Madu_00070 : CDS information

Location

Organism	Actinomadura madurae
Strain	ATCC 39144
Entry name	Maduropeptin
Contig	AY271660
Start / Stop / Direction	14,848 / 13,466 / - [in whole cluster] 14,848 / 13,466 / - [in contig]
Location	complement(13466..14848) [in whole cluster] complement(13466..14848) [in contig]
Type	CDS
Length	1,383 bp (460 aa)

Annotation

Category	3.3 modification reduction
Product	putative monooxygenase
Product (GenBank)	epoxidase
Gene
Gene (GenBank)	mdpL
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC B0BLL6 PmId [17918933] Characterization of the maduropeptin biosynthetic gene cluster from Actinomadura madurae ATCC 39144 supporting a unifying paradigm for enediyne biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2007) comment Maduropeptin生合成遺伝子クラスターの報告 mdpL: Epoxide hydrolase C-1027, Neocarzinostatinと配列比較して、MdpLはepoxide hydrolaseであるとしている。 Maduropeptin enediyne coreの形成に関与すると推定している。
Related Reference	ACC B5M9L6 NITE Lasal_00200 PmId [22506807] Sequential enzymatic epoxidation involved in polyether lasalocid biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2012) [23796908] Biosynthetic machinery of ionophore polyether lasalocid: enzymatic construction of polyether skeleton. (Curr Opin Chem Biol. , 2013) comment Blast id37% Streptomyces lasaliensis ATCC 35851_lsd18 Putative epoxidase GenBank,UniprotではATCC31180と登録されているが、clusterの報告論文[PMID:19129623]ではATCC35851であるとされている。 --- [PMID:22506807](2012) Lsd18がprelasalocidのbisepoxylasalocidへのsequential epoxydationに関与するようだ。酵素学的エポキシ化反応の解析。 --- [PMID:23796908](2013) Lsd18,Lsd19について続報有り。abstract only.
	ACC B5M9L6 NITE Lasal2_00240 PmId [19025863] Analysis of specific mutants in the lasalocid gene cluster: evidence for enzymatic catalysis of a disfavoured polyether ring closure. (Chembiochem. , 2008) comment Blast id37% Streptomyces lasaliensis NRRL3382R(ATCC 31180)_lasC Putative epoxidase S. lasaliensis ATCC31180におけるLasalocid生合成gene clusterの報告。 lasC deletion mutant作製し機能推定している。 flavin-linked epoxidaseをコードしていると予測されているlasCを欠損すると、lasalocidとiso-lasalocid両方の生産ができなかったことから、full-length polyketide productの放出より前にポリエーテル環の酸化的環化がPKSで行われていると思われる。また、相補実験の結果から、PKS結合dieneがLasC, LasBの基質であると推測された。
	ACC Q846W9 NITE Monen_00220 PmId [12940979] Analysis of the biosynthetic gene cluster for the polyether antibiotic monensin in Streptomyces cinnamonensis and evidence for the role of monB and monC genes in oxidative cyclization. (Mol Microbiol. , 2003) comment Blast id34% Streptomyces cinnamonensis_monC1 Monensin epoxidase Streptomyces cinnamonensisのmonensin biosynthetic gene clusterにおけるmonB と monCの機能について調べた文献。 monCI について、S. coelicolorにおけるHeterologous expressionを行ったところ、linaloolをlinalool oxideにepoxidizeする能力が10-20倍に増加することを確認している。

