Ncarz_00320 Ncarz_00320   Ncarz_00340 Ncarz_00340

Ncarz_00330 : CDS information

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Organism
StrainATCC 15944
Entry nameNeocarzinostatin
Contig
Start / Stop / Direction58,477 / 52,544 / - [in whole cluster]
58,477 / 52,544 / - [in contig]
Locationcomplement(52544..58477) [in whole cluster]
complement(52544..58477) [in contig]
TypeCDS
Length5,934 bp (1,977 aa)
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Category1.1 PKS
Productpolyketide synthase
Product (GenBank)warhead-forming iterative polyketide synthase
GenencsE
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • iterative
  • enediyne core
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[15797213] The neocarzinostatin biosynthetic gene cluster from Streptomyces carzinostaticus ATCC 15944 involving two iterative type I polyketide synthases. (Chem Biol. , 2005)
[12536216] A genomics-guided approach for discovering and expressing cryptic metabolic pathways. (Nat Biotechnol. , 2003)
[18223152] A phosphopantetheinylating polyketide synthase producing a linear polyene to initiate enediyne antitumor antibiotic biosynthesis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2008)
[25019332] Enediyne polyketide synthases stereoselectively reduce the beta-ketoacyl intermediates to beta-D-hydroxyacyl intermediates in enediyne core biosynthesis. (Org Lett. , 2014)
comment
[PMID:15797213]
Neocarzinostatin生合成遺伝子クラスターの報告

ncsE: Type I PKS: KS, AT, (ACP), DH, KR, TD
*TD:terminal domain(possibly containing a phosphopantetheinyl transferase)

---
[PMID:12536216]
warhead cassette(UNBL-UNBV-UNBU-PKSE-TEBC)はactinomyceteにおいて全てのenediyne生合成遺伝子座で保存されているが、機能は未知のままである。enediyne warheadのformation, stabilization, or transport に関与しているのではないかと推測している。
このclusterでもwarhead cassetteはNcarz_00320-Ncarz_00360で保存されている。

---
[PMID:18223152]
Streptomyces globisporusのC-1027生合成遺伝子SgcE geneの機能解析

Ecoでrecombinant SgcEを発現。
S974のセリンに4'-PP cofactorが付着し、340massがシフトすることを確認。C211A, S659A, S860Aでは同様のシフトが見られたが、他のmutantはシフトを観察できなかった。同様の実験をNcsEでも行い、同じ結果を得た。したがって、SgcEとNcsEはACPを含んだPKSであり、 C末端ドメインのPPTase (phosphopantetheinyl transferase)の存在も示唆された。

in vitroで4'-PP cofactorの取り込みをモニタリングしたところ、SgcE と NcsE はACP-dependentであり、ACP domainはC-terminal　PPTase domainによって翻訳後に修飾されることが判明した。

また、精製したSgcE or NcsE solutionは黄色色素が検出され、これはSgcE と SgcE10、NcsE と NcsE10を共発現させることにより検出されることが判明。

ラベル化したacetateの取り込み実験から、SgcE10 or NcsE はketoreductionとdehydrationと併用してClaisen condensationを7 rounds起こし、ACP-tethered 3-hydroxy-4,6,8,10,12,14-hexadecahexaeneを産生する。その後、thioester結合はlinear polyeneを産生するためにSgcE10 or NcsE10 により加水分解される。続けて、十分な複合体を産出するためdecarboxylationとdehydrationが起こる。ただし、SgcE10 or NcsE10 によってdecarboxylationとdehydrationが起こるかは未解明であるとしている。

---
[PMID: 25019332]
Enediyne Polyketide SynthaseのKR domainについての調査。
Related Reference
ACC
Q8GME1
NITE
C1027_00520
PmId
[12183628] Biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (Science. , 2002)
[12536216] A genomics-guided approach for discovering and expressing cryptic metabolic pathways. (Nat Biotechnol. , 2003)
[14528002] Rapid PCR amplification of minimal enediyne polyketide synthase cassettes leads to a predictive familial classification model. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2003)
[18223152] A phosphopantetheinylating polyketide synthase producing a linear polyene to initiate enediyne antitumor antibiotic biosynthesis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2008)
[25019332] Enediyne polyketide synthases stereoselectively reduce the beta-ketoacyl intermediates to beta-D-hydroxyacyl intermediates in enediyne core biosynthesis. (Org Lett. , 2014)
comment
BLAST id68%
Streptomyces globisporus
Polyketide synthase

