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Ovied_00195 : CDS information

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Organism
StrainATCC 11891
Entry nameOviedomycin
Contig
Start / Stop / Direction19,956 / 20,165 / + [in whole cluster]
19,956 / 20,165 / + [in contig]
Location19956..20165 [in whole cluster]
19956..20165 [in contig]
TypeCDS
Length210 bp (69 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Productacyl-CoA carboxylase epsilon subunit
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)ovmI
EC number6.4.1.-
Keyword
  • malonyl-CoA
Note
Note (GenBank)
Reference
PmId
[24148183] Engineering precursor metabolite pools for increasing production of antitumor mithramycins in Streptomyces argillaceus. (Metab Eng. , 2013)
comment
mithramycin産生改善を目的とした論文。
mithramycinのpolyketide aglyconeはmalonyl-CoAを縮合して形成される。そのため、malonyl-CoAを合成するacetyl-CoA carboxylase(ACC)を過剰発現することでmalonyl-CoAの細胞内プールを増やし、mithramycin産生を拡大しようとした。

oviedomycin gene clusterは、ACCのβ- and α-chainsにとても似たタンパクをコードする2つの遺伝子(ovmG and ovmH)を含むことがわかっている。oviedomycin DNA配列のより深い解析から、ACCのputative ε-chainをコードするだろう3つめの遺伝子の存在がovmGとovmHの間に示され、ovmI と名付けられた。これら3つの遺伝子は近接していて同じ向きで転写されるので、ACCを過剰産生するために使用された。

mithramycin産生株S. argillaceusでのovmGIHの過剰発現は、malonyl-CoAの細胞内濃度の増加と、早期発酵時間でのacetyl-CoAプールの減少を導いたので、acetyl-CoA→malonyl-CoAへの進行性の変換と、ovmGIHがactive ACCをコードしたことを示す。

ovmGIHの過剰発現株は、発酵4日目以降にコントロール株より高い量のmithramycinを産生した。
Related Reference
ACC
O86518
PmId
[11526020] Role of an essential acyl coenzyme A carboxylase in the primary and secondary metabolism of Streptomyces coelicolor A3(2). (Appl Environ Microbiol. , 2001)
[12048195] Kinetic and structural analysis of a new group of Acyl-CoA carboxylases found in Streptomyces coelicolor A3(2). (J Biol Chem. , 2002)
comment
BLAST id45%
Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145)_SCO5536
Uncharacterized protein

AccEに相当するエントリー。

---
[PMID: 11526020](2001)
accB and accEをクローニング、E.coliで発現し、biotinylated protein AccA1 or AccA2の存在下で酵素活性の再構成を確認。

AccEが追加で存在すると酵素複合体の活性をかなり拡大するので、この小さなpolypeptideがacyl-CoA carboxylaseの機能的な要素であると示唆される。

---
[PMID: 12048195](2002)
S. coelicolor由来の2つのacyl-CoA carboxylasesのコンポーネントを精製し、再構成することに成功した。両複合体は同じbiotinylated alpha subunit AccA2を共有するが、beta and epsilon subunitsはそれぞれに特異的だった。

propionyl-CoA carboxylase complexでは PccB and PccE
acetyl-CoA carboxylase complexでは AccB and AccE

2つの複合体は対応するepsilon subunitsなしだと活性がとても低く、PccE or AccEの追加で酵素の特異的活性を劇的に増やした。

両酵素のためにepsilon subunitsがcarboxyltransferase componentと特異的に相互作用し、beta-epsilon subcomplexを形成することがわかった。

close this sectionSequence

selected fasta
>acyl-CoA carboxylase epsilon subunit
MSTTEPLFRIVRGQADAEELAALTAVLTVLAQRAGASAEPAAPRPAAARWFRLERNAGFL
ASHSWQTAS
selected fasta
>acyl-CoA carboxylase epsilon subunit
ATGAGCACCACTGAGCCCCTCTTCCGGATCGTCCGGGGACAGGCCGACGCCGAGGAACTC
GCCGCCCTGACGGCCGTACTGACCGTGCTCGCGCAGCGGGCGGGCGCCTCGGCGGAACCG
GCCGCCCCGCGTCCGGCGGCCGCGCGCTGGTTCCGGCTGGAGCGCAACGCCGGATTCCTG
GCCTCGCACAGCTGGCAGACCGCCTCGTAG

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0 		No significant hit
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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