Tetrn_00220 Tetrn_00220   Tetrn_00240 Tetrn_00240

Tetrn_00230 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 11266
Entry nameTetronomycin
Contig
Start / Stop / Direction88,691 / 89,728 / + [in whole cluster]
88,691 / 89,728 / + [in contig]
Location88691..89728 [in whole cluster]
88691..89728 [in contig]
TypeCDS
Length1,038 bp (345 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Producthypothetical protein
Product (GenBank)putative hydrolase or acyltransferase
Gene
Gene (GenBank)tmn17
EC number
Keyword
  • glyceroyl-CoA
Note
Note (GenBank)
  • alpha/beta-hydrolase superfamily
Reference
ACC
PmId
[18404760] Analysis of the tetronomycin gene cluster: insights into the biosynthesis of a polyether tetronate antibiotic. (Chembiochem. , 2008)
comment
Streptomyces sp. NRRL 11266におけるtetronomycin (TMN) gene clusterに関する文献。

tmn17(345 aa): putative hydrolase or acyltransferase

tmn17の不活化変異株ではTMN生産が消失することが示されている。
また、相同性よりputative hydrolase or acyltransferaseと予測している。
Related Reference
ACC
B3TMQ0
PmId
[17985890] Elucidation of the kijanimicin gene cluster: insights into the biosynthesis of spirotetronate antibiotics and nitrosugars. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
Blast 2nd, id51%, 3e-87, C末部分hit
Actinomadura kijaniata_KijE
Hydrolase superfamily dihydrolipoamide acyltransferase-like protein

KijEのC末はcatalytic triad (S457, D544, H571)を保存することから、ester, thioester, or amide groupを加水分解する多くの酵素を含むalpha/beta hydrolase superfamilyのメンバーであると予測される。
よって、KijEのC末domainは5員環lactone中間体を形成し、ACPからpolyketideを放出しそうだ。
ACC
B5L6L6
PmId
[18586939] Cloning and characterization of the tetrocarcin A gene cluster from Micromonospora chalcea NRRL 11289 reveals a highly conserved strategy for tetronate biosynthesis in spirotetronate antibiotics. (J Bacteriol. , 2008)
comment
Blast 3rd, id50%, 5e-83, C末部分hit
Micromonospora chalcea
2-oxoacid dehydrogenase/acyltransferase

このentryはtcaD3に相当。
tcaD1-D4はtetronate部分の形成にユニークな遺伝子セットであると提唱される。

chlD3不活化株、chlD4不活化株は、tcaD3によって相補され、chlorothricin(CHL)産生を回復する。
Kijanimicin生合成に関する論文での提唱(配列解析)から、TcaD3のC末部分は分子内環化とACPからの放出を担うthioesteraseであるとされる。
ACC
Q0R4L5
NITE
Chth_00390
PmId
[16793515] Genetic characterization of the chlorothricin gene cluster as a model for spirotetronate antibiotic biosynthesis. (Chem Biol. , 2006)
comment
Blast 5th, id48%, 2e-81
Streptomyces antibioticus
ChlD4

chlorothricin(CHL) gene clusterに関する文献。

chlD4(362 aa): predicted hydrolases or acyltransferases

相同性より、hydrolaseもしくはacyltransferaseであるとしており、chlD4 変異株ではCHL生産が消失すること、chlD4遺伝子を相補することでCHL生産が回復することを確認している。ChlD4はenoylpyruvoyl-S-ACPをCHL aglyconeに導入する機能を持つことを推測している。

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selected fasta
>hypothetical protein [putative hydrolase or acyltransferase]
MNDVTELKEFARVHAKALQLPAERYDEVLAGITSDEDGAPGSWTAQWSAMAGELEDAGEL
LPAFLCYTLARFPVVDGPARQAAYQKCRSVFDRWRAGQPDIQRVTASPAGREVVAWAGGL
SAAEPKPVLMVAGGIVSLKEQWAPVTLQAAALGMAIVVTELPGVGENTLPYDREGWRMLP
ALLDAVADRADVSDTYALANSFGGHLALRWAGHDARVRGIVSSGAPVSGFFGDADWLRGV
PGITRHTLARLAGAPEGDDDALHKKIADWALTPAELAGLEIPVRYSTSLRDEIIPAGEAA
FLQQHVKDLGLNEIDDVHGAPAHVQQTVDWTFGSLLAMRQGLAPS
selected fasta
>hypothetical protein [putative hydrolase or acyltransferase]
ATGAACGACGTCACCGAGCTCAAGGAGTTCGCGCGCGTCCACGCCAAGGCGCTGCAACTG
CCCGCCGAGCGGTACGACGAGGTGCTCGCCGGCATCACCAGCGACGAGGACGGCGCCCCC
GGCTCGTGGACGGCCCAGTGGTCGGCGATGGCCGGGGAGCTGGAGGACGCCGGAGAGCTG
CTGCCGGCGTTCCTCTGCTACACCCTGGCCCGCTTCCCCGTCGTCGACGGGCCGGCGCGG
CAGGCGGCGTACCAGAAGTGCCGGTCGGTGTTCGACCGCTGGCGCGCCGGCCAGCCGGAC
ATCCAGCGGGTGACGGCGTCGCCGGCCGGCCGCGAGGTGGTGGCCTGGGCCGGCGGGCTG
TCTGCCGCGGAGCCCAAGCCGGTGCTGATGGTGGCGGGCGGCATCGTGAGCCTCAAGGAG
CAGTGGGCGCCGGTCACGCTCCAGGCGGCGGCGCTCGGGATGGCCATCGTGGTCACCGAG
CTGCCCGGCGTGGGCGAGAACACCCTCCCGTACGACCGCGAGGGCTGGCGGATGCTGCCC
GCCCTGCTGGACGCGGTCGCGGACCGGGCGGACGTGTCCGACACGTACGCCCTCGCGAAC
AGCTTCGGCGGGCACCTGGCGCTGCGCTGGGCCGGGCACGACGCCCGGGTGCGCGGCATC
GTGTCGTCGGGTGCGCCGGTCAGCGGGTTCTTCGGCGACGCCGACTGGCTGCGCGGCGTG
CCGGGCATCACCCGGCACACGCTGGCCCGGCTGGCGGGTGCGCCCGAGGGGGACGACGAC
GCGCTGCACAAGAAGATCGCCGACTGGGCGCTGACGCCCGCGGAGCTGGCCGGGCTGGAG
ATCCCGGTCCGGTACTCGACCAGCCTGCGCGACGAGATCATCCCGGCCGGGGAAGCGGCG
TTCCTCCAGCAGCACGTGAAGGACCTCGGCCTGAACGAGATCGACGACGTGCACGGCGCT
CCGGCGCACGTGCAGCAGACCGTGGACTGGACGTTCGGCTCGCTGCTGGCGATGCGTCAG
GGCCTCGCCCCCAGCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0 		No significant hit
SignalP
[1-30] 0.044 Signal
Eukaryota   
TMHMM No significant hit
Tetrn_00220 Tetrn_00220   Tetrn_00240 Tetrn_00240
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