---
[PMID:18223152]
C-1027生合成遺伝子SgcE geneの機能解析

下記残基をアラニンに置換したmutant株でのC-1027の生産をみたところ、C211, S659, S974, D1827, D1829は必須であるが、S860は必須ではないことが判明。

Ecoでrecombinant SgcEを発現。
S974のセリンに4'-PP cofactorが付着により340massがシフトすることを確認。C211A, S659A, S860Aでは同様のシフトが見られたが、他のmutantはシフトを観察できなかった。同様の実験をNcsEでも行い、同じ結果を得た。したがって、SgcE と NcsEがACPを含んだPKSであり、 C末端ドメインのPPTase(phosphopantetheinyl transferase)の存在も示唆された。

in vitroで4'-PP cofactorの取り込みをモニタリングを行ったところ、SgcE と NcsEはACP-dependentであり、ACP domainはC-terminal PPTase domainによって翻訳後に修飾されることが判明した。

また、精製したSgcE or NcsE solutionは黄色色素が検出され、これはSgcE と SgcE10、NcsE と NcsE10を共発現させることにより検出されることが判明。HPLCでこの産物は、1,3,5,7,9,11,13-pentadecaheptaeneであることがわかった。さらに、同位体炭素の取り込みによりその生合成経路が判明した。

---
[PMID: 25019332]
Enediyne Polyketide SynthaseのKR domainについての調査。
ACC
Q84HI8
NITE
Dynm_00180
PmId
[18328078] The biosynthetic genes encoding for the production of the dynemicin enediyne core in Micromonospora chersina ATCC53710. (FEMS Microbiol Lett. , 2008)
[22589546] Crystal structure of the acyltransferase domain of the iterative polyketide synthase in enediyne biosynthesis. (J Biol Chem. , 2012)
[12536216] A genomics-guided approach for discovering and expressing cryptic metabolic pathways. (Nat Biotechnol. , 2003)
[25019332] Enediyne polyketide synthases stereoselectively reduce the beta-ketoacyl intermediates to beta-D-hydroxyacyl intermediates in enediyne core biosynthesis. (Org Lett. , 2014)
comment
BLAST id43%
Micromonospora chersina
PksE_pksE
DynE8

[PMID: 22589546]
dynemicin生合成遺伝子DynE8の結晶構造解析。
iterative PKSのAT domainでは初めての構造解析報告。

malonyl 特異的 AT domainはacetyl-CoAを認識出来ないとされてきたが、構造解析および生化学解析からDynE8のAT domainは触媒残基Ser651上でmalonyl-CoAまたはacetyl-CoAかのどちらか一方からacyl基をuploadする事が出来ることを示した。DynE8のAT domainは加水分解からアセチル酵素中間体ではなくマロニル化酵素を保護し、ACPへのmalonyl基の移動を促進することを明らかにした。

close this sectionPKS/NRPS Module

A1 acetyl-CoA
malonyl-CoA
KS2..412
AT619..835
ACP956..1057
KR1237..1420
DH1489..1644
PPT1746..1956

