGCGATG
GAGAAGGTACTCAGGAGCCGTGCCTCGCTGGAGAGCATGATCATTCGCGGCGAGCCCGTA
CCTGGTGCCGTCGGCGGTGACGGCCGTGAGAGCCCGCCAGGCATCGATGTGGCGCGGGAG
TCCGAACGGCAGACGAACCTGGTGCGCAGCCACAGCGTCGGCGTCGGGCCCCTGTACGCC
GAGGACGAGGCACGAGCCATGGTGACGGCGCGTCTGAACTCTCTGGCCAAAGGGCACTCG
GCCGTGCGACCGGACATACTCGACCGCATGGTGCTCTATCTGAACGAGGGGATAATCCCG
GCCGTGCCCGAGATCGGATCATCTGGTCCGGTTGATCTCGTTCCCCTCGCCCATGTGGCA
AGCACCCTGATCGGGGAAGGGCATGTTCTGCACGACGGCAGGCGCCAGGAGACCCGCAGG
GTCCTGGGCGCGATGGGAGTCGCACCGCTCCGGCTCGGTGTCAAGGAGGGCACTGCGCTG
ATCAATGGCACGTCGGGCACGGTCGGCCTGGGAGCGCTCGTGGTGGCACGAGCCCTTGAC
CAGGTGCGCCAGGCAGAGATCGCCTCGGCCTTCTTCGACGACGCGGTGCGAGGTTCCGAC
AGCCCGTTCCTGGCCGAAGGACATGACACGGCCCGTCCACATCGGGGGCAGATCGACTCG
GCCGCCAACTTGCGTGATCTGCTGGCGGACAGCCGGGGGCGGCGGGAAACGGAGCACGGG
GGTGCCGTGCTCGGGTTCCCGGGGCCGCAGGTACCCGGCTTCTACACGGCACGCACGGTG
CCGCAGGTGCTCGGCGCGGCCCGGGACGCCCTCCGGCACGCTACGGAGGAGCTGGAGGCA
GAACTCAACTCCGCGAACGACGAACCTCTCTTCTTACCGGACGGAAAAGTCCTCCACGGC
GGAACCGCCCAGGGGCGGGCCGTGGCGCTCGCCCTGGAGTTTGTCGCCATCGCGCTCAGC
CACGTCGGCGAGCTGGCCGAACGGCAGATCGACCGCATGCTCACCCGGCGTCCGGCCTCC
GGCGTTGCGCGGTACCTCGTGGCGGCGGATCCGACGCTGCACCATGGTTTCGCGGGCGTC
GGCCACACAGCGCGGGCCCTCACGGCGGAGAACCTGGCGGTCGGCACTGCCGCTGCTCAG
GTCGTTACCGCCTTCGGCGACGACCGGCCAACGGCCGGCACCGGGCTCCTGGCGGCCCGC
AACGCACGACGCGTGCTGCAGAACAATGATCGGATCATTGCCATTGGCCTCATCGTCGCA
GCTCAGGCCGCCGACCTCGCTCGGAGATTCGATGATCTGAGCCGGGCGAACATGGCCACG
TACGACATGGTGCGTTCCCTGGTCCCGTCCCTCGGCGTCGACCGTTCGATGGCGCAGGAC
GTCGAGTTGATCGCCACTGCCCTGTCCCGGGCAGAGTTCCTCCATCTGCTCCTGCGGCAG
GAGGGGATCGTTCTGCGCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001106 Aromatic amino acid lyase (Family)
[11-491] 1.39999999999997e-123 PF00221
PF00221   Lyase_aromatic
IPR008948 L-Aspartase-like (Domain)
[1-517] SSF48557
SSF48557   L-Aspartase-like
IPR024083 L-Aspartase-like, N-terminal (Domain)
[4-203] 8.00000000000001e-53 G3DSA:1.10.275.10
G3DSA:1.10.275.10   G3DSA:1.10.275.10
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Ncarz_00010 Ncarz_00010   Ncarz_00030 Ncarz_00030
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