C1027_00080 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces globisporus
Strain	C-1027
Entry name	C-1027
Contig	AY048670
Start / Stop / Direction	11,349 / 9,982 / - [in whole cluster] 11,349 / 9,982 / - [in contig]
Location	complement(9982..11349) [in whole cluster] complement(9982..11349) [in contig]
Type	CDS
Length	1,368 bp (455 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	putative transporter
Product (GenBank)	Na/H efflux pump
Gene	sgcB3
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	ORF0
Reference	ACC Q8GMI2 PmId [12183628] Biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (Science. , 2002) comment C-1027の生合成遺伝子クラスターの報告 Fig.2にてcluster内に表示されているのみ。特にふれていない。
Related Reference	ACC Q9SUQ7 PmId [15341627] ( , ) [17133624] ( , ) comment Arabidopsis thaliana_CHX17 Putative Na+/H+-exchanging protein [27%id, 2e-34] [PMID:15341627] expression studies, and phenotypic analysis of knockout mutantsを行いAtCHX17の機能解析をしている。 K(+)の獲得と恒常性に関与することを示した。 [PMID:17133624] Arabidopsis thaliana由来のAtCHX17 cDNAは、S. cerevisiae cellsのkha1Delta mutationのphenotypeを相補した。 AtCHX17はcation/H(+) antiporterの機能を持つことが明らかになった。
Related Reference	ACC P40309 PmId [9811642] ( , ) [15659172] ( , ) comment Saccharomyces cerevisiae_KHA1 K(+)/H(+) antiporter 1 [26%id, 3e-32] [PMID:9811642] Kha1がK(+)/H(+) antiporter であると証明。 [PMID:15659172] kha1 deletion mutant作製。Kha1 proteinの主な機能は以前報告したplasma membraneを介したpotassium effluxではなかったが、ion homeostasisやpH controlに関与していることを示した。
Family/Domain	FD IPR006153 comment [IPR006153] Cation/H+ exchanger (Domain)

Sequence

>putative transporter [Na/H efflux pump]
MAVLAATSPLGGEPLTVFLLQVGLLLACAYGLGRLGTRIGLPPLVGELTAGVLLGPTLLG
QISPGLSGRLFPEDISQAHLLDAFCQFGVLLLVAIAGAQFDPRILRKRGGLAARVSLAGL
LIPLGLGIATGYLVPASLLADSGERGVFALFLGVAMCVTALPVIAKTLADLNLTHRNVGQ
LLIAAAVFDDAVGWLLLALVTALASGAAGGPVVLTTMAWTTVFVAAACAVGGPIGRRLSR
TGDSRVPVSAVTVGVAVVVLYGALTAAAGMEALFGAFVAGATLLRHIAPVRLAPLRTLVM
AVFAPVFLGSVGLRMDLTALAEPSVLLTGLGVLLVATFGKFAGAYVAARSGGMSRYEGLA
LGAGMNSRGMIEVVIALVGLRIGVLDTVTFTIIVLVALITSVTAPPILRWASSRIVLEED
ETERGDRLAGWNTEPALSGGPAPKSAREEKTPDTS

>putative transporter [Na/H efflux pump]
GTGGCTGTGCTCGCAGCCACGTCGCCGCTGGGCGGGGAGCCGCTGACGGTCTTCCTGCTC
CAGGTCGGCCTCCTGCTCGCCTGTGCCTACGGTCTGGGACGGCTGGGGACCCGGATCGGT
CTGCCGCCGCTGGTGGGGGAGCTGACCGCGGGGGTACTGCTCGGGCCGACCCTGCTGGGG
CAGATCTCGCCGGGACTTTCCGGCAGGCTGTTTCCCGAGGACATCTCGCAGGCGCACCTG
CTCGACGCGTTCTGCCAGTTCGGCGTCCTTCTGCTGGTGGCCATCGCAGGTGCCCAGTTC
GACCCCCGGATCCTGCGCAAGCGCGGGGGTCTGGCCGCCCGGGTCAGCCTGGCGGGTCTT
CTGATTCCTCTGGGGCTGGGCATCGCCACCGGCTACCTGGTGCCCGCCTCGCTGCTCGCG
GACTCCGGAGAGCGGGGCGTCTTCGCGCTGTTCCTCGGGGTCGCGATGTGTGTCACGGCC
CTCCCGGTGATCGCCAAGACGCTCGCCGACCTGAATCTGACGCACCGCAACGTCGGCCAG
CTGCTCATCGCGGCAGCGGTGTTCGACGACGCGGTGGGCTGGCTGCTGCTCGCTCTGGTG
ACGGCGCTGGCGAGTGGGGCGGCCGGGGGGCCCGTGGTCCTGACCACGATGGCCTGGACG
ACCGTCTTCGTCGCCGCGGCGTGTGCGGTGGGCGGCCCGATCGGCAGGCGGCTGTCCCGT
ACGGGTGACAGCCGGGTCCCCGTATCGGCCGTCACCGTCGGCGTGGCCGTGGTCGTCCTG
TACGGGGCGCTGACCGCGGCGGCCGGGATGGAGGCGTTGTTCGGGGCGTTCGTGGCCGGT
GCGACCCTGCTGAGGCACATCGCCCCGGTACGGCTCGCCCCGCTGCGCACGCTGGTCATG
GCCGTGTTCGCACCGGTGTTCCTGGGCAGTGTGGGGCTTCGCATGGACCTGACCGCACTC
GCGGAGCCGTCGGTGCTGCTCACGGGCCTCGGGGTGCTGTTGGTGGCCACTTTCGGCAAG
TTCGCCGGTGCGTACGTCGCCGCCCGTAGTGGCGGGATGAGCCGCTACGAGGGGCTGGCG
CTCGGAGCGGGGATGAACTCGCGTGGAATGATCGAGGTGGTGATCGCCCTGGTCGGCCTG
CGTATCGGCGTACTGGACACCGTGACCTTCACGATCATCGTGCTGGTCGCCCTCATCACC
TCGGTGACGGCGCCGCCGATCCTGCGCTGGGCGAGCAGCCGGATCGTTCTCGAGGAGGAC
GAGACGGAGCGGGGGGATCGGCTGGCGGGGTGGAACACGGAGCCGGCCCTGTCCGGCGGG
CCGGCCCCCAAGTCAGCACGGGAGGAGAAGACCCCGGACACCTCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR006153 Cation/H+ exchanger (Domain) PF00999 Na_H_Exchanger
SignalP	No significant hit
TMHMM	Transmembrane 11

C1027_00070 C1027_00090