close this sectionSequence

selected fasta
>polyketide synthase [warhead-forming iterative polyketide synthase]
MTRIAIVGMACRYPDATSPAELWANAIAGRRAFRRLPEERIRLEDYWDADPSTPDTFYAR
NAAVLEGYSFDRVTHRIAGSTFRSTDMTHWLALDTAGRALADAGFPAGEGLPHERTGVVM
GNTLTGEFTRANVMRLRWPYVRRVMAAALAGQQDWDEARVTAFLEEVETSYKAPFPPVDE
DTLAGGLSNTIAGRICNHFDLNGGGYTVDGACSSSLLSVTTAGTALVNGDLDVAVAGGVD
LSIDPFEIIGFAKTGALARGEMKLYDKGSNGFWPGEGCGVVVLMREEDAIARGHRIYATV
AGWGVSSDGQGGITRPEVDGYRLALERAYARAGFGIETVPLFEGHGTGTAVGDATELAAL
IKARSAADPQAPVAAIGSIKGMIGHTKAAAGVAGLIKAALAVDNQTLPPSIGTSDPHELL
TEPGANLKALRKAETWPRELPRRAGITAMGFGGINTHVVLDEPSGRRRPASVRRLTPLAD
SMQDSELLLFEGASARELSHRLSEVADYTVRLSYGEIADLAATLQRELRGLPHRAAAVVT
SPDDAENRLRHLADLLDRGETEHWAADGRTLLGKATGRKRIGLLFPGQGSGRGTGGGALS
RRFPEVAEVLARAGSAAGSDTVATEVAQPRIVTGSAAGLRVLDELRVEASVGIGHSLGEL
SALCWAGALDEDVLIEAAGVRGRAMAEHGSSGTMASLGAAPEQAEELIGALSVVVAGYNG
PQQTVVSGPVHEVEEVRRRAARSGVTCTPLAVSHAFHSPLVASAAESFGNWLKSVDFREP
AGRVVSTVTGAELTPGTDLSALLREQITAAVRFTEAVRAAAQDVDLFIEVGPGRVLGHLA
GTATNIPAVSLDTDDESLRSLLQVVGAAFVVGAPVAPERLFRDRLIRPLRIGQELSFLAS
PCEQAPATTLPVSRRSAQPPAVPADREQEPQPAAVSPPAAQNSPASNDTSTASTASTAGS
ERTPQEEESIGAKALDVLSALVVERAELPAHLVDPDSRLLDDLHLSSITVGQIVNQAMAQ
LGIAPAAQEPTNFATATLAELAEALESLASTGGPADAGAASFIAGAAPWARPFAVDLDAV
ARPPARPAAVRGTWELFAPAGYGIAATLRAALQDAQAGSGVLVCLPPQCSADGIDLALAA
AKRALAAPKDSRFVLVQHGRAAAGLVKTLHQEASHLVTTVVDTPLTEDTVDRVVAEVSAT
TRFSEVHYSADGVRRVPTLRALPMSPEQQDKPLSASDVLLVTGGGKGISAECALAIAQDS
GTRLAVLGRSDPATDRELADNLKRMEDSGVTMRYARADVTNPEQVRTAVAELRGELGPIT
GVLHGAGRNEPGPLHALEPEDFRRTFAPKVDGLRTVLEAVDAEELKLLVTFGSIIGRAGL
RGEAHYATANEWLADLTEEIARTHPQVRARCVEWSVWSGVGMGEKLSVVESLSRQGIVPV
SPDQGVEILLRLIRDPDAPVVTVVSGRTEGIETVRRDLPPLPLLRFTGTPLVRYHGVELV
TEVELNAGTDPYLGDHLLDGNLLLPAVMGMEAMVQVAAAATGWPGTPVIEGARFLRPIVV
PPDGSTTIRVAATVTGPDTVDVAVHASDTGFAAEHFRARLVYSVAGVPDGPPLQTGSDTP
EVPLDPASDLYGGILFQGSRFQRLRRFHRMAARHVDADVTVRRPEGWFAGFLPAEMLLAD
PGMRDALMHGNQVCVPDATLLPSGVERVHPLGNSGNVPDQLRYCAVERSRDGDTYVYDIA
VRDAEGTVVERWEGLTLHAVRKTNGSGPWVAPLLGPYLERTLEEVLGAHIAVTVEPHGDN
PAGSVAERRALTTIAASRTLGAAVTVRHRPDGRPEVDGGWHISASHGLELTVSAVARAEV
ACDIEAVSMREPSEWQGLLGEYAAVAELVARETGEAPDTAATRVWSAVECLRKAGAMAGT
PLTVLPQKKEAWVVFTAGDLRIATFVTALRDALEPAVFAFLTRTPELLEGRSQDYVG
