Actino_00150 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces coelicolor
Strain	A3(2) (=NBRC 15146)
Entry name	Actinorhodin
Contig	M64683
Start / Stop / Direction	13,889 / 16,024 / + [in whole cluster] 2,819 / 4,954 / + [in contig]
Location	13889..16024 [in whole cluster] 2819..4954 [in contig]
Type	CDS
Length	2,136 bp (711 aa)

Annotation

Category	5.4 hypothetical protein
Product	hypothetical protein
Product (GenBank)
Gene	actII-ORF3 actB
Gene (GenBank)	actII
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	ORF3
Reference	ACC Q53902 PmId [1716725] Transcriptional organization and regulation of an antibiotic export complex in the producing Streptomyces culture. (Mol Gen Genet. , 1991) [1878971] The act cluster contains regulatory and antibiotic export genes, direct targets for translational control by the bldA tRNA gene of Streptomyces. (Cell. , 1991) [8636024] Production of actinorhodin-related "blue pigments" by Streptomyces coelicolor A3(2). (J Bacteriol. , 1996) [23073761] A two-step mechanism for the activation of actinorhodin export and resistance in Streptomyces coelicolor. (MBio. , 2012) comment [PMID: 1716725](1991) actinorhodin biosynthetic gene clusterのactII領域の転写解析。 actII-ORF2 and -ORF3は同時に転写され、これらのpromoterはactII-ORF1産物によって強く抑制される。 -- [PMID: 1878971](1991) actinorhodin biosynthetic gene clusterのactII領域の解析論文。 actII-ORF1, actII-ORF2, or actII-ORF3の破壊はactinorhodin生合成を妨げない。 actII-ORF2/ORF3 mutationsは（たぶん酸性型の）抗生物質を細胞内に蓄積し、抗生物質排出が妨げられている。確認しているのは青色色素として。 -- [PMID: 8636024](1996) actII-ORF3のみの破壊は、全体的な青色色素産生や排出を損なわなかった。しかし、gamma-actinorhodin(lactone型actinorhodin)合成は廃止された。したがって、gamma-actinorhodinの合成に関与し、hypothetical dehydrogenase反応がActII-ORF3によって触媒されるかもしれない。他のdehydrogenasesには似ていないが、ひとつのputative NAD binding domain(GXGXXG)を示す([PMID: 1878971]を引用)。 -- [PMID: 23073761](2012) ActII-ORF2 (ActA) and ActII-ORF3 (ActB)はactAB operonを形成し、2つのputative export pumpsをコードする。普通のactinorhodin収量を得るにはactAB発現が必要。 actinorhodin生合成経路の3環中間体は生合成初期にactAB発現を十分なレベルで活性化する。これらの結果からactinorhodin export and resistanceのためのtwo-step modelを提唱。 3環中間体はactinorhodin産生初期のactAB発現を誘導して、自己防衛のためのpumpsを確実にする。このactAB発現は維持されず、時間と共に薄れる。その後、主にactinorhodin自身によって高レベル維持のactAB発現を導く。 (actAB発現の活性化は、actinorhodin or 中間体がrepressor ActRに結合することによる抑制の解除による。) proteins ActA, -B, and -Cのどれも実際にactinorhodin exportersであることを示す具体的なデータはない。(ActCがどのgeneを示すのか不明）

Sequence

>hypothetical protein
MTRTLLSWPGGRRLKWLVLAAWIGLLIVLQPLAGKLGDVESNDAAAWLPGNAESTEVLEL
SEKFQPADTSPTVIVYDRPSGITAADEAKARADATHFADGTGVVGEPYGPVRSDDGKALR
TVVNVHLGKDGWEGLNAAAKDMRAIARPSAPDGLGVHVTGPTGYAADSAESFSSADFKLT
LVTLLIVVTILVVTYRSPLLWLLPMISAGMSLVISQAIVYLLAKNAGLTVNAQTAMILTV
LVLGAATDYALLLVARYREELRRHEDRHEAMAVALRRAGPAIVASAATVAVSMLVLLLAA
LNSTKGLGPVCAVGVLVGLLSMMTLLPALLVIFGRWVFWPARPKHGTEPDVTRGLWSRIA
RLVSGRPRAVWVTTSLLLGAVATLAVTLNADGLQQKDGFKTKPESVVGEEILTRHFPAGS
GEPMVVIAKGASADQVHAALETVPGVIEVAPPQVKDGLAYVEATLGAGADSPAAMRSVTA
ARETLARLDGAQARVGGSSAVVHDMREASSRDRGLIIPVILAVVFCILALLLRALVAPLL
LIASVVLSFFTALGLAALFFNHVFDFAGADSAFPLWVFVFLVALGVDYNIFLVTRIKEES
DRLGTRQGALKGLTSTGGVITAAGLVLAGTFAALATLPLVFIAELGFTVAVGVLLDTMIV
RSVLVTALTLDVGRWMWWPHPLARREDPSEDPAVSGMPDSIDSEASTTASR

