Tauto_00160 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces spiroverticillatus
Strain
Entry name	Tautomycin
Contig	EF990140
Start / Stop / Direction	81,858 / 81,604 / - [in whole cluster] 81,858 / 81,604 / - [in contig]
Location	complement(81604..81858) [in whole cluster] complement(81604..81858) [in contig]
Type	CDS
Length	255 bp (84 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative acyl carrier protein
Product (GenBank)	acyl-carrier protein
Gene
Gene (GenBank)	ttmD
EC number
Keyword	methoxymalonyl-ACP
Note
Note (GenBank)	ACP; methoxymalonyl-ACP biosynthesis protein
Reference	ACC C0SMW9 PmId [18708355] Characterization of the tautomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces spiroverticillatus unveiling new insights into dialkylmaleic anhydride and polyketide biosynthesis. (J Biol Chem. , 2008) [16707708] Utilization of the methoxymalonyl-acyl carrier protein biosynthesis locus for cloning of the tautomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces spiroverticillatus. (J Bacteriol. , 2006) comment [PMID: 18708355](2008) tautomycin (TTM) biosynthetic gene clusterについての文献。 ttmD(84a.a.): acyl carrier protein ttmD の機能実験は無い。 [PMID: 16707708](2006) methoxymalonyl-ACP biosynthesis locusであると予想されるlocusに関する文献。 ttmD自体の具体的な機能実験は無いが、相同性検索よりacyl carrier proteinをエンコードしているとしている。
Related Reference	ACC Q8KUG2 NITE Ansam_00160 PmId [11960423] Identification of a set of genes involved in the formation of the substrate for the incorporation of the unusual "glycolate" chain extension unit in ansamitocin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2002) [11996558] Functional expression of genes involved in the biosynthesis of the novel polyketide chain extension unit, methoxymalonyl-acyl carrier protein, and engineered biosynthesis of 2-desmethyl-2-methoxy-6-deoxyerythronolide B. (J Am Chem Soc. , 2002) comment 11th(Q8KUG2) 62%, 1e-18 Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum_asm14 Acyl carrier protein --- [PMID:11960423](2002) CoAの代わりにSNACを使い13C-labelした2-hydroxymalonyl-SNAC or 2-methoxymalonyl-SNACを用いて取り込みを測定。側鎖前駆体isobutyrateと共にA. pretiostmz ATCC 31565に与えたが、ansamitocin P-3での同位体濃縮はなかった。したがって珍しいunitによる3つめの鎖伸長stepは、2-hydroxymalonyl-CoA or 2-methoxymalonyl-CoAを基質として使用しない。珍しい伸長unitの合成に関連しそうなsubclusterにはACPであると予測されるORFが含まれた。これをコードするasm14を不活化するとansamitocin産生や新規化合物蓄積ができなかった。よって鎖伸長反応の基質は、おそらく2-hydroxy- or 2-methoxymalonyl-ACPである。また、asm15 mutantでは珍しい伸長unitの代わりにmalonate unitを取り込んだ10-desmethoxy-ansamitocin P-3が見られた。asm14 mutantではこの化合物が検出されなかったので、asm14によってコードされるACPはmalonateの異常な取り込みにも必要である。これは機能的に能力のある立体構造でPKSを維持するため、またはPKSのAT3にmalonateを実際に運搬するためと考えられる。 --- [PMID:11996558](2002) abstract S. lividansで、AT domainsのひとつがmethoxymalonateに特異的なATで置換されているerythromycin PKSのカセットとasm13-17を同時発現すると、予測された位置にmethoxymalonateが取り込まれた6-deoxyerythronolide Bの派生体が産生された。よって、asm13-17はmethoxymalonyl-ACP生合成に十分である。また、methyltransferaseをコードするasm17を削除すると、そのhydroxy類似体ではなく6-deoxyerythronolide Bが得られたので、伸長unitのmethylationはその取り込みのために必要である。
Family/Domain	FD IPR009081 comment [IPR009081] Acyl carrier protein-like (Domain)

Sequence

>putative acyl carrier protein [acyl-carrier protein]
MKTSSEPVAEHVQAFLAERTRQTWARDTDLFATGGLSSMFAMELVVHLESTFDIVIAGPD
LALDNFRTVDAMTALVLRLREAER

>putative acyl carrier protein [acyl-carrier protein]
GTGAAGACATCCTCCGAGCCGGTGGCCGAGCACGTGCAGGCGTTCCTCGCCGAGCGCACC
AGGCAGACCTGGGCGCGGGACACGGACCTGTTCGCCACCGGCGGCCTGTCGTCCATGTTC
GCCATGGAGCTCGTGGTGCACCTGGAGTCCACTTTCGACATCGTGATCGCCGGTCCGGAT
CTCGCACTGGACAACTTCCGCACCGTCGACGCCATGACCGCGCTGGTGCTGCGGCTGCGG
GAAGCCGAGCGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain) G3DSA:1.10.1200.10 ACP_like SSF47336 ACP_like PF00550 PP-binding
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

Tauto_00150 Tauto_00170