Salino_01040 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces albus subsp. albus
Strain	DSM 41398
Entry name	Salinomycin
Contig	HE586118
Start / Stop / Direction	185,492 / 184,269 / - [in whole cluster] 185,492 / 184,269 / - [in contig]
Location	complement(184269..185492) [in whole cluster] complement(184269..185492) [in contig]
Type	CDS
Length	1,224 bp (407 aa)

Annotation

Category	3.3 modification reduction
Product	putative cytochrome P450
Product (GenBank)	cytochrome P450
Gene
Gene (GenBank)	salD
EC number
Keyword
Note	The N-terminal position was modified from original INSDC entry.
Note (GenBank)
Reference	ACC H1ZZU6 PmId [22076845] A late-stage intermediate in salinomycin biosynthesis is revealed by specific mutation in the biosynthetic gene cluster. (Chembiochem. , 2012) comment monC gene-based hybridisation probeを使って、Streptomyces albus DSM 41398からsalinomycin(sal)生合成gene clusterを同定。 salD (393aa) : cytochrome P450 C-20でのhydroxylationはcytochrome P450 SalDによって触媒されると提唱される。
Related Reference	ACC H6D582 NITE Salino3_00260 PmId [22156425] Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. (Appl Environ Microbiol. , 2012) comment 配列は[H1ZZU6]と全く同じ。株違い。 polyetherに特異的なepoxidaseの配列に基づいた縮重プライマーを用いてStreptomyces albus XM211からsalinomycin(sln)生合成gene clusterを同定。 SlnF (407aa) : Cytochrome P450 P450 monooxygenase SlnFとferredoxin SlnEはC-20でのhydroxylationを成し遂げるようだ。しかし、置換によるslnF mutantはsalinomycin産生性を完全に失ったので、SlnFによるhydroxylationは成熟したpolyketide鎖がACPから放出される前に起こるかもしれない。
	ACC Q59523 PmId [7808395] Characterization and expression of a P-450-like mycinamicin biosynthesis gene using a novel Micromonospora-Escherichia coli shuttle cosmid vector. (Mol Gen Genet. , 1994) comment Blast 11th, id48%, 3e-96 Micromonospora griseorubida_mycG P-450-like protein abstract: 塩基配列と変異の解析から、single P-450-like proteinがhydroxylation and epoxidation 両方の反応を触媒すると示唆される。
	ACC Q331R5 PmId [21069297] Identification and characterization of gerPI and gerPII involved in epoxidation and hydroxylation of dihydrochalcolactone in Streptomyces species KCTC 0041BP. (Arch Microbiol. , 2011) comment Blast 13th, id47%, 5e-96 Streptomyces sp. KCTC 0041BP_gerPII Cytochrome P-450 dihydrochalcomycin生合成clusterにある3つのCYP450のうち、gerPI, PII の特徴づけ。 gerPI の破壊は主に12,13-de-epoxydihydrochalcomycinを蓄積した。 gerPII の破壊は8-dehydroxy-12,13-de-epoxydihydrochalcomycinを蓄積した。よって、GerPII がC-8でのhydroxylationを、続いてGerPI がC(12)-C(13) positionでのepoxidationを触媒する。
	ACC Q9KHJ7 NITE Enter_00180 PmId [11137817] Cloning, sequencing and analysis of the enterocin biosynthesis gene cluster from the marine isolate 'Streptomyces maritimus': evidence for the derailment of an aromatic polyketide synthase. (Chem Biol. , 2000) [17704772] Enzymatic total synthesis of enterocin polyketides. (Nat Chem Biol. , 2007) comment Blast 19th, id48%, 5e-95 Streptomyces maritimus_encR Putative p450 monooxygenase EncR --- [PMID: 11137817](2000) enterocin と wailupemycinsの生合成をコードするgene clusterの同定。 EncR: Cytochrome P-450 hydroxylase monooxygenase inhibitorであるancymidol によって、S.maritimusでのenterocin産生は減り、5-deoxyenterocinが蓄積する。 EncRをクローニング、maltose-binding-protein(MBP) affinity tagを付けて精製。反応産物のLC-MS解析から、MBP-EncRは 5-deoxyenterocin → enterocin への変換をすることを実証。またMBP-EncRはancymidol によって抑制されたので、in vivoでのancymidol による結果が、CYP450 EncR抑制のせいであることも確認された。 --- [PMID: 17704772](2007) enc genesを異種性に発現して得たタンパクを用いて、enterocinをin vitroに合成している。 EncA/B, EncC, EncD, EncN, EncM, EncK, EncR, SgFabD + benzoic acid, ATP/Mg2+, NADPH, SAM, ferredoxin, ferredoxin-NADP+ reductase, catalaseでenterocin, wailupemycin F and Gの産生あり。他のCYP450でも報告があるようにEncRはSAMで抑制されることがさらなる解析から明らかになったので、5-deoxyenterocinを含む nonpolar reaction productsを酸性条件下で抽出し、これがEncR-catalyzed reactionを受けてenterocinが得られることを確認した。