selected fasta
>polyketide synthase [warhead-forming iterative polyketide synthase]
ATGACCAGAATCGCCATCGTCGGCATGGCCTGCCGCTACCCCGACGCCACCAGTCCCGCC
GAACTGTGGGCCAACGCCATTGCCGGACGCCGAGCCTTCCGACGCCTCCCCGAGGAACGA
ATACGTCTGGAGGACTACTGGGACGCCGATCCGTCCACACCCGACACCTTCTACGCCCGC
AACGCGGCCGTGCTCGAGGGGTATTCCTTCGACCGCGTTACCCACCGGATCGCCGGCAGT
ACGTTCAGGTCCACCGACATGACGCACTGGCTCGCCCTGGACACTGCCGGGCGGGCGCTG
GCCGACGCCGGGTTCCCGGCGGGTGAGGGGCTGCCTCACGAGCGGACCGGCGTCGTCATG
GGCAACACGCTCACCGGTGAATTCACCCGTGCCAACGTCATGCGGCTGCGCTGGCCGTAC
GTGCGGCGGGTGATGGCGGCCGCGCTCGCCGGACAGCAGGACTGGGACGAGGCCCGGGTC
ACCGCGTTCCTCGAGGAGGTCGAAACCTCCTACAAGGCGCCGTTCCCGCCCGTCGACGAG
GACACTCTGGCCGGTGGGCTCTCCAACACCATCGCCGGCCGGATCTGCAACCACTTCGAC
CTCAACGGCGGCGGATACACCGTCGACGGAGCCTGCTCCTCCTCGCTGCTGTCGGTCACC
ACCGCCGGAACAGCTCTGGTCAACGGTGACTTGGACGTCGCCGTCGCCGGTGGTGTCGAC
CTGTCCATCGACCCGTTCGAGATCATCGGCTTCGCCAAGACCGGTGCTCTGGCCCGGGGG
GAGATGAAGCTGTACGACAAGGGCTCCAACGGTTTCTGGCCCGGCGAGGGCTGCGGAGTG
GTCGTGCTGATGCGGGAAGAGGACGCGATCGCACGCGGCCACCGCATCTACGCGACCGTC
GCAGGCTGGGGGGTGTCCTCGGACGGTCAGGGCGGGATCACCCGGCCCGAGGTCGACGGC
TACCGCCTGGCCCTCGAGCGTGCCTACGCGCGTGCCGGGTTCGGCATCGAGACCGTCCCC
CTCTTCGAGGGCCACGGCACGGGAACGGCCGTTGGTGACGCGACGGAGCTGGCGGCGCTG
ATAAAGGCCCGCTCGGCAGCCGACCCGCAGGCGCCTGTCGCCGCCATCGGCTCCATCAAG
GGCATGATCGGTCACACCAAGGCGGCAGCAGGCGTGGCAGGTCTGATCAAGGCGGCCCTG
GCGGTGGACAACCAGACCCTGCCGCCCTCCATCGGCACCTCCGATCCGCACGAGCTGCTC
ACCGAGCCAGGGGCCAACCTCAAGGCGCTGCGCAAGGCGGAAACCTGGCCCCGGGAACTG
CCGCGCCGCGCGGGCATCACCGCCATGGGGTTCGGCGGCATCAACACGCACGTAGTCCTG
GACGAGCCGTCCGGCCGGCGCCGGCCGGCTTCCGTCCGCCGGCTCACCCCCCTGGCCGAC
TCCATGCAGGACAGCGAACTCCTGCTGTTCGAGGGGGCCTCGGCCCGAGAGCTGAGCCAC
AGGTTGTCCGAGGTCGCGGACTACACTGTGAGGCTCTCGTACGGGGAGATCGCCGACCTC
GCCGCCACTCTCCAGCGCGAGCTCCGGGGCCTTCCGCACCGGGCAGCGGCGGTGGTGACC
TCTCCGGACGACGCCGAGAACCGGCTGCGCCACCTCGCGGACCTTCTGGACCGGGGGGAG
ACGGAGCACTGGGCCGCGGACGGCCGGACCCTCCTTGGAAAGGCCACCGGCCGCAAACGG
ATCGGTCTGCTGTTTCCCGGCCAGGGCTCTGGACGCGGCACCGGTGGCGGTGCGTTGAGC
CGCCGCTTCCCCGAGGTCGCCGAGGTGCTGGCTCGCGCCGGGTCGGCGGCGGGCTCGGAC
ACCGTGGCCACCGAAGTGGCCCAGCCGCGCATCGTCACTGGTTCGGCAGCGGGTCTGCGT
GTTCTGGACGAGCTGCGGGTGGAGGCGTCCGTCGGTATCGGACACAGCCTCGGCGAGCTC
TCCGCCCTGTGCTGGGCCGGGGCTCTCGACGAGGACGTCCTGATCGAGGCGGCGGGCGTG
