Oxzol_00080 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces albus
Strain	JA3453
Entry name	Oxazolomycin
Contig	EF552687
Start / Stop / Direction	15,549 / 14,449 / - [in whole cluster] 15,549 / 14,449 / - [in contig]
Location	complement(14449..15549) [in whole cluster] complement(14449..15549) [in contig]
Type	CDS
Length	1,101 bp (366 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	glyceroyl-ACP biosynthesis protein 1,3-bisphospho-D-glycerate phosphatase/glyceroyltransferase
Product (GenBank)	glyceroyl transferase/phosphatase
Gene
Gene (GenBank)	ozmB
EC number
Keyword	methoxymalonyl-ACP
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q1G727 PmId [16707707] Utilization of the methoxymalonyl-acyl carrier protein biosynthesis locus for cloning the oxazolomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces albus JA3453. (J Bacteriol. , 2006) [16895402] The bifunctional glyceryl transferase/phosphatase OzmB belonging to the HAD superfamily that diverts 1,3-bisphosphoglycerate into polyketide biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2006) [20406823] Oxazolomycin biosynthesis in Streptomyces albus JA3453 featuring an "acyltransferase-less" type I polyketide synthase that incorporates two distinct extender units. (J Biol Chem. , 2010) comment [PMID:16707707] methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子の同定とクローニング OzmB, OzmC, OzmD, OzmE, OzmF, and OzmGが、methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子であることを同定し、これらがoxazolomycin productionに必須であることを示した。 [PMID:16895402] OzmB機能解析 OzmBは、まずD-3-phosphoglyceryl-S-OzmB中間体を形成するため、glycolytic poolからD-1,3-bisphosphoglycerateを隔離し、それからD-3-glyceryl-S-OzmB種を産出するためリン酸基を除去する（phosphataseとして働く）、そして最後にpolykeide生合成のためのステージをセットするためACPにglycoryl基を移動する（glyceryl transferaseとして働く）ことが実証された。・D-3-phosphoglycerate, ATP, Mg2+, and D-3-phosphoglycerate kinaseとOzmBのインキュベーションは、glyceryl-S-OzmBをもたらすことを質量分析で確認。・OzmBのglycerate付着部位はC(266)-R-V-V(270). ・tautomycin生合成gene cluster由来TtmDのholo-ACP変換型とglyceryl-S-OzmBからglyceryl-S-TtmDをもたらすので、glyceryl-S-OzmBはACPの4'-Ppant部分の-SH基へglycerylを移動できる。・脱リン酸化に重要であるaspartateを変異したOzmB(D14V)はD-3-phosphoglyceryl-S-OzmBをもたらし、phosphatase活性が廃止されている。 [PMID: 20406823] oxazolomycin生合成遺伝子クラスターの報告。 methoxymalonyl-ACP生合成経路として、OzmB(bifunctional glyceryl transferase/phosphatase)が捕捉され、1,3-bisphospho-D-glycerateが脱リン化すると予測されている(FIGURE 3)
Related Reference	ACC Q8KUG4 NITE Ansam_00180 PmId [11996558] Functional expression of genes involved in the biosynthesis of the novel polyketide chain extension unit, methoxymalonyl-acyl carrier protein, and engineered biosynthesis of 2-desmethyl-2-methoxy-6-deoxyerythronolide B. (J Am Chem Soc. , 2002) [17076505] On the biosynthetic origin of methoxymalonyl-acyl carrier protein, the substrate for incorporation of "glycolate" units into ansamitocin and soraphen A. (J Am Chem Soc. , 2006) comment Blast 15th, id66%, 1e-100 Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum_asm16 Putative uncharacterized protein asm16 -- [PMID: 11996558](2002) S. lividansで、AT domainsのひとつがmethoxymalonateに特異的なATで置換されているerythromycin PKSのカセットとasm13-17を同時発現すると、予測された位置にmethoxymalonateが取り込まれた6- deoxyerythronolide Bの派生体が産生された。よって、asm13-17はmethoxymalonyl-ACP生合成に十分である。 -- [PMID: 17076505](2006) ansamitocin producerであるActinosynnema pretiosumと、soraphen producerであるSorangium cellulosumを使った追加のfeeding実験。ラベルした基質を用いた実験に基づき、1,3-bisphospho-D-glycerateからmehoxymalonyl-ACPが合成されると結論付けている。 methoxymalonyl-ACP生合成のproposed pathway: 1,3-bisphospho-D-glycetateは、Asm16によってACP(Asm14)のthiol基(-SH)へ移される。その結果できた 3-phosphoglyceryl-ACPのphosphate ester基の切断もまた、Asm16によって触媒されるかもしれない。その理由→Asm16はタンパクレベルで少なくとも25-30%の相同性を aspartate-dependent hydrolasesのHAD superfamilyのIIIC subgroup(interpro IPR010033)のメンバーに示す。これらの酵素の多くの機能は不明だが、HAD III subfamilyの特徴付けられたメンバーは明らかに大きな基質(phosphorylated proteins)を使うphosphatases（脱リン酸化酵素）である。よってAsm16によって1,3-bisphospho-D-glycetate→glyceryl-ACPが形成される。