Sequence

>putative monooxygenase [epoxidase]
MSELGKRAVVLGGSMAGTLAARVLSEFYGEVLVVERDAVLGVRTPRRGAPHTVHAHGLHA
RGHLIVEELFPGLTDELRADGVPTGDIAGMRWYFNARRIMPADTGLVSLTAPRPVLEAHV
RARTAALPGVTYLERHSIIGLLTTADRTRVTGVRVERRDEPGEIELEADVVVDATGRGSR
TPAWLEELGYRRPEEERVKVGLAYTTRHYRTRPEWFDGVQSINPVASPAHPRGAFFGQVG
PDTCILSLTGILGDHPPTDPEAFLEFARTLPVPDVYEAVRDGEALDDPVSFRFPASVRRR
YERLDRFPDRLLVLGDAVCSFNPVYGQGMSVAAIEAMELRRHLRQGAPRPAEYLTAVARA
VDAPWEVSAGGDLDFPGVEGRRTLKVRAGNAYMARLQYAATKDPKVTEGFMRVAGLMDPP
TALMRPGMAARVLRHAIRRPAPGRSWLDGRSPAADPARSS

>putative monooxygenase [epoxidase]
ATGAGTGAACTCGGAAAGCGGGCCGTGGTTCTGGGCGGCAGCATGGCGGGCACGCTCGCC
GCGCGGGTCCTTTCGGAATTCTACGGCGAGGTCCTGGTCGTCGAACGTGACGCGGTGCTC
GGTGTCCGGACGCCGAGGCGGGGGGCACCGCACACCGTCCACGCGCACGGCCTGCACGCG
CGCGGCCACCTGATCGTGGAGGAGCTGTTCCCCGGCCTCACCGACGAGCTGCGCGCGGAC
GGGGTGCCGACCGGGGACATCGCGGGGATGCGCTGGTACTTCAACGCCCGGCGGATCATG
CCGGCCGACACCGGGCTGGTGTCGCTGACGGCCCCGCGCCCCGTCCTGGAGGCGCACGTC
CGGGCGCGGACGGCCGCGCTGCCCGGGGTCACCTACCTGGAGCGGCACTCGATCATCGGC
CTGCTGACCACCGCGGACCGCACCCGGGTCACCGGGGTCCGGGTGGAGCGGCGGGACGAG
CCCGGGGAGATCGAGCTGGAGGCCGACGTGGTCGTGGACGCCACCGGGCGGGGCTCCCGG
ACCCCCGCCTGGCTGGAGGAGCTCGGCTACCGGCGGCCGGAGGAGGAACGCGTCAAGGTC
GGCCTGGCGTACACGACGCGGCACTACCGGACGCGGCCGGAGTGGTTCGACGGCGTCCAG
TCGATCAACCCGGTGGCGTCCCCGGCCCATCCGCGGGGCGCGTTCTTCGGCCAGGTCGGG
CCGGACACCTGCATCCTGTCGCTCACCGGGATCCTCGGCGACCATCCGCCGACCGATCCG
GAGGCGTTCCTGGAGTTCGCGCGGACCCTCCCCGTCCCGGACGTCTACGAGGCGGTCCGC
GACGGCGAGGCCCTCGACGACCCGGTCAGCTTCCGCTTCCCGGCGAGCGTCCGGCGCCGG
TACGAGCGGCTCGACCGGTTCCCCGACCGGCTGCTCGTGCTGGGCGACGCCGTGTGCAGC
TTCAACCCCGTCTACGGGCAGGGCATGAGCGTCGCGGCGATCGAGGCCATGGAGCTGCGC
CGGCACCTGCGGCAGGGGGCGCCCCGCCCCGCCGAGTACCTCACCGCGGTCGCCCGCGCG
GTCGACGCCCCGTGGGAGGTGTCCGCGGGCGGTGACCTCGACTTCCCGGGGGTGGAGGGC
CGCCGCACGCTGAAGGTCCGCGCCGGCAACGCCTACATGGCGCGCCTCCAGTACGCGGCG
ACGAAGGACCCGAAGGTCACCGAGGGGTTCATGCGCGTGGCCGGGCTCATGGACCCTCCC
ACCGCGCTCATGCGCCCCGGCATGGCCGCCCGCGTCCTGCGCCACGCGATCCGCAGGCCG
GCTCCGGGCCGGTCCTGGCTGGACGGCCGGTCCCCGGCGGCCGACCCGGCCCGCTCCTCC
TGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Madu_00060 Madu_00080