CGTGGCAGGGCAATGGCGGAGCACGGGTCGTCGGGAACCATGGCGTCACTGGGTGCCGCA
CCGGAGCAGGCGGAGGAGCTCATCGGCGCCCTCTCCGTGGTCGTGGCCGGCTACAACGGT
CCGCAGCAGACGGTCGTCTCGGGTCCCGTGCACGAAGTGGAGGAGGTGCGCAGGCGGGCC
GCTCGCTCCGGCGTGACGTGTACGCCGCTTGCCGTGTCCCACGCGTTCCACTCACCGCTC
GTGGCGTCCGCCGCCGAGTCGTTCGGCAACTGGCTGAAGAGCGTTGACTTTCGCGAGCCC
GCCGGACGTGTGGTGTCCACGGTCACCGGGGCCGAGCTGACACCGGGCACTGACCTGTCG
GCGCTGCTGCGGGAGCAGATCACCGCTGCGGTGCGTTTCACCGAAGCGGTCAGGGCCGCG
GCCCAGGACGTCGACCTGTTCATCGAGGTGGGACCCGGCCGGGTGCTCGGCCACCTGGCC
GGGACGGCGACGAACATTCCCGCGGTTTCCCTCGACACGGACGACGAGTCCCTGCGATCG
CTCCTGCAGGTGGTGGGCGCCGCGTTCGTCGTCGGCGCGCCCGTCGCCCCCGAACGCCTC
TTCCGGGACCGGTTGATACGCCCGCTCCGGATTGGCCAGGAGCTCTCCTTCCTGGCCAGT
CCATGCGAACAGGCACCGGCGACGACCCTACCCGTATCGCGCCGGTCCGCCCAGCCGCCC
GCCGTACCTGCTGATCGCGAACAAGAGCCGCAGCCCGCGGCCGTGTCACCTCCGGCAGCA
CAGAACTCCCCGGCCTCGAACGACACCTCCACCGCGTCCACCGCGTCCACCGCCGGGTCC
GAGCGGACGCCTCAGGAGGAGGAGAGCATCGGCGCCAAGGCCCTCGATGTCCTCAGTGCC
CTGGTCGTCGAGCGAGCCGAACTCCCGGCCCACCTGGTGGACCCGGACAGCAGGCTCCTG
GACGACCTGCACCTGAGCTCCATCACCGTCGGCCAGATCGTGAACCAGGCCATGGCGCAA
CTCGGTATCGCCCCGGCAGCGCAGGAGCCGACGAACTTCGCCACTGCCACGCTGGCGGAA
CTGGCCGAAGCGCTCGAGAGCCTGGCCAGTACCGGCGGCCCGGCCGATGCCGGTGCGGCT
TCGTTCATCGCCGGAGCGGCGCCGTGGGCGCGTCCCTTCGCGGTGGACCTGGACGCGGTC
GCCCGGCCGCCGGCGCGTCCGGCAGCGGTTCGCGGCACCTGGGAGCTGTTCGCACCGGCC
GGGTATGGGATCGCCGCGACACTGCGCGCGGCGCTCCAGGACGCCCAGGCGGGTTCCGGA
GTGCTGGTCTGTCTGCCGCCCCAGTGCTCTGCCGACGGGATCGACCTGGCGCTAGCAGCG
GCGAAGCGGGCGCTCGCCGCCCCGAAGGACAGCCGTTTCGTGCTGGTGCAGCACGGCCGC
GCTGCCGCCGGCCTGGTCAAGACCCTCCACCAGGAGGCGTCCCACCTGGTGACGACTGTC
GTCGACACCCCCCTCACCGAGGACACGGTGGACCGGGTGGTCGCCGAGGTGTCGGCGACC
ACCCGGTTCTCCGAGGTGCACTACAGCGCGGACGGAGTCCGCCGCGTCCCCACGCTGCGG
GCACTCCCCATGAGCCCGGAGCAACAGGACAAACCGCTCAGCGCATCCGACGTCCTGCTG
GTCACCGGGGGTGGCAAGGGCATCTCCGCCGAGTGCGCCCTGGCGATCGCCCAGGACAGC
GGGACACGGCTTGCGGTGCTGGGACGCTCCGACCCGGCCACGGACCGAGAACTGGCCGAC
AACCTGAAGCGGATGGAGGACAGCGGTGTAACCATGCGGTACGCGCGCGCCGACGTCACC
AATCCGGAGCAGGTCCGGACGGCAGTCGCCGAGCTGCGCGGCGAGCTGGGTCCGATCACC
GGCGTGCTGCACGGCGCCGGACGTAACGAACCCGGGCCGTTGCATGCGTTGGAACCGGAG
GACTTCCGGCGTACCTTCGCTCCCAAGGTGGACGGCCTACGGACCGTACTCGAGGCAGTG
