Actino_00140 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces coelicolor
Strain	A3(2) (=NBRC 15146)
Entry name	Actinorhodin
Contig	M64683
Start / Stop / Direction	12,153 / 13,889 / + [in whole cluster] 1,083 / 2,819 / + [in contig]
Location	12153..13889 [in whole cluster] 1083..2819 [in contig]
Type	CDS
Length	1,737 bp (578 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	drug resistance transporter
Product (GenBank)
Gene	actII-ORF2 actA
Gene (GenBank)	actII
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	ORF2
Reference	ACC P46105 PmId [1878971] The act cluster contains regulatory and antibiotic export genes, direct targets for translational control by the bldA tRNA gene of Streptomyces. (Cell. , 1991) [8636024] Production of actinorhodin-related "blue pigments" by Streptomyces coelicolor A3(2). (J Bacteriol. , 1996) [17644591] Investigation of transcription repression and small-molecule responsiveness by TetR-like transcription factors using a heterologous Escherichia coli-based assay. (J Bacteriol. , 2007) [17338074] Initiation of actinorhodin export in Streptomyces coelicolor. (Mol Microbiol. , 2007) [23073761] A two-step mechanism for the activation of actinorhodin export and resistance in Streptomyces coelicolor. (MBio. , 2012) comment [PMID: 1878971](1991) actinorhodin biosynthetic gene clusterのactII領域の解析論文。 ActII-ORF2は、排出によって抵抗性を与える膜貫通タンパクに似ている。 TMSs=13 actII-ORF1, actII-ORF2, or actII-ORF3の破壊はactinorhodin生合成を妨げない。 actII-ORF2/ORF3 mutationsは（たぶん酸性型の）抗生物質を細胞内に蓄積し、抗生物質排出が妨げられている。確認しているのは青色色素として。 -- [PMID: 8636024](1996) double actII-ORF2/3 mutantはactinorhodin関連物質の細胞外排出が阻害される。 actII-ORF3 mutantは細胞外排出を阻害しないので、actII-ORF2が細胞外排出に不可欠。 actVA-ORF1 and actII-ORF2によってコードされるputative membrane proteinsはどちらも単独では青色色素排出できないので、これらは排出複合体の一部を形成するかもしれない。 -- [PMID: 17644591](2007) E.coli-based biosensorsを開発し、DNAと小分子リガンドとの相互作用の調査に使用。 ActRはactII-ORF2(actA)の発現を抑制する。 actII-ORF2(actA)のオペレーター_OactはActRと特異的に結合。 ActRはactinorhodinと関連分子と相互作用する。 -- [PMID: 17338074](2007) tetAを抑制するTetRのように、ActRはactAのrepressorである。 actinorhodin生合成経路の中間体である(S)-DNPAと、中間体dihydrokalafunginに関連した分子kalafunginが、特に強力なActR ligandsであり、ActRによる抑制を軽減する。 -- [PMID: 23073761](2012) ActII-ORF2 (ActA) and ActII-ORF3 (ActB)はactAB operonを形成し、2つのputative export pumpsをコードする。普通のactinorhodin収量を得るにはactAB発現が必要。 actinorhodin生合成経路の3環中間体は生合成初期にactAB発現を十分なレベルで活性化する。これらの結果からactinorhodin export and resistanceのためのtwo-step modelを提唱。 3環中間体はactinorhodin産生初期のactAB発現を誘導して、自己防衛のためのpumpsを確実にする。このactAB発現は維持されず、時間と共に薄れる。その後、主にactinorhodin自身によって高レベル維持のactAB発現を導く。 (actAB発現の活性化は、actinorhodin or 中間体がrepressor ActRに結合することによる抑制の解除による。) proteins ActA, -B, and -Cのどれも実際にactinorhodin exportersであることを示す具体的なデータはない。(ActCがどのgeneを示すのか不明）

Sequence

>drug resistance transporter
MSSVEADEPDRATAPPSALLPEDGPGPDGTAAGPPPYARRWAALGVILGAEIMDLLDGTV
MNVAAPAVRADLGGSLSVIQWITVGYTLAFAVLLVVGGRLGDIYGRKRMFVVGAVGFTAA
SVLCSVAAGPEMLTAARFLQGGLGALMIPQGLGLIKQMFPPKETAAAFGAFGPAIGLGAV
LGPIVAGFLVDADLFGTGWRSVFLINLPIGVAVIVGAVLLLPEGKAPVRPKFDVVGMALV
TSGLTLLIFPLVQGRERGWPAWAFVLMLAGAAVLVGFVAHELRQERRGGATLIELSLLRR
SRYAAGLAVALVFFTGVSGMSLLLALHLQIGLGFSPTRAALTMTPWSVFLVVGAILTGAV
LGSKFGRKALHGGLVVLALGVLIMLLTIGDQAGGLTSWELVPGIAVAGLGMGIMIGLLFD
IALADVDKQEAGTASGVLTAVQQLGFTVGVAVLGTLFFGLLGSQATASVDDGASRARTEL
AAAGASTTEQDRLLADLRVCLRESASQQDSERTPDSCRNLQQARPAVAEATARAWRTAHT
ENFSTAMVRTLWVVIALLAVSFALAFRLPPKPREEEGF

