Tetrn_00050 Tetrn_00050   Tetrn_00070 Tetrn_00070

Tetrn_00060 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 11266
Entry nameTetronomycin
Contig
Start / Stop / Direction6,469 / 7,347 / + [in whole cluster]
6,469 / 7,347 / + [in contig]
Location6469..7347 [in whole cluster]
6469..7347 [in contig]
TypeCDS
Length879 bp (292 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Productputative acyltransferase
Product (GenBank)putative 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase
Gene
Gene (GenBank)tmn7
EC number
Keyword
  • glyceroyl-CoA
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[18404760] Analysis of the tetronomycin gene cluster: insights into the biosynthesis of a polyether tetronate antibiotic. (Chembiochem. , 2008)
comment
Streptomyces sp. NRRL 11266におけるtetronomycin (TMN) gene clusterに関する文献。

tmn7(292 aa): pyruvate/2-oxoacid dehydrogenases

tmn7の不活化変異株ではTMN生産が消失することが示され、相同性より機能を予測している。
Related Reference
ACC
Q0R4L6
NITE
Chth_00380
PmId
[16793515] Genetic characterization of the chlorothricin gene cluster as a model for spirotetronate antibiotic biosynthesis. (Chem Biol. , 2006)
comment
Blast 7th, id61%, 1e-71
Streptomyces antibioticus
ChlD3
[Chth_00380]putative acyltransferase

chlorothricin(CHL) gene clusterに関する文献。
chlD3(271 aa): pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase/dehydratase

chlD3変異株ではCHL生産が消失すること、chlD3遺伝子を相補することでCHL生産が回復することを確認しており、chlD3はCHL生産に必須であることを示している。また、相同性より2,3-dehydratationを行いenoylpyruvoyl-S-ACPを生じるputative dehydrataseであるとしている。
ACC
B5L6L6
PmId
[18586939] Cloning and characterization of the tetrocarcin A gene cluster from Micromonospora chalcea NRRL 11289 reveals a highly conserved strategy for tetronate biosynthesis in spirotetronate antibiotics. (J Bacteriol. , 2008)
comment
Blast 8th, id58%, 3e-64, N末部分hit
Micromonospora chalcea
2-oxoacid dehydrogenase/acyltransferase

このentryはtcaD3に相当。
tcaD1-D4はtetronate部分の形成にユニークな遺伝子セットであると提唱される。

chlD3不活化株、chlD4不活化株は、tcaD3によって相補され、chlorothricin(CHL)産生を回復する。
Kijanimicin生合成に関する論文での提唱(配列解析)から、TcaD3のN末部分はglyceroyl-TcaD2(ACP)からCoAへglyceroyl基を移し、glyceroyl-CoAを形成するとされている。

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selected fasta
>putative acyltransferase [putative 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase]
MSVARFPAERRHTLYHCDEIRETAPVFLDTEVDMSRVQEHRAAARHDGRRYSVVSYVLRA
SGSVLARHPDANAAIRGRLRPKVARYATVGGKVTLDKTLGGRRVVLSSVVPGLERSSLDD
VQQHVDRLRDGDPESMPEFEAVRKLHRLPVPVGRTLFRLATRSFAHRPELRGTVAVTSLG
HRAVDSFHSVGGTTVTLGLGRIVDRPVVRDGAVAVAPVMRLSLAFDHRVIDGAEAADVLS
ELKDFLEAYGPEAAPEAAGAGETASAGEPAAREEAVHEAVDARDPASPAPGP
selected fasta
>putative acyltransferase [putative 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase]
GTGAGCGTCGCCCGCTTCCCCGCCGAGCGCCGCCACACGCTCTACCACTGCGACGAGATA
CGGGAGACGGCGCCGGTCTTCCTCGACACCGAGGTGGACATGAGCCGGGTGCAGGAGCAC
CGGGCGGCCGCCCGGCACGACGGCCGCCGGTACTCGGTCGTCTCGTACGTCCTGCGCGCC
TCCGGCAGCGTGCTGGCCCGGCACCCGGACGCCAACGCGGCCATCCGCGGCCGGCTCCGC
CCCAAGGTCGCGCGCTACGCGACCGTCGGCGGCAAGGTGACGCTCGACAAGACGCTGGGC
GGGCGCCGCGTGGTGCTGTCCTCCGTCGTGCCGGGGCTGGAGCGGTCGAGCCTGGACGAC
GTGCAGCAGCACGTGGACCGGCTGCGCGACGGAGACCCCGAGTCCATGCCGGAGTTCGAG
GCGGTCCGCAAGCTGCACCGGCTGCCCGTGCCCGTCGGCCGCACCCTGTTCCGGCTGGCG
ACGCGGTCGTTCGCGCACCGCCCGGAGCTGCGGGGCACCGTGGCCGTCACCTCGCTGGGC
CACCGCGCGGTGGACAGCTTCCATTCGGTCGGCGGCACGACGGTCACGCTGGGCCTCGGG
CGGATCGTCGACCGCCCGGTGGTCCGGGACGGCGCCGTCGCCGTGGCGCCGGTGATGCGC
CTGAGCCTCGCCTTCGACCACCGGGTGATCGACGGGGCGGAGGCGGCCGACGTGCTGTCC
GAGCTGAAGGACTTCCTGGAGGCGTACGGGCCGGAGGCCGCCCCCGAGGCGGCAGGCGCC
GGGGAGACGGCCTCCGCCGGGGAGCCCGCTGCCCGGGAGGAGGCCGTGCACGAGGCGGTC
GACGCCCGCGACCCGGCCTCGCCCGCCCCGGGGCCCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001078 2-oxoacid dehydrogenase acyltransferase, catalytic domain (Domain)
[171-248] 1.3e-17 PF00198
PF00198   2-oxoacid_dh
IPR023213 Chloramphenicol acetyltransferase-like domain (Domain)
[20-248] 1e-35 G3DSA:3.30.559.10
G3DSA:3.30.559.10   CAT-like_dom
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Tetrn_00050 Tetrn_00050   Tetrn_00070 Tetrn_00070
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