GACGCCGAGGAACTGAAACTGCTCGTCACGTTCGGCAGCATCATCGGCCGTGCCGGCCTG
CGGGGCGAGGCGCACTACGCCACCGCGAACGAGTGGCTGGCCGACCTCACCGAGGAGATC
GCACGCACGCACCCGCAGGTACGCGCCCGCTGCGTGGAATGGTCGGTGTGGTCCGGGGTC
GGGATGGGTGAGAAGCTCTCGGTCGTCGAGTCGCTCTCCCGCCAAGGCATCGTCCCGGTC
TCCCCGGATCAGGGGGTAGAGATCCTCCTGCGGCTGATCCGGGATCCCGACGCGCCGGTG
GTGACGGTCGTCAGCGGCCGTACCGAAGGCATCGAGACGGTGCGCCGTGACCTGCCGCCC
CTGCCGCTTCTCCGGTTCACCGGCACCCCGCTGGTGCGCTACCACGGCGTGGAGCTCGTC
ACCGAGGTCGAGCTGAACGCGGGCACGGACCCCTACCTCGGCGACCACCTGCTGGACGGC
AATCTCCTGCTGCCTGCGGTGATGGGGATGGAAGCCATGGTTCAGGTCGCGGCCGCGGCC
ACCGGCTGGCCGGGGACACCGGTCATCGAGGGCGCGCGCTTCCTGCGTCCCATCGTGGTT
CCACCCGACGGGAGCACCACCATCCGTGTCGCCGCGACGGTGACCGGACCGGACACGGTC
GACGTCGCCGTCCACGCCAGCGACACCGGATTCGCCGCAGAGCACTTCCGCGCCCGGCTG
GTGTATTCCGTCGCCGGTGTCCCGGACGGGCCGCCGCTGCAGACGGGCTCCGACACCCCG
GAAGTTCCTCTGGACCCAGCAAGCGACCTCTACGGCGGCATCCTCTTCCAGGGCTCCCGC
TTCCAGCGGTTGCGGCGATTCCACCGAATGGCGGCCCGGCACGTGGACGCCGACGTGACA
GTGCGAAGGCCGGAGGGCTGGTTCGCCGGCTTCCTCCCTGCGGAGATGCTTCTGGCCGAC
CCCGGCATGCGCGACGCGCTGATGCACGGCAACCAAGTGTGCGTGCCCGACGCCACGCTG
CTTCCTTCGGGGGTCGAGCGTGTCCACCCCCTGGGCAACAGCGGGAATGTACCCGACCAA
CTGCGTTACTGCGCGGTCGAGCGCAGCCGTGACGGCGACACATACGTGTACGACATCGCG
GTACGCGACGCCGAGGGCACCGTCGTCGAACGCTGGGAAGGTCTGACCCTGCACGCGGTG
CGCAAGACCAACGGCTCCGGCCCCTGGGTCGCGCCCCTGTTGGGACCGTACCTGGAGCGG
ACCCTCGAGGAAGTGCTCGGTGCGCACATCGCGGTGACGGTCGAACCGCACGGCGACAAC
CCGGCTGGGTCGGTCGCCGAACGTCGGGCCCTGACCACCATCGCGGCCTCCCGGACCCTC
GGGGCCGCCGTGACCGTGCGTCACCGGCCCGACGGGCGGCCGGAGGTGGATGGTGGGTGG
CACATCTCGGCCTCCCACGGCCTGGAACTCACCGTGAGCGCTGTGGCCCGGGCGGAGGTT
GCCTGTGACATAGAGGCGGTCAGCATGCGGGAGCCGAGCGAGTGGCAGGGGCTGCTCGGC
GAGTACGCCGCGGTCGCCGAACTCGTCGCCCGGGAGACCGGCGAAGCTCCCGACACGGCC
GCCACCCGGGTGTGGAGCGCGGTCGAGTGCCTGAGGAAGGCGGGCGCCATGGCGGGCACA
CCGCTGACCGTACTGCCGCAGAAGAAGGAAGCGTGGGTGGTCTTCACCGCCGGCGACCTC
CGGATCGCGACCTTCGTCACGGCCCTGCGGGACGCTCTGGAACCCGCCGTCTTCGCATTC
TTGACGCGCACACCGGAACTGCTGGAAGGACGGTCCCAGGACTATGTCGGATGA
[1] KS2..412
[1] AT619..835
[1] acetyl-CoA malonyl-CoA754..758
[1] ACP956..1057
[1] KR1237..1420
[1] DH1489..1644
[1] PPT1746..1956
[1] KS4..1236
[1] AT1855..2505
[1] acetyl-CoA malonyl-CoA2260..2274
[1] ACP2866..3171
[1] KR3709..4260
[1] DH4465..4932
[1] PPT5236..5868

