Ansam_00510 : CDS information

Location

Organism	Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum
Strain	ATCC 31565
Entry name	Ansamitocin
Contig	U33059
Start / Stop / Direction	91,828 / 92,856 / + [in whole cluster] 9,082 / 10,110 / + [in contig]
Location	91828..92856 [in whole cluster] 9082..10110 [in contig]
Type	CDS
Length	1,029 bp (342 aa)

Annotation

Category	2.2 modification addition of starter unit
Product	putative aminodehydroquinate synthase
Product (GenBank)	aminodehydroquinate synthase
Gene	asm47
Gene (GenBank)
EC number	4.2.3.-
Keyword	AHBA
Note
Note (GenBank)	ORF10; similar to RifG in the rifamycin biosynthetic gene cluster
Reference	ACC O69211 PmId [12060743] The biosynthetic gene cluster of the maytansinoid antitumor agent ansamitocin from Actinosynnema pretiosum. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2002) comment Actinosynnema pretiosum ssp. auranticum ATCC 31565のcosmid libraryから、ansamitocin生合成に必要な2つのgene clustersをクローニング。 cluster II を削除するとansamitocinsの産生がなくなるが、AHBAを補充すると産生は回復するので、cluster II はAHBA形成のみに必要な遺伝子を含む。 <cluster II> Asm47(342aa) : aDHQ synthase asm43-47は明らかにひとつのオペロンで編成される。 RifGに似ていることから、PKS starter AHBAの生合成genesのひとつであるとされている。
Related Reference	ACC O52549 NITE Rifam_00280 PmId [11278540] Mutational analysis and reconstituted expression of the biosynthetic genes involved in the formation of 3-amino-5-hydroxybenzoic acid, the starter unit of rifamycin biosynthesis in amycolatopsis Mediterranei S699. (J Biol Chem. , 2001) comment Blast 19th, id71%, 1e-119 Amycolatopsis mediterranei_rifG(aroB) 3-dehydroquinate synthase(EC 4.2.3.4) [DoBISCUIT]putative aminodehydroquinate synthase rifamycinと関連ansamycinsのPKS starter 3-amino-5-hydroxybenzoic acid (AHBA)の生合成経路について調査。関連遺伝子の不活化、異種性発現、中間体を基質とした反応確認など。 RifG: Aminodehydroquinate synthase rifH, -G, and -J genesの遺伝子産物は shikimate biosynthesis pathwayに関連する酵素に似ている。rifH, G, Jの各mutantは成長に影響を与えないので、shikimate pathwayに直接関連しないことがわかる。また、mutantでもrifamycin B産生をある程度保つことから、shikimate pathwayのgeneが代替していると考えられる。 AHBA biosynthetic genesをプラスミドに組み込んだS. coelicolor YU105を使ってAHBA生産を調べると、AHBA biosynthetic genesが全て揃っている場合と比較して、rifGを除いた場合はAHBAの生産量が約10%にまで落ちることが示されており、rifGはAHBAの生産に関与していることが示されている。
Related Reference	ACC P0A4Z4 PmId [17586643] Functional characterization by genetic complementation of aroB-encoded dehydroquinate synthase from Mycobacterium tuberculosis H37Rv and its heterologous expression and purification. (J Bacteriol. , 2007) [1910148] The Mycobacterium tuberculosis shikimate pathway genes: evolutionary relationship between biosynthetic and catabolic 3-dehydroquinases. (Mol Gen Genet. , 1991) comment Blast 378th, id42%, 2e-44 Mycobacterium tuberculosis_aroB 3-dehydroquinate synthase(EC 4.2.3.4) [PMID: 17586643] Mycobacterium tuberculosis H37Rv_aroBをクローニング、E. coliで大量発現してhomogeneityに精製、アミノ酸シークエンス。M. tub_aroBはE. coli aroB deletion mutantを相補することを確認。

Sequence

>putative aminodehydroquinate synthase [aminodehydroquinate synthase]
MPTTATTREVRVELGERAYTVHIGHGVRAALPDVVRALGARRAVVVTARPPDQTPDPGVP
SLVLPARDGEHDKTLATVAHLCSRFAEFGLTRADVVVSCGGGTTTDAVGLAASLYHRGTP
VVHVPTSLLAQVDASVGGKTAVNLPEGKNLVGSYWQPAAVLCDLDLLATLPERELRNGLG
EIARCHFIGAPGLDRLPLLDQVAASVALKARVVAADERDRGLRHTLNYGHTLGHALELAT
GFAVRHGEGVAIGTVFAGRLAGALGRIGPDRVAEHHAVVAGYGLPVALPPGVPDDELLRF
VRRDKKSTGGLAFVLDGPRGAELVRDVDEHVVAATLAAMPRA

>putative aminodehydroquinate synthase [aminodehydroquinate synthase]
GTGCCCACCACCGCCACCACCCGCGAGGTCCGGGTCGAGCTGGGCGAGCGCGCCTACACC
GTCCACATCGGACACGGCGTGCGCGCCGCCCTCCCGGACGTCGTGCGGGCCCTCGGCGCG
CGCCGCGCCGTCGTGGTCACCGCCCGCCCGCCGGACCAGACGCCCGACCCCGGCGTCCCC
TCCCTCGTCCTCCCGGCCCGCGACGGCGAGCACGACAAGACCCTCGCCACCGTCGCCCAC
CTGTGCAGCCGGTTCGCCGAGTTCGGCCTGACCCGCGCCGACGTCGTCGTCTCCTGCGGC
GGCGGCACCACCACCGACGCGGTCGGCCTCGCCGCCTCGCTCTACCACCGGGGCACACCG
GTCGTGCACGTGCCGACCTCGCTGCTCGCCCAGGTCGACGCGAGCGTCGGCGGCAAGACG
GCGGTCAACCTCCCCGAGGGCAAGAACCTCGTCGGCTCCTACTGGCAGCCCGCCGCCGTG
CTGTGCGACCTCGACCTGCTCGCCACCCTGCCCGAGCGCGAGCTGCGCAACGGCCTCGGC
GAGATCGCCCGCTGCCACTTCATCGGCGCGCCGGGCCTTGACCGGTTGCCGCTGCTGGAC
CAGGTGGCGGCGAGCGTCGCCCTCAAGGCCCGCGTGGTGGCCGCCGACGAGCGCGACCGC
GGCCTGCGGCACACCCTCAACTACGGCCACACCCTCGGCCACGCCCTGGAGCTCGCCACC
GGTTTCGCGGTGCGGCACGGCGAGGGCGTCGCGATCGGCACGGTCTTCGCCGGCCGCCTG
GCGGGCGCGCTCGGCCGGATCGGCCCGGACCGGGTGGCCGAGCACCACGCCGTGGTCGCG
GGCTACGGGCTGCCGGTCGCGCTGCCGCCGGGCGTGCCGGACGACGAGCTGCTGCGGTTC
GTGCGCCGCGACAAGAAGTCCACCGGCGGCCTGGCGTTCGTGCTCGACGGCCCGCGCGGC
GCGGAGCTGGTGCGCGACGTCGACGAGCACGTCGTCGCCGCCACCCTGGCCGCGATGCCG
CGGGCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR016037 3-dehydroquinate synthase AroB (Family) PIRSF001455 DHQ_synth
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Ansam_00500 Ansam_00520