>drug resistance transporter
ATGAGTTCCGTTGAAGCCGACGAGCCGGACAGGGCCACGGCCCCGCCGTCGGCGTTACTG
CCCGAGGACGGCCCCGGACCGGACGGAACCGCGGCCGGACCCCCGCCCTACGCGCGCCGT
TGGGCCGCGCTGGGAGTCATCCTCGGCGCCGAGATCATGGACCTGCTCGACGGCACGGTC
ATGAACGTGGCCGCGCCCGCCGTCCGCGCGGACCTGGGCGGCAGCCTCAGCGTCATCCAG
TGGATCACCGTCGGGTACACGCTCGCGTTCGCCGTCCTGCTCGTGGTGGGCGGCCGGCTG
GGCGACATCTACGGCCGCAAGCGCATGTTCGTCGTCGGCGCCGTCGGCTTCACCGCGGCC
TCCGTGCTGTGCTCGGTGGCGGCCGGTCCCGAGATGCTCACCGCGGCACGCTTCCTTCAG
GGCGGGCTCGGCGCGCTGATGATTCCGCAAGGGCTCGGTCTCATCAAGCAAATGTTCCCG
CCCAAGGAGACGGCGGCGGCGTTCGGCGCGTTCGGACCCGCCATCGGGCTGGGCGCCGTG
CTCGGCCCGATCGTCGCCGGGTTCCTGGTCGACGCCGACCTGTTCGGCACGGGCTGGCGG
TCCGTCTTCCTGATCAATCTGCCGATCGGCGTGGCCGTGATCGTCGGCGCGGTCCTGCTG
CTGCCCGAGGGCAAGGCGCCCGTGCGGCCGAAGTTCGACGTCGTCGGCATGGCGCTGGTG
ACGTCCGGGCTCACCCTGCTCATCTTCCCGCTCGTCCAGGGGCGCGAACGCGGCTGGCCC
GCCTGGGCGTTCGTGCTGATGCTGGCCGGAGCGGCCGTGCTCGTCGGCTTCGTCGCCCAC
GAACTGCGGCAGGAGAGGCGCGGCGGCGCCACGCTCATCGAGCTCAGCCTGCTGCGCAGG
TCCCGCTACGCCGCGGGACTGGCGGTGGCACTGGTGTTCTTCACCGGCGTCTCCGGAATG
TCGCTGCTGCTCGCCCTGCACCTGCAGATCGGCCTGGGCTTCAGCCCCACCAGGGCCGCG
CTGACCATGACGCCCTGGTCGGTGTTCCTCGTCGTCGGCGCGATCCTGACCGGGGCGGTG
CTGGGATCGAAGTTCGGCCGCAAGGCCCTGCACGGCGGGCTCGTGGTGCTGGCGCTGGGC
GTGCTGATCATGCTGTTGACGATCGGCGACCAGGCCGGCGGGCTGACCAGCTGGGAGCTC
GTCCCCGGTATCGCCGTTGCCGGGCTCGGCATGGGCATCATGATCGGACTGCTCTTCGAC
ATCGCCCTGGCCGACGTCGACAAGCAGGAGGCCGGTACCGCCTCCGGCGTCCTCACCGCG
GTCCAGCAGCTCGGCTTCACCGTGGGCGTCGCGGTGCTCGGGACCCTGTTCTTCGGGCTG
CTCGGCTCACAGGCCACGGCGAGCGTCGACGACGGCGCGAGCCGGGCCCGCACCGAACTC
GCCGCCGCCGGGGCGAGCACGACCGAGCAGGACCGGCTCCTGGCCGACCTGCGGGTGTGC
CTGCGGGAATCGGCGAGTCAGCAGGACTCCGAACGGACGCCGGACAGCTGCCGAAACCTC
CAGCAGGCCCGGCCGGCGGTGGCCGAGGCCACGGCGCGGGCCTGGCGGACGGCCCACACC
GAGAACTTCAGCACCGCGATGGTCCGCACGCTCTGGGTGGTGATCGCACTGCTGGCGGTC
TCCTTCGCGCTGGCCTTCCGGCTGCCGCCCAAGCCGCGTGAGGAAGAGGGCTTCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR011701 Major facilitator superfamily (Family) PF07690 MFS_1 IPR016196 Major facilitator superfamily domain, general substrate transporter (Domain) SSF103473 MFS_gen_substrate_transporter IPR020846 Major facilitator superfamily domain (Domain) PS50850 MFS
SignalP	No significant hit
TMHMM	Transmembrane 13

Actino_00130 Actino_00150