Sequence

>putative cytochrome P450 [cytochrome P450]
MPASKSSCPVAHGPVRDFPFTPVDGLVIEPVLAELRREEPISRIRLPYGGEAWLATRYQD
VRNALADPRLSRAAVVNADVPRRQEMQVGPEGIMYMDPPDHSRLRRLLTKAFTRRRVEML
RPRVAEIAAELAGDLAAQGSGGDLVSTFSWPLPTRVICELLGVPYEDREIFSRGADALMQ
GDTLPHAEFTSRINELCLYLAKLIAQRRAQPTEDMLTALIQARDEDDRLSEQELISISVV
LLAGGHETTANQITNFLYTLLRHPGQLALLREKPELMPQAVDELMRYIPLGTGHHAAMIA
TEDLEIGGQRIAEGESVYVHIHSANRDGEFFENPDELDLGREDNHHMGFGHGVHFCVGAQ
LARMELAVAVESVLDRFPTLELDIEDEAIRWRSSLLVRGPLALPVRW

>putative cytochrome P450 [cytochrome P450]
ATGCCTGCCTCAAAGTCTTCCTGTCCCGTCGCGCACGGGCCCGTGCGTGATTTCCCCTTC
ACCCCCGTCGACGGCCTGGTCATCGAGCCGGTCCTGGCCGAGCTGCGCCGCGAGGAGCCG
ATCAGCCGGATCCGCCTGCCCTACGGCGGCGAGGCCTGGCTCGCCACGCGCTACCAGGAC
GTACGCAACGCGCTCGCGGACCCGCGGCTCAGCCGCGCGGCGGTGGTGAACGCGGACGTA
CCGCGGCGCCAGGAGATGCAAGTGGGTCCCGAGGGGATCATGTACATGGACCCGCCCGAC
CACTCCCGGCTGCGGCGCCTGCTCACCAAGGCCTTCACCCGGCGGCGGGTGGAGATGCTG
CGGCCCCGGGTGGCCGAGATCGCCGCCGAACTCGCCGGGGACCTGGCCGCCCAGGGCAGC
GGCGGGGACCTGGTGTCCACCTTCTCCTGGCCGCTGCCCACCCGGGTGATCTGCGAACTG
CTCGGGGTGCCCTACGAGGACCGCGAGATCTTCAGCCGCGGCGCGGACGCGCTGATGCAG
GGCGACACCCTGCCGCACGCCGAGTTCACCTCCCGTATCAACGAACTCTGCCTGTATCTG
GCCAAGTTGATCGCCCAGCGCCGGGCGCAGCCGACCGAGGACATGCTCACCGCGCTGATC
CAGGCCCGGGACGAGGACGACCGGCTCAGCGAGCAGGAGCTGATCTCGATCTCCGTGGTG
CTCCTCGCCGGCGGCCACGAGACCACCGCGAACCAGATCACCAACTTCCTCTACACGCTG
CTGCGCCACCCCGGCCAACTCGCCCTGTTACGCGAGAAACCCGAGCTGATGCCGCAGGCC
GTGGACGAGCTGATGCGCTACATCCCGCTCGGCACCGGGCACCACGCCGCCATGATCGCG
ACGGAGGACCTGGAGATCGGCGGGCAGCGGATCGCCGAGGGTGAGTCCGTGTATGTACAC
ATACACTCGGCCAACCGGGACGGCGAGTTCTTCGAGAACCCGGACGAGCTCGACCTCGGC
CGCGAGGACAACCACCACATGGGCTTCGGCCACGGGGTCCACTTCTGCGTGGGCGCCCAA
CTCGCCCGGATGGAACTGGCGGTGGCCGTCGAATCCGTACTGGACCGCTTCCCCACCCTG
GAGCTGGACATCGAGGACGAGGCGATCCGCTGGCGCTCCAGCCTGCTGGTCCGCGGGCCG
CTCGCGCTGCCGGTGCGCTGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001128 Cytochrome P450 (Family) SSF48264 Cytochrome_P450 PR00385 P450 PF00067 p450 G3DSA:1.10.630.10 Cyt_P450 IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family) PR00359 BP450 IPR017972 Cytochrome P450, conserved site (Conserved_site) PS00086 CYTOCHROME_P450
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Salino_01030 Salino_01050