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Mith_00170 : CDS information

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Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction19,497 / 20,261 / + [in whole cluster]
19,497 / 20,261 / + [in contig]
Location19497..20261 [in whole cluster]
19497..20261 [in contig]
TypeCDS
Length765 bp (254 aa)
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Category5.1 general function
Productputative oxidoreductase
Product (GenBank)ketoreductase
Gene
Gene (GenBank)mtmTI
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[10102355] Analysis of two chromosomal regions adjacent to genes for a type II polyketide synthase involved in the biosynthesis of the antitumor polyketide mithramycin in Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 1999)
comment
mithramycin PKSの上流・下流に位置する2つの染色体領域のクローニング、シークエンスから、8genesを同定。

mtmTI はPKSの下流領域に含まれる。
ChcA, DnrEといったpolyketide ketoreductaseに似ている。

MtmTI, MtmTII and MtmTIII はshort-chain dehydrogenase/reductase protein family (SDR)に属するreductasesに似ている。

MtmTII and MtmTIII はconserved tyrosine/lysine regionを含み、MtmTI も両AAを含むが正確に同じ位置ではないので不活性であると示唆された。しかし、MtmTI に最も似ているChcAは活性があることが示されているreductaseである。

提唱経路への割当はされていない。
Related Reference
ACC
P95727
PmId
[1597409] Purification and characterization of a novel enoyl coenzyme A reductase from Streptomyces collinus. (J Bacteriol. , 1992)
[8955309] Cloning and characterization of the gene encoding 1-cyclohexenylcarbonyl coenzyme A reductase from Streptomyces collinus. (J Bacteriol. , 1996)
[10973220] Identification of a cyclohexylcarbonyl CoA biosynthetic gene cluster and application in the production of doramectin. (Nat Biotechnol. , 2000)
comment
Blast 15th, id40%, 6e-34
Streptomyces collinus_chcA
1-cyclohexenylcarbonyl CoA reductase

---
[PMID: 1597409](1992)
酵素を分離して活性測定。

---
[PMID: 8955309](1996)
E.coliで異種性発現したS. collinus chcAを分離して活性測定。
vitroでcyclohexanecarboxylic acidの形成に関与する3つの還元ステップを触媒する。
S. collinus chcA deletion mutantは、ChcA activityと、cyclohexanecarboxylic acid または ansatrieninを合成する能力を失った。

---
[PMID: 10973220](2000) abstract
S. collinusのansatrienin生合成gene clusterにおける5つのputative CHC-CoA生合成遺伝子を同定。

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selected fasta
>putative oxidoreductase [ketoreductase]
MTTHHSTAPALTGRTALVTGATRGVGFAIARKLCARGADVLLDYAEDEANAARAVGALAG
LPGRAAAVRADVTVDFDALCDEVGQRFGHLDIFVHNTSYFRPAPTLATTPEQVDRSLAVA
LRPLLTGASRLAGLMAGRPGRIVAVSSTGAHRVVPRYAGAGMAKAALESLVRYLAVELAG
RGIAVNAVAAAKVDKGDGTVPAEVAEAITARTPGGRLTRPEDVADAVSLLCTDEARWLQG
QVVTVDGGLGLVAG
selected fasta
>putative oxidoreductase [ketoreductase]
GTGACCACGCACCACTCCACAGCCCCGGCCCTGACCGGCCGCACCGCGCTGGTGACCGGC
GCCACCCGGGGCGTGGGCTTCGCCATCGCCCGCAAACTGTGCGCCCGCGGCGCCGACGTC
CTGCTCGACTACGCCGAGGACGAGGCGAACGCCGCGCGGGCCGTCGGGGCGCTGGCCGGC
CTGCCGGGCCGGGCCGCCGCCGTCCGGGCCGATGTCACCGTCGACTTCGACGCCCTGTGC
GACGAGGTCGGGCAGCGCTTCGGCCACCTCGACATCTTCGTCCACAACACCTCCTACTTC
CGGCCCGCGCCCACCCTCGCCACCACGCCGGAGCAGGTGGACCGCTCCCTGGCCGTGGCG
CTGCGTCCCCTGCTCACCGGGGCCTCCCGGCTGGCCGGGCTAATGGCGGGACGCCCAGGC
AGGATCGTCGCCGTCTCCAGCACCGGTGCCCACCGGGTGGTGCCCCGGTACGCCGGGGCG
GGCATGGCCAAGGCCGCGCTGGAGTCCCTCGTGCGGTACCTCGCGGTGGAGCTGGCCGGA
CGCGGCATCGCCGTCAACGCGGTCGCCGCGGCCAAGGTCGACAAGGGGGACGGGACCGTT
CCGGCCGAGGTCGCCGAGGCGATCACCGCACGTACGCCCGGGGGACGGCTCACCCGCCCC
GAGGACGTCGCCGACGCCGTCAGCCTGCTGTGCACGGACGAGGCGCGCTGGCTGCAGGGC
CAGGTCGTGACGGTCGACGGCGGCCTGGGTCTGGTGGCGGGCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase (Family)
[15-32] 2.90000354677981e-27 PR00081 [88-99] 2.90000354677981e-27 PR00081 [134-150] 2.90000354677981e-27 PR00081 [160-179] 2.90000354677981e-27 PR00081 [181-198] 2.90000354677981e-27 PR00081 [213-233] 2.90000354677981e-27 PR00081
PR00081   GDHRDH
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[11-250] 3.99999999999998e-61 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Mith_00160 Mith_00160   Mith_00180 Mith_00180
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