Oxtet_00150 Oxtet_00150   Oxtet_00170 Oxtet_00170

Oxtet_00160 : CDS information

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Organism
StrainATCC 10970 (=NBRC 12907)
Entry nameOxytetracycline
Contig
Start / Stop / Direction17,835 / 16,813 / - [in whole cluster]
17,835 / 16,813 / - [in contig]
Locationcomplement(16813..17835) [in whole cluster]
complement(16813..17835) [in contig]
TypeCDS
Length1,023 bp (340 aa)
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Category1.4 Other
Productacyl-ACP thioesterase
Product (GenBank)OxyP
GeneoxyP
otcX3
Gene (GenBank)oxyP
EC number
Keyword
  • type II thioesterase
  • non-acetate starter unit
Note
Note (GenBank)
  • acyltransferase
Reference
ACC
PmId
[16597959] Engineered biosynthesis of a novel amidated polyketide, using the malonamyl-specific initiation module from the oxytetracycline polyketide synthase. (Appl Environ Microbiol. , 2006)
[21622525] Genetic characterization of enzymes involved in the priming steps of oxytetracycline biosynthesis in Streptomyces rimosus. (Microbiology. , 2011)
comment
[PMID:16597959](2006)
oxytetracycline gene clusterのシークエンス、配列解析。
resistance genes otrAとotrBの間に全21genesを同定。
わかりやすくするため、gene namesがotc → oxyに変更され、振り直されている。

oxyP (otcX3): Acyltransferase

ZhuC, FrnKのようなacetyl-ACP thiolasesに高い配列相同性があるので、malonamyl starter unitによる正しい鎖伸長を確実にするためにoxytetracycline生合成でも類似した役割をするかもしれない。

---
[PMID:21622525](2011)
OxyPの不活化でmalonamate-primed oxytetracycline生合成はなくならないが、acetate-primed 2-acetyl-2-decarboxyamido-oxytetracyclineの比率が有意に増加する。よって、OxyP は競合するacetate priming starter unitsの加水分解を介してamide-priming過程の忠実度を維持する。
Related Reference
ACC
Q9F6D9
NITE
R1128_00030
PmId
[15260498] The acyltransferase homologue from the initiation module of the R1128 polyketide synthase is an acyl-ACP thioesterase that edits acetyl primer units. (Biochemistry. , 2004)
comment
Blast 15th, id51%, 6e-64
Streptomyces sp. R1128_zhuC
Acyl transferase

tcm minimal PKS genesとの発現でZhuCの役割を確認。
tcm minimal PKSは非acetateなacyl基で直接primeされることができる。
ZhuCがあるとacetate-primed decaketides合成がなくなり、hexanoyl-primed octaketides合成のみになる。
ZhuCは、hexanoyl- and octanoyl-ACPより100倍よい特異性をacetyl- and propionyl-ACPに持つ。
ZhuCはacyl-ZhuG から holo-ZhuNへのtransacylationを触媒するが、そのacyl移動率はin vivoで生理学的に関連するためには遅すぎる。

よってZhuCはacetyl-ACP thioesteraseとして働き、PKS伸長moduleをprimeするalkylacyl-ZhuGと競合するacetate primer unitsを一掃する。

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selected fasta
>acyl-ACP thioesterase [OxyP]
MTADTKATGAPAARAPRPVALLLPGQGSQYRRMAAGLYAAEPVFAEAVDEVLGAMGAEGA
RMHADWLAERPELPVDHVLRAQPLLFAVDYALGRLVTSWGIRPVALLGHSIGEMAAATLA
GVFTVRDAARVVLDRVTRLTAAPPGGMLAVAESAASLEPFLGDGVVVGAVNAPRQTVLGG
PEDALRAVGETLRARGITAQRVPALSPFHSPAIAPHARGAEAVLATVERRPPRTVVHSCY
TAAPLTAQQVADPAYWAAHPVDQVRFWPALDGLLAPGGLVVVEAGPGRTLSSLALRHPSV
RRGDCMVVPLSPKRADGPEDDRVALGEAVDALRGEGYRIP
selected fasta
>acyl-ACP thioesterase [OxyP]
ATGACGGCGGACACGAAGGCCACCGGGGCGCCCGCCGCACGGGCGCCCCGGCCGGTGGCG
CTGCTGCTGCCCGGCCAGGGCTCCCAGTACCGGCGGATGGCGGCGGGGCTGTACGCGGCC
GAGCCGGTCTTCGCCGAGGCGGTCGACGAGGTGCTGGGCGCGATGGGGGCCGAGGGCGCC
CGTATGCACGCCGACTGGCTGGCCGAGCGGCCGGAGCTGCCGGTGGACCACGTACTGCGG
GCGCAGCCGCTGCTGTTCGCCGTCGACTACGCGCTCGGCCGCCTGGTGACGAGCTGGGGC
ATCCGTCCGGTGGCGCTGCTCGGCCACAGCATCGGCGAGATGGCGGCCGCCACGCTCGCC
GGGGTGTTCACGGTGCGCGACGCCGCGCGGGTGGTGCTCGACCGGGTGACGCGGCTGACG
GCCGCGCCCCCGGGCGGCATGCTGGCGGTGGCGGAGTCCGCCGCGTCGCTGGAACCTTTC
CTCGGCGACGGCGTGGTGGTCGGCGCCGTCAACGCGCCGCGGCAGACCGTACTCGGAGGG
CCGGAGGACGCGCTGCGCGCCGTGGGGGAGACCCTGCGGGCCCGCGGCATCACCGCCCAG
CGGGTCCCCGCGCTCAGCCCGTTCCACAGCCCGGCGATCGCCCCGCACGCCAGGGGCGCC
GAGGCGGTGCTCGCCACGGTGGAACGCCGGCCGCCGCGCACCGTGGTCCACTCCTGCTAC
ACGGCCGCACCACTGACGGCCCAGCAGGTCGCCGACCCCGCGTACTGGGCCGCGCACCCC
GTGGACCAGGTGCGCTTCTGGCCCGCTCTGGACGGGCTGCTGGCGCCCGGCGGACTGGTG
GTGGTCGAAGCGGGACCCGGCCGTACGCTGTCGAGCCTCGCCCTGCGCCACCCCTCCGTA
CGCCGTGGGGACTGCATGGTCGTACCGCTGTCACCTAAGCGGGCGGATGGGCCGGAGGAT
GACCGGGTGGCTTTGGGGGAGGCGGTGGACGCCTTGCGGGGTGAGGGGTACCGGATTCCC
TGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
[13-142] 2.4e-53 G3DSA:3.40.366.10 [206-310] 2.4e-53 G3DSA:3.40.366.10
G3DSA:3.40.366.10   Ac_transferase_reg
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
[23-291] 1.80000000000002e-45 PF00698
PF00698   Acyl_transf_1
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
[18-298] 7.79998304125571e-46 SSF52151
SSF52151   Acyl_Trfase/lysoPlipase
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
[143-204] 2.79999889404114e-12 SSF55048
SSF55048   Malonyl_transacylase_ACP-bd
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
[22-315] 1.10000150671643e-59 SM00827
SM00827   PKS_AT
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Oxtet_00150 Oxtet_00150   Oxtet_00170 Oxtet_00170
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