Mith_00130 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces argillaceus
Strain	ATCC 12956
Entry name	Mithramycin
Contig	X89899
Start / Stop / Direction	16,025 / 16,477 / + [in whole cluster] 16,025 / 16,477 / + [in contig]
Location	16025..16477 [in whole cluster] 16025..16477 [in contig]
Type	CDS
Length	453 bp (150 aa)

Annotation

Category	5.4 hypothetical protein
Product	hypothetical protein
Product (GenBank)	cyclase
Gene
Gene (GenBank)	mtmX
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q53670 PmId [8654997] Characterization of Streptomyces argillaceus genes encoding a polyketide synthase involved in the biosynthesis of the antitumor mithramycin. (Gene. , 1996) comment Streptomyces argillaceus ATCC 12956での5.3kb fragmentのシークエンスから6ORFsを同定。この領域の2カ所の挿入不活化実験により、mithramycin生合成への関与を確認している。 mithramycin生合成は、type II PKSがコードする遺伝子の典型的なセットに関与する。 mtmX(150aa): Unknown 配列解析のみ。 Fren-ORFXやActVI-ORFAに似ている。
Related Reference	ACC Q2PA04 NITE Stref_00110 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment Blast 7th, id49%, 9e-29 Streptomyces steffisburgensis_stfX Cyclase [DoBISCUIT]hypothetical protein StfXはpolyketideの4番目の環化をすると考えられていたが、stfX不活化mutantでも4th ring cyclizationされたcompound 1を検出。よってこの環化は自発的に発生し、StfXはこの過程を促進するとされている。
	ACC Q9ZAT9 NITE Adria_00050 PmId [9864344] Doxorubicin overproduction in Streptomyces peucetius: cloning and characterization of the dnrU ketoreductase and dnrV genes and the doxA cytochrome P-450 hydroxylase gene. (J Bacteriol. , 1999) [10631513] A two-plasmid system for the glycosylation of polyketide antibiotics: bioconversion of epsilon-rhodomycinone to rhodomycin D. (Chem Biol. , 1999) comment Blast 20th, id42%, 3e-16, N末60aaほど余る Streptomyces peucetius_dpsH(dnmW) Daunorubicin biosynthesis enzyme [DoBISCUIT]hypothetical protein --- [PMID: 9864344](1999) dpsH::aphII mutantは、有意な量のRHOを蓄積したが、daunorubicin (DNR) or doxorubicin (DXR)はしなかった。(TLC and HPLC analysis) このmutantでの相補実験もしたがdpsH geneの役割についての明白な結論に到達できなかった。 dpsHはdaunosamine生合成またはRHOへのdaunosamine付着に関連する可能性あり？ --- [PMID: 10631513](1999) dpsH(dnmW) geneの役割の再評価をしている。 dpsH in-frame mutantは、RHOの蓄積が増える(160-273%)が、DNR(23-34%) and DXR(10-24%)の産生もまだいくらかある。よってdpsHは、anthracycline glycosides RHOD, DNR and DXRの形成において、重要ではあるが絶対的に必要ではない。これを受けてdpsH→dnmWへ改名している。 DiscussionにdnmQ or dnmWどちらかの欠損は厳しくdTDP-daunosamineの形成を減らす、との記述があるがdTDP-daunosamine量を測定している実験の記載はなく由来不明。
	ACC Q53925 NITE Actino_00020 PmId [17227452] Possible involvement of ActVI-ORFA in transcriptional regulation of actVI tailoring-step genes for actinorhodin biosynthesis. (FEMS Microbiol Lett. , 2007) comment Blast 37th, id38%, 2e-09 Streptomyces coelicolor_ORFA Hydroxylacyl-CoA dehydrogenase [DoBISCUIT]hypothetical protein actVI-ORFA mutantはactinorhodin産生減少、中間体(S)-DNPAとshunt産物(S)-NHABを蓄積。相補で回復。また、同じmutantでactVI-ORF1発現量が減少。相補で回復。よってActVI-ORFAは、post-PKS tailoring enzymeであるactVI-ORF1の発現を通してactinorhodin産生に影響を与えるregulatory roleを持つ可能性あり。

Sequence

>hypothetical protein [cyclase]
MTAPTETQPHSSAGFGSLYAEIQQFYARHMQLLDGGAADEWAADFTEDASFSVPTVPAPV
VGRDALAAAVRRTAESLASTGEQHRHWPGVFDVRPRRDGSVVVHSYTTVYASPRGGESRV
HRVCTCTDVLVREDGRLLVRSREVIRDDLR

>hypothetical protein [cyclase]
GTGACCGCGCCGACCGAGACACAGCCGCACTCCTCCGCCGGGTTCGGCTCCCTGTACGCG
GAGATCCAGCAGTTCTACGCCCGCCACATGCAGCTCCTCGACGGGGGAGCCGCCGACGAG
TGGGCGGCCGACTTCACCGAGGACGCGTCGTTCTCGGTGCCGACCGTGCCGGCACCGGTG
GTGGGCCGGGACGCCCTGGCAGCCGCGGTGCGGCGCACCGCCGAGTCCCTGGCCTCCACT
GGTGAGCAGCACCGCCACTGGCCCGGCGTCTTCGACGTCCGGCCGCGGCGGGACGGCTCC
GTGGTGGTCCACTCGTACACCACCGTGTACGCCTCACCGCGTGGCGGGGAGTCCCGCGTG
CACCGCGTCTGCACCTGCACGGACGTCCTGGTCCGCGAGGATGGCCGGCTGCTCGTGCGG
TCCCGCGAGGTCATCCGTGACGACCTGCGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Mith_00120 Mith_00140