Nogl_00230 Nogl_00230   Nogl_00250 Nogl_00250

Nogl_00240 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainATCC 27451 (=NBRC 13445)
Entry nameNogalamycin
Contig
Start / Stop / Direction24,904 / 23,678 / - [in whole cluster]
12,267 / 11,041 / - [in contig]
Locationcomplement(23678..24904) [in whole cluster]
complement(11041..12267) [in contig]
TypeCDS
Length1,227 bp (408 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productputative glycosyltransferase helper protein
Product (GenBank)SnogN
Gene
Gene (GenBank)snogN
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[11683270] The entire nogalamycin biosynthetic gene cluster of Streptomyces nogalater: characterization of a 20-kb DNA region and generation of hybrid structures. (Mol Genet Genomics. , 2001)
comment
S. nogalater genomic DNA fragmentの配列解析と、異種性発現による産物解析。
nogalamycin生合成に関する20ORFsが明らかになった。

snogN: Unknown

deoxyhexose pathwayに関連があると示唆されているタンパク(AknT, DnmQ, DesVIII, EryCII)に類似。
これらはaminosugarを持つ抗生物質の生合成clusterにあるので、aminosugar生合成のときの3-keto hexose中間体の形成に関与すると示唆されている(1998年のerythromycinの論文にて)。

よって、snogNの正確な機能は不明なままだが、nogalamine生合成に関与すると示唆される。
Related Reference
ACC
Q9L4U5
NITE
Acla_00220
PmId
[15911373] AknT is an activating protein for the glycosyltransferase AknS in L-aminodeoxysugar transfer to the aglycone of aclacinomycin A. (Chem Biol. , 2005)
[17685523] Characterization of rhodosaminyl transfer by the AknS/AknT glycosylation complex and its use in reconstituting the biosynthetic pathway of aclacinomycin A. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
Blast 4th, id39%, 2e-47
Streptomyces galilaeus_aknT
AknT
[DoBISCUIT]glycosyltransferase helper protein

---
[PMID: 15911373](2005)
AknKの実験に基づき代替基質として2-deoxyfucoseを用いたAknS/Tの実験。
AknS単独でも活性はあるが、AknTがないと活性は低い。

---
[PMID: 17685523](2007)
dTDP-L-rhodosamineがAknS/AknTの自然な基質であることを確認。
これまでに代替基質として使用されていたdTDP-2-deoxyfucoseより100倍、dTDP-daunosamineより1000倍速いKcat値を示す。

partner protein AknTは、L-rhodosamine移動のためのAknSの代謝回転速度を200倍に加速する。
AknTの存在はKm値に影響せず、kcatに影響する。AknS:AknTの最適比率は1:3。

aglycone, L-rhodosamine, 2-deoxyfucose, AknS/T, AknKでの産物は2糖型aclacinomycinが主要産物でだったことから、3糖目は2-deoxyfucoseでなく、これまでの提唱通りL-rhodinoseでありそう。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative glycosyltransferase helper protein [SnogN]
MVMKLTDSELGRALLSLRGYQWLRGIHHDPYALLLRAESDDPAQLGRLLRERGRLHRSDT
GTWVTADHATASRLLADPRFVLRRPPAGPATGTGDVMPWEEATLSDLLPLDEARLTTDRA
RCRRLGATAARIAADGPVATRLADLAGARAEQVRSTGHFDLRADYALPYAVEAACALLGL
PAGQCSLFGAFSPAVLLDATVVPPRLPEARALIASTAELTALWPRLAPSLSKTVPEDEAP
DLFLLTAVLLVPAVVHLVCEAVAALSHDPGQAGLLRDDPVLAAPAVEETLRHAPPARLFT
LHATGPERVADVDLPAGAEVAVVVAAAHRDPSWCPDPDRFDLTRNERHLALPPDLPLGAL
APLLRVCATAAVAALAAGLLPLRAVGPPVRRLRAPVTRSVLRFPVAPC
selected fasta
>putative glycosyltransferase helper protein [SnogN]
ATGGTGATGAAACTGACGGACAGCGAGCTGGGGCGTGCGCTGCTCTCGCTGCGTGGTTAC
CAGTGGCTCCGCGGCATCCACCACGATCCCTACGCCCTGCTGCTGCGCGCCGAGAGCGAC
GATCCGGCGCAGCTCGGCCGGCTGCTGCGTGAACGCGGCCGGCTCCACCGCAGCGACACC
GGCACCTGGGTCACCGCGGACCATGCGACGGCCTCCCGGCTGCTCGCCGACCCGCGCTTC
GTGCTGCGCCGCCCGCCGGCCGGGCCCGCCACCGGCACCGGGGACGTCATGCCGTGGGAA
GAGGCCACGCTGAGCGACCTGCTGCCCCTCGACGAGGCGCGCCTGACGACCGACCGGGCA
CGGTGCCGCCGGCTCGGCGCGACCGCCGCGCGGATCGCGGCGGACGGTCCCGTCGCGACG
CGACTCGCGGACCTGGCCGGGGCCCGAGCCGAACAGGTGCGCTCAACGGGCCACTTCGAC
CTCAGGGCCGACTACGCCCTCCCGTACGCGGTCGAGGCGGCCTGCGCGCTGCTCGGCCTG
CCGGCCGGGCAGTGTTCCCTCTTCGGCGCCTTCTCCCCGGCCGTCCTGCTCGACGCGACG
GTCGTACCGCCCCGCCTTCCGGAGGCGCGCGCCCTGATCGCCTCCACGGCGGAACTGACC
GCCCTCTGGCCGCGGCTGGCCCCGAGCCTGTCGAAGACCGTCCCGGAGGACGAAGCGCCG
GACCTCTTCCTGCTGACGGCCGTGTTACTCGTACCGGCCGTCGTCCACCTGGTCTGCGAG
GCGGTCGCCGCCCTGTCGCACGACCCCGGGCAGGCCGGGCTGCTCAGGGACGACCCGGTA
CTCGCCGCACCGGCGGTCGAGGAGACGCTGCGCCACGCACCGCCCGCCCGTCTGTTCACC
CTCCACGCGACCGGACCGGAGCGCGTCGCGGACGTCGACCTCCCCGCGGGCGCCGAGGTC
GCCGTCGTCGTGGCGGCGGCGCACCGCGATCCCTCCTGGTGCCCGGACCCCGACCGCTTC
GACCTCACCAGGAACGAGCGGCATCTGGCACTGCCGCCGGATCTGCCGCTGGGGGCGCTC
GCCCCGCTGCTGCGCGTCTGCGCGACCGCGGCCGTCGCGGCCCTCGCGGCCGGACTCCTC
CCGCTGCGGGCCGTCGGCCCGCCCGTACGACGGCTGCGTGCCCCGGTCACCCGGTCCGTG
CTGCGCTTCCCCGTCGCCCCGTGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001128 Cytochrome P450 (Family)
[285-344] 1.1e-06 PF00067
PF00067   p450
[29-344] 2.60000517657733e-27 SSF48264
SSF48264   Cytochrome_P450
[31-348] 1.2e-30 G3DSA:1.10.630.10
G3DSA:1.10.630.10   Cyt_P450
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Nogl_00230 Nogl_00230   Nogl_00250 Nogl_00250
Page top