Sequence

>glyceroyl-ACP biosynthesis protein [glyceroyl transferase/phosphatase]
MKRVTEARPTIKCLVWDLDNTLWRGTLVEDGEVVLHEGLREVIVELDSRGILQAIASRND
HDHAWALLEKLGIAEYFVLPRINWGAKSASVRAIADELNFAPSTIAFIDDQPAERAEVAF
HLPEVRCYPAEEALGLPGLAEFTPAAVTGDARRRRQMYQAGVRREAERTEHVGTDEEFLR
SLGLELRIERAGDEAISRVEELTLRTSQMNATGVHYSDRALRGLVADEEHEVLVASLVDR
FGPHGAIGVILLERRPRSWHIKLLATSCRVVSFGVGAALLRWLSDEAARAGVLLTAGFRR
TERNRMMEVAYRFAGFREHTEGAAEEGGVQTLAMEPVRQDAPAHLAVLAPRLFDASPGLV
EWAHAE

>glyceroyl-ACP biosynthesis protein [glyceroyl transferase/phosphatase]
GTGAAGCGGGTGACCGAAGCACGGCCGACGATCAAATGCCTGGTCTGGGACCTGGACAAC
ACGCTGTGGCGCGGCACGCTGGTGGAGGACGGCGAGGTCGTCCTCCACGAGGGCCTGCGC
GAGGTGATCGTCGAACTGGACTCGCGCGGCATCCTCCAGGCGATCGCCAGCCGGAACGAC
CACGACCACGCCTGGGCGCTCCTGGAGAAGCTCGGGATCGCCGAGTACTTCGTGCTGCCG
CGCATCAACTGGGGCGCCAAGTCGGCCTCCGTACGGGCCATCGCCGACGAGCTGAACTTC
GCGCCGTCGACGATCGCCTTCATCGACGACCAGCCCGCCGAGCGCGCGGAGGTGGCGTTC
CATCTGCCCGAGGTGCGCTGCTACCCGGCGGAGGAGGCCTTGGGCCTGCCCGGGCTCGCG
GAGTTCACCCCGGCCGCCGTCACCGGCGACGCGCGCAGACGGCGGCAGATGTACCAGGCC
GGAGTGCGGCGGGAGGCGGAGCGCACCGAGCACGTCGGCACCGACGAGGAGTTCCTGCGC
TCGCTCGGCCTGGAGCTGCGCATCGAGCGCGCCGGTGACGAGGCGATCTCCCGGGTCGAG
GAGCTGACCCTGCGCACCAGCCAGATGAACGCGACGGGCGTGCACTACAGCGACCGTGCC
CTGCGCGGACTGGTGGCCGACGAGGAGCACGAGGTGCTCGTCGCCTCGCTCGTCGACCGC
TTCGGCCCGCACGGCGCGATCGGCGTGATCCTGCTGGAGCGGCGTCCGCGCTCCTGGCAC
ATCAAGCTGCTCGCGACCTCGTGCCGCGTGGTGTCCTTCGGGGTGGGGGCGGCGCTGCTG
CGCTGGCTCTCCGACGAGGCCGCCCGGGCGGGGGTCCTGCTGACCGCGGGGTTCCGGCGC
ACCGAACGCAATCGCATGATGGAGGTCGCCTACCGCTTCGCGGGTTTTCGGGAGCACACG
GAAGGGGCGGCGGAGGAGGGCGGTGTGCAGACGCTGGCCATGGAACCCGTCCGGCAGGAC
GCCCCCGCTCATCTGGCCGTGCTGGCGCCGCGCCTGTTCGATGCCTCACCCGGGCTCGTC
GAGTGGGCGCACGCCGAGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR010033 HAD-superfamily phosphatase, subfamily IIIC (Domain) TIGR01681 HAD-SF-IIIC IPR010037 FkbH domain (Domain) TIGR01686 FkbH IPR016181 Acyl-CoA N-acyltransferase (Domain) G3DSA:3.40.630.30 Acyl_CoA_acyltransferase IPR023214 HAD-like domain (Domain) G3DSA:3.40.50.1000 HAD-like_dom SSF56784 HAD-like_dom
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Oxzol_00070 Oxzol_00090