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Nogl_00170 : CDS information

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Organism
StrainATCC 27451 (=NBRC 13445)
Entry nameNogalamycin
Contig
Start / Stop / Direction17,550 / 16,723 / - [in whole cluster]
4,913 / 4,086 / - [in contig]
Locationcomplement(16723..17550) [in whole cluster]
complement(4086..4913) [in contig]
TypeCDS
Length828 bp (275 aa)
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Category3.3 modification reduction
ProductNAD(P)H--quinone oxidoreductase
Product (GenBank)putative hydroxylase
Gene
Gene (GenBank)snoaW
EC number
Keyword
  • two-component system
  • C-1 hydroxylate
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[11683270] The entire nogalamycin biosynthetic gene cluster of Streptomyces nogalater: characterization of a 20-kb DNA region and generation of hybrid structures. (Mol Genet Genomics. , 2001)
[22633406] SnoaW/SnoaL2: a different two-component monooxygenase. (Chem Biol. , 2012)
[22633415] Discovery of a two-component monooxygenase SnoaW/SnoaL2 involved in nogalamycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2012)
comment
[PMID: 11683270](2001)
S. nogalater genomic DNA fragmentの配列解析と、異種性発現による産物解析。
nogalamycin生合成に関する20ORFsが明らかになった。

snoW: Unknown
機能不明タンパクに似ている。

---
[PMID: 22633415](2012)
Comment in [PMID: 22633406](2012)

snoaL2 または snoaWの不活化による産物解析から、1-OH化にはSnoaW/SnoaL2の両方が必要であることがわかった。

精製されたSnoaW/SnoaL2を使ったvitroでの実験、hydroperoxy intermediateの存在を確認するH2O2の検出から、

1) 非定型SDR酵素 SnoaWがmonoglycosylated anthracycline substrate(3',4'-demethoxy-nogalose-nogalamycinone) → dihydroquinoneへの還元をする

2) 酸素との反応のために基質を活性化し、hydroperoxy intermediateを形成する

3) hydroxylase SnoaL2によってプロトン化して最終産物(3',4'-demethoxy-nogalose-1-hydroxy-nogalamycinone)を得る

という新しいtwo-component monooxygenase systemを提唱している。
この反応はO2とNAD(P)Hの存在下で起こる。

SnoaWは基質としてnogalamycinone aglyconeよりmonoglycosylated anthracyclineを好むので、nogalamycin生合成におけるC-1 hydroxylationはある程度後期段階で発生する。

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selected fasta
>NAD(P)H--quinone oxidoreductase [putative hydroxylase]
MTVLVTGATGNVGRHVVTGLLAAGRRVRALTRTPDRSGLPGGAEITGGDLTRPETYERML
DGVEAVYLFPVPETAAAFAGAARRAGVRRIVVLSSDSVTDGTDTGGHRRVELAVEDTGLE
WTHVRPGEFALNKVTLWAPSIRAEGVVRSAYPDARVAPVHEADVAAVAVTALLKEGHAGR
AYSVTGPQALTQREQVRAVGEGLGRSLAFVEVTPGQARADLTAQGLPAPIADYVLAFQAG
WTERPAPARPTVREVTGRPARTLAQWAADHRADFR
selected fasta
>NAD(P)H--quinone oxidoreductase [putative hydroxylase]
ATGACAGTATTGGTAACCGGAGCCACAGGAAACGTCGGCCGGCACGTCGTCACCGGGCTA
CTGGCCGCCGGCCGCCGGGTGCGGGCGCTGACCCGCACACCCGACCGGTCCGGCCTGCCC
GGCGGCGCGGAGATCACAGGCGGCGACCTGACCCGCCCGGAGACCTACGAGCGGATGCTG
GACGGTGTCGAAGCCGTCTACCTGTTCCCCGTCCCGGAGACCGCCGCGGCGTTCGCCGGG
GCCGCGCGACGGGCCGGTGTCCGGCGGATCGTGGTGCTCTCCTCGGACTCCGTCACCGAC
GGCACCGACACCGGAGGACACCGGCGCGTGGAACTGGCCGTGGAGGACACGGGGCTCGAG
TGGACCCATGTGCGCCCCGGCGAGTTCGCGCTCAACAAGGTCACCCTGTGGGCGCCGTCG
ATCCGCGCGGAGGGCGTCGTCCGGTCCGCGTATCCGGACGCCCGGGTGGCCCCGGTGCAC
GAGGCCGACGTCGCGGCCGTCGCGGTGACCGCGCTGCTGAAGGAGGGGCACGCCGGCCGC
GCCTACAGCGTGACCGGACCGCAGGCCCTCACCCAGCGCGAACAGGTCCGCGCGGTAGGG
GAGGGGCTCGGCCGGTCCCTCGCCTTCGTCGAGGTGACCCCCGGGCAGGCGCGGGCCGAC
CTGACCGCCCAGGGGCTGCCCGCGCCCATCGCCGACTACGTCCTCGCCTTCCAAGCCGGG
TGGACCGAGCGGCCCGCCCCCGCCCGGCCGACCGTGCGGGAGGTCACCGGCCGGCCCGCC
CGCACGCTCGCCCAGTGGGCCGCCGACCACCGAGCGGACTTCCGGTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[1-206] 3.99999999999998e-39 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Nogl_00160 Nogl_00160   Nogl_00180 Nogl_00180
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