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Mith_00160 : CDS information

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Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction19,209 / 19,466 / + [in whole cluster]
19,209 / 19,466 / + [in contig]
Location19209..19466 [in whole cluster]
19209..19466 [in contig]
TypeCDS
Length258 bp (85 aa)
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Category1.1 PKS
Productpolyketide synthase acyl carrier protein subunit
Product (GenBank)acyl carrier protein
Gene
Gene (GenBank)mtmS
EC number
Keyword
  • type II PKS
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[8654997] Characterization of Streptomyces argillaceus genes encoding a polyketide synthase involved in the biosynthesis of the antitumor mithramycin. (Gene. , 1996)
comment
Streptomyces argillaceus ATCC 12956での5.3kb fragmentのシークエンスから6ORFsを同定。
この領域の2カ所の挿入不活化実験により、mithramycin生合成への関与を確認している。
mithramycin生合成は、type II PKSがコードする遺伝子の典型的なセットに関与する。

mtmS(85aa): ACP

配列解析のみ。
Related Reference
ACC
Q9X463
NITE
Naphcy_00030
PmId
[10206788] Isolation and characterization of the naphthocyclinone gene cluster from Streptomyces arenae DSM 40737 and heterologous expression of the polyketide synthase genes. (Gene. , 1999)
comment
Blast 6th, id47%, 1e-12
Streptomyces arenae_ncnC
Acyl carrier protein

NcnC: PKS acyl carrier protein
minimal PKS ACPとして異種性発現実験に使用している。
ACC
Q9F6C8
NITE
R1128_00140
PmId
[11732905] In vitro reconstitution and analysis of the chain initiating enzymes of the R1128 polyketide synthase. (Biochemistry. , 2001)
[12767243] Ketosynthases in the initiation and elongation modules of aromatic polyketide synthases have orthogonal acyl carrier protein specificity. (Biochemistry. , 2003)
comment
Blast 33rd, id47%, 1e-08
Streptomyces sp. R1128_zhuN
Acyl carrier protein

--
[PMID: 11732905](2001) abstract
R1128 gene clusterにCPが2つあることに関する分子的ロジックを検証するため、apo-ZhuG or apo-ZhuNの存在下で、ZhuHが触媒するbeta-ketopentanoyl-ACP形成の抑制を定量化。

両apo-proteinsは同程度のinhibitorsであったので、これらはchain initiationの際に互換的に使用されうる。

--
[PMID: 12767243](2003)
・2 priming KSs = ZhuH, FrenI
・2 elongation KSs(+CLF) = actI-ORF1+ORF2, tcmK+L
・6 ACPs = FrenN, FrenJ, ZhuN, ZhuG, Gra-ORF3, DpsG
・MAT
を発現、精製して、組み合わせによる活性を確認している。

KS-CLF and MATの存在下で、minimal PKSに由来するすべてのACPsはpolyketideを合成。
k(cat) between 0.17 and 0.37 min(-1)

priming KSであるZhuHは、priming ACPであるZhuGの存在下でacyl transfer活性が高いが、
minimal PKSのACPであるFrenN, ZhuN, DpsGの存在下では検出されない。

close this sectionPKS/NRPS Module

ACP2..75

close this sectionSequence

selected fasta
>polyketide synthase acyl carrier protein subunit [acyl carrier protein]
MHLEDLTAVLRECAGESESAGLTTAALDVSFADLGYDSVAVLETTARIERDHGVVLDEEA
VSEAETLGQYLALVNEALADGTRAA
selected fasta
>polyketide synthase acyl carrier protein subunit [acyl carrier protein]
ATGCACCTGGAAGACCTCACCGCCGTGCTGCGCGAGTGCGCGGGCGAGAGCGAGAGCGCC
GGTCTGACCACGGCCGCCCTCGACGTCTCCTTCGCCGACCTCGGCTACGACTCGGTCGCC
GTCCTGGAGACCACGGCGCGCATCGAGCGCGATCACGGCGTCGTCCTCGACGAGGAGGCC
GTTTCCGAGGCGGAGACCCTGGGCCAGTACCTCGCCCTGGTCAACGAGGCGCTCGCCGAC
GGCACCCGTGCGGCCTGA
ACP2..75
ACP4..225

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
[33-48] PS00012
PS00012   PHOSPHOPANTETHEINE
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
[3-81] 1.20000117458134e-11 SSF47336
SSF47336   ACP_like
[23-73] 5.9e-08 PF00550
PF00550   PP-binding
[3-79] 6.90000000000001e-12 G3DSA:1.10.1200.10
G3DSA:1.10.1200.10   ACP_like
[2-75] PS50075
PS50075   ACP_DOMAIN
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Mith_00150 Mith_00150   Mith_00170 Mith_00170
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