>hypothetical protein
ATGACACGCACACTGCTGTCCTGGCCCGGCGGACGCCGGCTCAAGTGGCTGGTGCTCGCG
GCCTGGATCGGTCTGCTGATCGTGCTCCAGCCGCTGGCAGGGAAGCTCGGCGACGTCGAG
TCCAACGACGCCGCCGCCTGGCTCCCCGGCAATGCGGAGTCGACCGAAGTGCTCGAGCTG
TCCGAGAAGTTCCAGCCGGCCGACACCAGCCCGACCGTGATCGTCTACGACCGCCCGTCC
GGGATCACGGCCGCCGACGAGGCGAAGGCGCGGGCCGACGCCACGCACTTCGCGGACGGC
ACCGGTGTGGTGGGCGAGCCCTACGGCCCGGTGCGCTCGGACGACGGCAAGGCCCTGCGC
ACCGTCGTCAACGTCCACCTCGGCAAGGACGGCTGGGAGGGGCTCAACGCGGCCGCGAAG
GACATGCGGGCGATCGCCCGGCCGAGCGCCCCGGACGGTCTCGGCGTCCACGTCACGGGT
CCGACCGGTTACGCCGCCGATTCCGCAGAGTCCTTCAGCAGCGCCGACTTCAAGCTCACC
CTGGTCACCCTCCTCATCGTCGTGACGATCCTCGTCGTCACCTATCGCAGTCCCTTGCTC
TGGCTGCTGCCGATGATCTCCGCGGGCATGTCCCTGGTCATCTCGCAGGCCATCGTCTAC
CTGCTGGCCAAGAACGCGGGACTCACGGTCAACGCCCAGACGGCGATGATCCTCACGGTC
CTGGTGCTCGGCGCGGCCACCGACTACGCGCTGTTGCTCGTCGCCCGCTACCGCGAGGAG
CTGCGGCGGCACGAGGACCGGCACGAGGCCATGGCCGTGGCGCTGCGCCGGGCCGGTCCC
GCCATCGTGGCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGTCAGCATGCTCGTCCTGCTGCTGGCCGCT
CTGAACTCCACCAAGGGTCTCGGCCCGGTCTGCGCCGTCGGCGTGCTGGTCGGCCTGCTG
TCGATGATGACGTTGCTGCCCGCCCTGCTGGTGATCTTCGGACGCTGGGTCTTCTGGCCG
GCCCGGCCGAAGCACGGTACGGAGCCCGACGTCACCCGGGGTCTGTGGTCGCGGATCGCC
CGGCTGGTGTCCGGCCGTCCGCGTGCCGTCTGGGTCACCACCAGCCTGCTGCTGGGGGCG
GTGGCCACGCTGGCCGTCACCCTGAACGCCGACGGCCTCCAGCAGAAGGACGGTTTCAAG
ACCAAGCCGGAGTCGGTGGTGGGCGAGGAGATCCTGACCCGGCACTTCCCGGCCGGCTCC
GGTGAACCCATGGTCGTCATCGCCAAGGGCGCCTCGGCGGACCAGGTGCACGCAGCTCTG
GAGACCGTGCCCGGCGTCATCGAGGTCGCACCACCACAGGTGAAGGACGGCCTCGCCTAT
GTCGAGGCGACGCTCGGCGCCGGGGCGGACTCGCCGGCGGCCATGCGTTCGGTCACCGCG
GCCCGCGAGACACTCGCCCGGCTGGACGGTGCGCAGGCACGGGTGGGCGGCAGCAGCGCC
GTCGTGCACGACATGCGGGAGGCGTCCAGCCGCGACCGCGGTCTGATCATTCCGGTGATC
CTCGCCGTGGTGTTCTGCATCCTCGCGCTGCTGCTGCGAGCACTGGTGGCGCCGCTGCTG
CTGATCGCGAGCGTGGTGCTGTCCTTCTTCACCGCGCTCGGCCTCGCCGCCCTCTTCTTC
AACCACGTCTTCGACTTCGCGGGAGCCGATTCGGCCTTCCCCCTGTGGGTCTTCGTCTTC
CTGGTCGCCCTGGGCGTCGACTACAACATCTTCCTCGTCACCCGGATCAAGGAGGAGAGC
GACCGGCTCGGCACCCGGCAGGGCGCGCTCAAGGGCCTCACCTCGACCGGTGGCGTGATC
ACCGCGGCCGGGCTGGTGCTGGCCGGGACCTTCGCCGCGCTGGCCACGCTGCCGCTGGTC
TTCATCGCCGAGCTCGGATTCACGGTCGCGGTGGGCGTCCTGCTCGACACCATGATCGTG
CGATCGGTCCTGGTCACCGCGCTCACTCTCGATGTCGGCCGGTGGATGTGGTGGCCGCAC
CCGCTCGCCCGGCGCGAGGACCCTTCCGAGGACCCAGCCGTATCAGGAATGCCAGATTCT
ATTGATTCGGAAGCCTCGACCACTGCCTCTCGGTAA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR000731 Sterol-sensing domain (Domain) PS50156 SSD IPR004869 Membrane transport protein, MMPL type (Domain) PF03176 MMPL
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-negative Bacteria, Gram-positive
TMHMM	Transmembrane 12

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