Mith_00010 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces argillaceus
Strain	ATCC 12956
Entry name	Mithramycin
Contig	X89899
Start / Stop / Direction	1,462 / 218 / - [in whole cluster] 1,462 / 218 / - [in contig]
Location	complement(218..1462) [in whole cluster] complement(218..1462) [in contig]
Type	CDS
Length	1,245 bp (414 aa)

Annotation

Category	5.1 general function
Product	putative major facilitator superfamily transporter
Product (GenBank)	membrane protein
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note	It is supposed that this ORF is not involved in mithramycin biosynthesis.
Note (GenBank)	ORFA
Reference	ACC Q194R9 PmId [9882681] The mithramycin gene cluster of Streptomyces argillaceus contains a positive regulatory gene and two repeated DNA sequences that are located at both ends of the cluster. (J Bacteriol. , 1999) comment mithramycin産生株Streptomyces argillaceusの染色体のシークエンスから、orfAとmtmRを同定。 orfAの推定AA配列は輸送タンパクに似ている。 orfAのN末にかかった241bpの配列がmithramycin gene clusterの反対側の端にも見られたことから、このclusterは環状染色体外要素の一部から獲得されたと提唱している。
Related Reference	ACC P76350 PmId [9524262] Cloning and analysis of the shiA gene, which encodes the shikimate transport system of escherichia coli K-12. (Gene. , 1998) comment Blast 458th, id41%, 3e-59 E.coli_shiA Shikimate transporter Escherichia coli K-12においてシキミ酸の輸送に関与するshiA遺伝子をクローニングしてシークエンス。ShiAはそのアミノ酸配列からMFS superfamilyに属する。shiA破壊株ではシキミ酸の輸送ができなくなった。シキミ酸を芳香環の供与体として添加したときに生育できるaroE strainでshiAを高発現させると、dehydroshikimate (DHS)が蓄積し、シキミ酸の輸送が阻害された（シキミ酸の前駆体であるDHSによってシキミ酸輸送が調節されている）。E. coliではshiAの発現は、芳香族アミノ酸の生合成と輸送に関与する遺伝子群の発現を調節するTyrAでは制御されていないようだった。

Sequence

>putative major facilitator superfamily transporter [membrane protein]
MPIPARPHRTRGSGAHGLRNHRSPTPRQPQAHRRRQPHRHHHRVVRLLPVRSAAALVFNK
LFFPGSDPLVGTLLSFLTYAVGFAARPLGALVFGHYGDRLGRKKLLVLSLVMMGGATFAI
GLLPTHATIGTAAPVLLTVLRLVQGFALGGEWAGPSCWVSEHGDARRRGFWASWPQTGAP
AGQLLATGVLSSSPPCCRTPLGSWGWRIPFLLSGLLVIVGLWIRLSVDESPVFKEALAHA
EARKATEAPQPRSFRSSPVLRHHWRDVLVAMGARMAENISYYVITAFILVYATTSGGVSR
QTALNGVLIASAVHFAVIPAWGALSDRVGPRPVYLLGAVGIGLWMFPFFSLIDTGGFGNL
VLAVTPGLVLHGAMYAPQGAFFSEMFATRMRYCGAFQGAQVASWSRARAPGPRS

>putative major facilitator superfamily transporter [membrane protein]
GTGCCGATACCTGCCCGTCCCCACCGCACACGAGGAAGTGGCGCACATGGCCTCCGGAAC
CACCGCTCCCCCACCCCCCGCCAGCCTCAAGCGCATCGTCGCCGCCAGCCTCATCGGCAC
CACCATCGAGTGGTACGACTTCTTCCTGTACGCTCCGCCGCCGCGCTCGTCTTCAACAAG
CTGTTCTTCCCGGGCTCCGATCCTCTCGTCGGCACGCTGCTGTCCTTCCTGACGTACGCG
GTGGGATTCGCGGCGCGTCCCCTCGGGGCGCTGGTCTTCGGGCACTACGGGGACCGGCTC
GGGCGCAAGAAGCTGCTGGTGCTCAGTCTGGTGATGATGGGCGGGGCGACCTTCGCGATC
GGACTGCTGCCCACGCACGCGACCATCGGGACCGCCGCTCCGGTGCTGCTGACCGTGCTG
CGTCTGGTGCAGGGCTTCGCGCTCGGCGGCGAGTGGGCGGGGCCGTCCTGCTGGGTGTCC
GAGCACGGGGACGCGCGGCGGCGCGGGTTCTGGGCCTCGTGGCCGCAGACCGGTGCGCCG
GCGGGGCAGCTGCTCGCGACCGGCGTGCTCTCCTCCTCACCGCCGTGCTGTCGGACGCCG
CTCGGCAGCTGGGGCTGGCGGATACCGTTCCTGCTCTCCGGCCTGCTGGTGATCGTCGGT
CTGTGGATTCGTCTCTCCGTCGATGAATCGCCGGTGTTCAAGGAGGCGTTGGCGCACGCC
GAGGCCCGGAAGGCGACGGAGGCGCCGCAGCCGAGAAGCTTCCGCTCGTCGCCCGTGCTG
CGGCACCACTGGCGTGACGTGCTCGTCGCGATGGGCGCGCGCATGGCGGAGAACATCTCC
TACTACGTCATCACCGCCTTCATCCTCGTATACGCGACGACTTCGGGCGGTGTCTCCCGC
CAGACCGCCCTCAACGGCGTGCTCATCGCCTCCGCCGTGCACTTCGCGGTGATCCCGGCC
TGGGGCGCGCTCTCCGACCGGGTGGGCCCGCGGCCCGTCTACCTGCTGGGCGCGGTCGGC
ATCGGGCTGTGGATGTTCCCCTTCTTCTCGCTCATCGACACGGGCGGCTTCGGCAACCTC
GTGCTCGCCGTGACCCCCGGGCTGGTGCTGCACGGCGCGATGTACGCACCCCAGGGCGCC
TTCTTCTCCGAGATGTTCGCGACCCGGATGCGCTACTGCGGTGCGTTCCAGGGTGCCCAG
GTCGCCTCCTGGTCGCGGGCGCGTGCTCCTGGGCCCCGCTCATAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR011701 Major facilitator superfamily (Family) PF07690 MFS_1 IPR016196 Major facilitator superfamily domain, general substrate transporter (Domain) SSF103473 MFS_gen_substrate_transporter IPR020846 Major facilitator superfamily domain (Domain) PS50850 MFS
SignalP	No significant hit
TMHMM	Transmembrane 7

first Mith_00020