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Rever_00150 : CDS information

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Organism
StrainSN-593
Entry nameReveromycin
Contig
Start / Stop / Direction42,227 / 43,048 / + [in whole cluster]
42,227 / 43,048 / + [in contig]
Location42227..43048 [in whole cluster]
42227..43048 [in contig]
TypeCDS
Length822 bp (273 aa)
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Category3.3 modification reduction
ProductNAD(+)-dependent reveromycin A1a dehydrogenase
Product (GenBank)dihydroxy ketone synthase
Gene
Gene (GenBank)revG
EC number1.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[21642985] Reveromycin A biosynthesis uses RevG and RevJ for stereospecific spiroacetal formation. (Nat Chem Biol. , 2011)
comment
ΔrevGではReveromycinを合成することができなくなり、Reveromycin A1aが蓄積した。また、相補株ではReveromycinの生合成が復活した。
精製したRevGは、Reveromycin A1aにおいて、NAD＋を使い（NADH＋は使わない、最適pHは9.5−10.5付近、活性に金属イオンは必要としない）、ジヒドロキシケトンを生成することが判明した。
RevGの反応産物から、立体構造の異なるスピロアセタール化合物（A3a(18a)とA3b(18b)）が非酵素的に生成されるが、Streptomyces sp. SN-593から単離されるReveromycinはA3a(18a)由来のみである。
RevGの反応mixtureに精製RevJを加えたところ、RevJが反応系に存在するときのみスピロアセタール環化反応が効率よく進行し、さらに反応産物の立体構造はすべてA3a(18a)だった。
安定な非環式の前駆体から、スピロアセタール立体構造を構築するkey酵素がdehydroxy ketone synthase(RevG)及びspiroacetal synthase(RevJ)である。

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selected fasta
>NAD(+)-dependent reveromycin A1a dehydrogenase [dihydroxy ketone synthase]
MTRRLDGKVAMITGAARGQGRGHALRLAEEGADLILVDICQNIDTLAYSLGSEDELAETA
AQVEKLGRRVVTAQADTRDAAALREAVERGTSELGGLDILVANAGVGMAHPSTSQEQAFR
DQLEINTIGAWNTVHAAAPKIIEGGKGGAVVVISSVMGLSGKIGSPTGGAEGYVAAKHAL
LGLSRAWTRWLGPHNIRVNSIHTTGVRTPLLINDAVKKVHTKPPTTGAEVGHILDVTMLD
VSDVTGAVSWLVSDEARYVTGIALPIDAGFTTP
selected fasta
>NAD(+)-dependent reveromycin A1a dehydrogenase [dihydroxy ketone synthase]
ATGACGCGACGACTCGACGGTAAGGTGGCCATGATCACGGGTGCGGCCCGTGGCCAGGGC
CGGGGCCACGCCCTGCGGCTGGCCGAGGAGGGCGCCGACCTGATCCTGGTGGACATCTGC
CAGAACATCGACACGCTGGCCTACTCCCTCGGCTCCGAGGACGAGCTCGCCGAGACCGCC
GCCCAGGTGGAGAAGCTGGGCCGCCGCGTGGTGACGGCGCAGGCCGACACCCGGGACGCG
GCGGCGCTGCGGGAGGCCGTCGAGCGCGGCACCTCGGAGCTGGGCGGCCTGGACATCCTC
GTCGCCAACGCCGGCGTGGGCATGGCGCACCCCTCGACCAGCCAGGAGCAGGCGTTCCGC
GACCAGTTGGAGATCAACACCATCGGCGCATGGAACACCGTGCACGCCGCGGCGCCGAAG
ATCATCGAGGGCGGCAAGGGCGGCGCGGTCGTCGTCATCAGCTCGGTGATGGGCCTGAGC
GGCAAGATCGGCAGCCCGACCGGCGGCGCGGAGGGCTACGTCGCCGCCAAGCACGCGCTG
CTGGGCCTGTCCCGGGCGTGGACCCGGTGGCTGGGCCCGCACAACATCCGGGTCAACTCC
ATCCACACCACCGGGGTGCGCACCCCGCTGCTCATCAACGACGCCGTCAAGAAGGTGCAC
ACCAAGCCCCCCACCACCGGCGCCGAGGTGGGCCACATCCTCGACGTCACGATGCTGGAC
GTCAGCGACGTCACCGGCGCGGTGTCCTGGCTGGTCTCGGACGAGGCCCGCTACGTCACC
GGTATCGCGCTGCCGATCGACGCCGGCTTCACCACCCCGTAA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
[95-106] 1.79999951654677e-06 PR00080 [148-156] 1.79999951654677e-06 PR00080 [173-192] 1.79999951654677e-06 PR00080
PR00080   SDRFAMILY
[8-187] 1.4e-23 PF00106
PF00106   adh_short
IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase (Family)
[9-26] 1.10000150671642e-21 PR00081 [95-106] 1.10000150671642e-21 PR00081 [142-158] 1.10000150671642e-21 PR00081 [173-192] 1.10000150671642e-21 PR00081 [194-211] 1.10000150671642e-21 PR00081
PR00081   GDHRDH
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[1-271] 1.99999999999999e-61 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP
[1-24] 0.106 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM No significant hit
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