Nogl_00300 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces nogalater
Strain	ATCC 27451 (=NBRC 13445)
Entry name	Nogalamycin
Contig	AJ224512
Start / Stop / Direction	31,303 / 30,317 / - [in whole cluster] 2,601 / 1,615 / - [in contig]
Location	complement(30317..31303) [in whole cluster] complement(1615..2601) [in contig]
Type	CDS
Length	987 bp (328 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	putative NDP-hexose C-4 ketoreductase
Product (GenBank)	SnogG
Gene
Gene (GenBank)	snogG
EC number
Keyword	nogalamine
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC O54256 PmId [9349712] Characterization of Streptomyces nogalater genes encoding enzymes involved in glycosylation steps in nogalamycin biosynthesis. (Mol Gen Genet. , 1997) [11683270] The entire nogalamycin biosynthetic gene cluster of Streptomyces nogalater: characterization of a 20-kb DNA region and generation of hybrid structures. (Mol Genet Genomics. , 2001) comment [PMID: 9349712](1997) snoF, snoG, snoHが同定されている論文。 aclacinomycin経路でのrhodosamine and 2-deoxyfucoseの生合成ができないS.galilaeus mutant H039を、完全なsnoF,Gを含んだplasmid構成物だけが相補できた。また、snoFだけでは相補できなかった。よって、mutant H039の相補をしているのはsnoGであると推定。この論文での配列解析で述べられているのはUDP-glucose-4-epimerase = GalEへの類似性だが、[PMID: 11683270](2001)のdiscussionで訂正され、deoxysugar生合成に関連する4-ketoreductaseをコードするとされている。同時に、snoG→snogGへrenameされている。
Related Reference	ACC O33708 NITE Adria_00200 PmId [9209071] Cloning and characterization of the Streptomyces peucetius dnmZUV genes encoding three enzymes required for biosynthesis of the daunorubicin precursor thymidine diphospho-L-daunosamine. (J Bacteriol. , 1997) [10631513] A two-plasmid system for the glycosylation of polyketide antibiotics: bioconversion of epsilon-rhodomycinone to rhodomycin D. (Chem Biol. , 1999) [9447597] Production of the antitumor drug epirubicin (4'-epidoxorubicin) and its precursor by a genetically engineered strain of Streptomyces peucetius. (Nat Biotechnol. , 1998) comment Blast 5th, id53%, 3e-68 Streptomyces peucetius_dnmV Thymidine diphospho-4-keto-2,3,6-trideoxyhexulose reductase [DoBISCUIT]NDP-hexose C-4 ketoreductase -- [PMID: 9209071](1997) dnmV: 4-keto基の還元 dnmV不活化mutant産物解析と相補による回復から、daunosamine生合成に関与することは確認されている。dTDP-4-ketodeoxyhexulose ketoreductase機能の割り当ては配列解析に基づく。 -- [PMID: 10631513](1999) 異種性ホストにおけるL-daunosamineの生合成と付着のための最少の情報は、dnmLMJVUTS genesによってコードされる。 DnmVとavrE and eryBIV genesの産物は、DNR and DXRに由来する4'-epimeric anthracyclinesの合成を通して、dTDP-4-ketohexulose reductasesであることが証明されている(ref26)。 ↓そのref26 [PMID: 9447597](1998) abstract S.peucetius dnmV mutantに、Streptomyces avermitilis avrE or Saccharopolyspora eryBIV genesを異種性に導入すると、epirubicin (4'-epidoxorubicin) and 4'-epidaunorubicinを形成。 Saccharopolyspora eryBIV = dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 4-reductase

Sequence

>putative NDP-hexose C-4 ketoreductase [SnogG]
MTAGIPRTVAVVGATGCVGRHVCDAFTRAGHDVVALARRAPAGPGRHPHRFLACDPAGLA
PRDLADLFQDARVDTVVNAAGGWLNTEDDNRYHHVRLVERLLAGTALMARTPRLVQIGSV
HEYGPVPAGDAVDESREPRPVTVYARTKHAGSQAVLRATRAGDADGVVLRAVNVCGPWVT
PASFLGTVTRRLSEAAPGEPVELTLSDARRDFVDGRDLADAVLRAATRPVTGEIFNIGRG
EALPIRSLVALLLDVAGLPPGTVKERLQEVASRGGDWTRVDTRRARRLLGWRPRIDLRTS
LHDMWREALTGLPPATGSHGDGYRESAL

>putative NDP-hexose C-4 ketoreductase [SnogG]
ATGACCGCCGGGATACCGCGGACGGTGGCCGTCGTCGGCGCCACCGGCTGCGTCGGCCGG
CACGTGTGCGACGCGTTCACGCGTGCCGGACACGACGTCGTGGCCCTCGCCCGCCGCGCG
CCGGCCGGGCCCGGCCGCCACCCGCACCGGTTCTTGGCGTGCGACCCCGCCGGGCTCGCC
CCGCGCGACCTCGCGGACCTCTTCCAGGACGCGCGCGTCGACACCGTCGTCAACGCCGCC
GGCGGCTGGCTGAACACGGAGGACGACAACCGCTACCACCATGTGCGGCTGGTCGAGCGG
CTGCTGGCGGGGACGGCCCTGATGGCGCGGACCCCGAGGCTGGTGCAGATCGGCTCCGTC
CACGAGTACGGGCCCGTCCCCGCCGGCGACGCCGTCGACGAGAGCCGCGAACCACGCCCG
GTGACGGTGTACGCCCGCACCAAGCACGCGGGCTCCCAGGCCGTACTGCGCGCCACGCGG
GCCGGGGACGCCGACGGGGTCGTGCTGCGGGCCGTGAACGTGTGCGGCCCGTGGGTCACC
CCGGCGAGCTTTCTCGGTACGGTGACGCGCCGGCTGAGCGAGGCCGCGCCGGGAGAGCCG
GTGGAACTCACCCTCAGCGACGCGCGACGGGACTTCGTGGACGGGCGCGACCTCGCCGAT
GCGGTCCTACGGGCCGCGACCCGCCCGGTCACCGGCGAGATCTTCAACATCGGACGCGGT
GAGGCCCTGCCGATCCGCTCCCTCGTCGCACTGCTGCTCGACGTGGCGGGGCTGCCCCCC
GGCACCGTGAAGGAGCGCCTCCAGGAGGTCGCCTCACGGGGCGGCGACTGGACGCGGGTC
GACACCCGGCGCGCGCGGCGGCTGCTGGGCTGGCGTCCTCGCATCGATCTGCGCACCTCT
CTGCACGACATGTGGCGCGAGGCCCTGACGGGCCTGCCGCCGGCGACCGGCTCGCACGGC
GACGGCTATCGGGAGTCAGCCTTATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001509 NAD-dependent epimerase/dehydratase (Domain) PF01370 Epimerase IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain) G3DSA:3.40.50.720 NAD(P)-bd
SignalP	Bacteria, Gram-positive Eukaryota
TMHMM	No significant hit

Nogl_00290 Nogl_00310