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Azino_00130 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry nameAzinomycin B
Contig
Start / Stop / Direction23,658 / 23,101 / - [in whole cluster]
23,658 / 23,101 / - [in contig]
Locationcomplement(23101..23658) [in whole cluster]
complement(23101..23658) [in contig]
TypeCDS
Length558 bp (185 aa)
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Category5.1 general function
Productputative adenylyl-sulfate kinase
putative adenosine 5'-phosphosulfate kinase
putative APS kinase
Product (GenBank)Azi12
GeneaziH3
cysC
Gene (GenBank)azi12
EC number2.7.1.25
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • putative adenylylsulfate kinase
Reference
ACC
PmId
[18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008)
comment
Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。

aziH3: Adenylylsulfate kinase

AziF, AziG, AziH1, AziH2, AziH3 の機能は、azinomycin B生合成経路に割り当てることができなかった。
AziH1, AziH2, AziH3 のsubsetは、sulfur metabolismの最初の2段階を行うとされる酵素（E.coliのCysD, CysN, CysCなど）に高い類似性を示す。
Related Reference
ACC
Q10600
PmId
comment
Blast id48%, N末余る
Mycobacterium tuberculosis_cysNC
Bifunctional enzyme cysN/cysC

E.coliで発現、精製、活性を見ている。cysDとcysNCはオペロン。
Sulfur非存在下でcysDNC operonは発現が誘導され、主な最終産物であるCysteineの添加により発現が抑制される。

CysDNCは、sulfate activation pathwayを構成するATP sulfurylase, GTPase, adenosine 5'-phosphosulfate kinase活性を示す多機能酵素複合体を形成する。
ACC
P0A6J1
PmId
[2828368] ( , )
[1332767] ( , )
[10860538] ( , )
comment
Blast id40%
Escherichia coli_cysC
Adenylyl-sulfate kinase(EC 2.7.1.25)

---
[PMID:2828368](1988)
cysCのクローニング、マッピング、遺伝子産物同定、特徴づけあり。
cysNとcysCはオペロンを形成している。

---
[PMID:1332767](1992)
Adenosine 5'-phosphosulfate (APS) kinase (ATP:APS 3'-phosphotransferase)の反応におけるリン酸化について調べている。酵素がリン酸化されることを解明するため、cysCの完全配列を決定し、32Pラベルした酵素の消化実験からATPでリン酸化される残基serine-109を同定している。

---
[PMID:10860538](2000)
同じ著者らの続報

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selected fasta
>putative adenylyl-sulfate kinase [Azi12]
MIGPESCDCGVTVLLTGLPSAGKTTVAFLVAGRLRDAGHRVEVLDGDVMRKTLSAGLGFG
RADRHENLQRIGVMAEVLARNGVIVLVPVVAPYADSRDAVRQRHTASGTAFLEVHVATPV
EVCAQRDVKGLYARQRAGELTGLTGVDDPYQAPEKPDLVIPTVRQSADASASLLMDLLVR
KRFVA
selected fasta
>putative adenylyl-sulfate kinase [Azi12]
GTGATCGGGCCTGAATCATGTGACTGCGGCGTGACCGTCCTGCTGACGGGGCTGCCGAGT
GCGGGCAAGACGACGGTCGCGTTCCTGGTCGCCGGGCGACTGCGCGACGCGGGACACCGA
GTGGAGGTCCTGGACGGTGACGTCATGCGGAAGACACTGTCGGCAGGGCTCGGATTCGGC
CGGGCGGACCGGCACGAGAACCTGCAGCGGATCGGGGTGATGGCCGAGGTCCTCGCCCGC
AACGGCGTGATCGTCCTCGTGCCGGTGGTCGCGCCGTACGCCGACAGCCGCGACGCCGTC
CGGCAGCGGCACACCGCGAGCGGGACCGCATTCCTGGAAGTCCATGTGGCCACGCCCGTG
GAGGTCTGTGCGCAACGGGACGTCAAGGGCCTGTACGCCCGGCAGCGGGCCGGCGAGCTG
ACCGGTCTCACCGGGGTCGACGATCCCTACCAGGCGCCCGAGAAGCCCGACCTCGTCATC
CCGACGGTCCGGCAGTCGGCCGACGCGTCGGCCTCCCTGCTCATGGACCTGCTCGTGCGG
AAGCGGTTCGTGGCATGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002891 Adenylylsulphate kinase (Family)
[10-165] 2.70000000000002e-56 PF01583
PF01583   APS_kinase
[10-178] 2.4e-54 TIGR00455
TIGR00455   ApsK
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Azino_00120 Azino_00120   Azino_00140 Azino_00140
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