Oxtet_00060 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces rimosus
Strain	ATCC 10970 (=NBRC 12907)
Entry name	Oxytetracycline
Contig	DQ143963
Start / Stop / Direction	5,521 / 6,777 / + [in whole cluster] 5,521 / 6,777 / + [in contig]
Location	5521..6777 [in whole cluster] 5521..6777 [in contig]
Type	CDS
Length	1,257 bp (418 aa)

Annotation

Category	3.1 modification hydroxylation
Product	C-4 hydroxylase
Product (GenBank)	OxyE
Gene	oxyE otcY1-5
Gene (GenBank)	oxyE
EC number
Keyword	ancillary
Note
Note (GenBank)	putative oxygenase
Reference	ACC Q3S8R0 PmId [16597959] Engineered biosynthesis of a novel amidated polyketide, using the malonamyl-specific initiation module from the oxytetracycline polyketide synthase. (Appl Environ Microbiol. , 2006) [18422316] Identifying the minimal enzymes required for anhydrotetracycline biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2008) [19472250] Identification of OxyE as an ancillary oxygenase during tetracycline biosynthesis. (Chembiochem. , 2009) comment [PMID:16597959](2006) oxytetracycline gene clusterのシークエンス、配列解析。 resistance genes otrAとotrBの間に全21genesを同定。わかりやすくするため、gene namesがotc → oxyに変更され、振り直されている。 oxyE (otcY1-5): Oxygenase OxyE, OxyL, OxyG, and OxyS (OtcC)はそれぞれMtmOI, MtmOII, MtmOIII, and MtmOIVにとても似ているので、oxy and mtm gene clustersは進化的に近く関係する。 OxyEはFAD-dependent monooxygenaseであり、5a,11a-dehydrotetracycline → 5a,11a-dehydrooxytetracycline へのC-5 oxidationを触媒すると推定的に割り当てられている。機能的実験はなし。 --- [PMID:18422316](2008) 完全に機能的なring Aを含む最初の中間体anhydrotetracycline (ATC)の生合成に必要な最小酵素セットの同定と再構築。中間体6-methylpretetramid → ATC の変換にoxygenase候補OxyG, OxyE, or OxyRがあってもなくても、その産物特性と収量に影響なし。 --- [PMID:19472250](2009) oxyE, oxyLの不活化とS. coelicolor CH999におけるoxyABCDJKNF + oxyE発現の産物解析により、OxyEは必須ではないが、より効率的な6-methylpretetramid C-4 hydroxylaseとして役立ち、oxytetracycline生合成において重要な役割をすることが示されている。ここで実際に検出されているのは、いずれも4-hydroxy-6-methylpretetramidではなくその派生体だが、過去に4-hydroxy-6-methylpretetramidが中間体であることがわかっている。 [PMID:18422316](2008)のときにOxyEの機能を同定できなかったことについて、OxyLの強い発現と、競合するshunt glycosylation pathwaysを欠いたせいであると考察している。

Sequence

>C-4 hydroxylase [OxyE]
MTGHPRPPADGAHTDVCVVGGGPAGLTLALLMLRSGARVTLVERSRSLDRAYRGEILQPG
GQALLDALGVLEGARRRGCHEHDGFRLEERGRTLINGDYRRLPGPYNCLLSLPQQHLLTD
LLERCRAHPRFTCLTGTKVNGLVEEGGVVRGVVCGGGADGLVVRADCVVGADGRYSTVRK
LAGIPYDRIELFDQDVLWCKLTAPATRTVRIFRAGGNPVLAYTSFPDCVQLGWTLPHKGY
QALAERGFAHVKERIRAAVPEYADTVDQQLNSFKDVSLLDVFAGSARRWARDGLLLIGDS
AHTHSPIGAQGINLAIQDAVAAHPVLCEGLRRRDLSERFLDAVAARRRPETERATRVQVM
QSRMMLSTGRVSAAVRPKAAMLVSRTPAYRSVLRRIAYGDQTLRVRSDLFEEGEPATV

>C-4 hydroxylase [OxyE]
ATGACCGGCCACCCGCGGCCGCCGGCCGACGGCGCGCACACCGATGTGTGCGTCGTCGGC
GGCGGCCCGGCCGGGCTGACCCTGGCGCTGCTGATGCTGCGCTCGGGGGCGCGGGTGACG
CTGGTCGAGCGCAGCCGCTCACTGGACCGCGCCTACCGGGGCGAGATCCTCCAGCCGGGC
GGGCAGGCCCTGCTCGACGCGCTCGGCGTCCTGGAGGGTGCCCGGCGGCGCGGCTGCCAC
GAGCACGACGGTTTCCGGCTGGAGGAGCGCGGCAGGACCCTGATCAACGGGGATTACCGG
CGGCTGCCCGGCCCGTACAACTGTCTGCTCAGCCTGCCGCAGCAGCATCTGCTGACCGAT
CTGCTGGAGCGCTGCCGGGCCCACCCGCGCTTCACCTGCCTGACCGGCACCAAGGTCAAC
GGGCTGGTGGAGGAGGGCGGCGTGGTGCGCGGTGTGGTGTGCGGCGGCGGGGCGGACGGG
CTCGTGGTGCGCGCGGACTGCGTCGTCGGTGCGGACGGGCGGTATTCGACGGTCCGCAAG
CTGGCCGGCATTCCGTACGACCGCATCGAGCTGTTCGACCAGGACGTGCTGTGGTGCAAG
CTCACCGCGCCCGCCACCCGTACGGTGCGGATCTTCCGGGCCGGCGGCAACCCGGTGCTG
GCCTACACGTCCTTCCCCGACTGCGTACAGCTCGGCTGGACGCTGCCGCACAAGGGCTAC
CAGGCGCTGGCCGAGCGGGGGTTCGCGCACGTCAAGGAGCGTATCCGGGCAGCCGTGCCC
GAGTACGCGGACACGGTGGACCAGCAGCTGAACAGCTTCAAGGACGTGTCTCTGCTGGAT
GTGTTCGCCGGCTCCGCACGGCGGTGGGCGCGCGACGGGCTGCTGCTCATCGGCGACAGC
GCGCACACCCACAGCCCGATCGGGGCCCAGGGCATCAACCTCGCCATCCAGGACGCGGTC
GCCGCGCACCCGGTGCTGTGCGAGGGCCTGCGGCGACGGGACCTGAGCGAGCGGTTCCTC
GACGCGGTCGCGGCGCGGCGCCGTCCGGAGACCGAGCGGGCGACCCGCGTCCAGGTGATG
CAGAGCCGGATGATGCTGTCGACCGGACGCGTTTCGGCGGCCGTCCGCCCGAAGGCGGCG
ATGCTGGTCTCGCGTACCCCGGCCTACCGCTCCGTCCTGCGGCGCATCGCCTACGGCGAC
CAGACACTGCGGGTCCGCTCCGACCTGTTCGAGGAGGGCGAGCCCGCCACCGTCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR002938 Monooxygenase, FAD-binding (Domain) PF01494 FAD_binding_3 IPR003042 Aromatic-ring hydroxylase-like (Domain) PR00420 RNGMNOXGNASE
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Oxtet_00050 Oxtet_00070