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
[575-687] 7.5e-39 G3DSA:3.40.366.10 [754-862] 7.5e-39 G3DSA:3.40.366.10
G3DSA:3.40.366.10   Ac_transferase_reg
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
[974-1070] 2.6999988713206e-08 SSF47336
SSF47336   ACP_like
[975-1049] 1.9e-05 G3DSA:1.10.1200.10
G3DSA:1.10.1200.10   ACP_like
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
[1239-1419] 5.00000000000001e-36 PF08659
PF08659   KR
IPR014030 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (Domain)
[2-289] 6e-51 PF00109
PF00109   ketoacyl-synt
IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
[297-412] 2.4e-28 PF02801
PF02801   Ketoacyl-synt_C
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
[619-835] 7e-26 PF00698
PF00698   Acyl_transf_1
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
[580-861] 2.60000517657733e-42 SSF52151
SSF52151   Acyl_Trfase/lysoPlipase
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
[690-753] 1e-15 SSF55048
SSF55048   Malonyl_transacylase_ACP-bd
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
[2-125] 1.09999999999999e-61 G3DSA:3.40.47.10 [159-301] 1.09999999999999e-61 G3DSA:3.40.47.10 [302-463] 5.30000000000001e-41 G3DSA:3.40.47.10
G3DSA:3.40.47.10   Thiolase-like_subgr
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
[1-410] 4.39999001237725e-61 SSF53901
SSF53901   Thiolase-like
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[1236-1426] 8.20000000000006e-33 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Ncarz_00320 Ncarz_00320   Ncarz_00340 Ncarz_00340
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