Calm_00520 : CDS information

Location

Organism	Micromonospora echinospora
Strain	NRRL 15839
Entry name	Calicheamicin
Contig	AF497482
Start / Stop / Direction	61,975 / 60,938 / - [in whole cluster] 61,975 / 60,938 / - [in contig]
Location	complement(60938..61975) [in whole cluster] complement(60938..61975) [in contig]
Type	CDS
Length	1,038 bp (345 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	putative C-3 O-methyltransferase
Product (GenBank)	CalO1
Gene
Gene (GenBank)	calO1
EC number	2.1.1.-
Keyword	orsellinic acid moiety
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q8KNE5 PmId [12183629] The calicheamicin gene cluster and its iterative type I enediyne PKS. (Science. , 2002) [21358050] Structural characterization of CalO1: a putative orsellinic acid methyltransferase in the calicheamicin-biosynthetic pathway. (Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. , 2011) comment [PMID:12183629] calicheamicin生合成遺伝子クラスターの報告このORFは、Fig2の生合成clusterにて、CalO1-CalO6がorsellinic acid 生合成遺伝子と示されているのみ。本文中では特にふれていない。 [PMID:21358050] CalO1の機能解析 cofactor (S-adenosylhomocysteine)に結合したCalO1の結晶構造解析論文(2.4 Å resolution)。CalO1とCalO6の立体構造比較を行っている。CalO1とCalO6基質は似たような分子構造を共有していると思われ、基質結合領域のいくつかの残基の違いが基質再配向に影響を与え、その結果2つの酵素間で位置特異性の違いを生むと推定される。 CalO1は結晶構造解析より、O-methyltransferasesのcommon foldを示し、ACP-bound substrateを要求するかもしれないことが示された。CalO1は二つのドメインで構成されN-term domain(Met1-Ala135)は、dimer形成に関与するalpha-helicesを構築し(Phe136-Ala345)、C-term domainはalpha/beta Rossmann foldを導入するsolvent-exposed active siteを含み、主にcofactor/substrate bindingに関与すると示された。基質C3 hydroxyl基の脱プロトン化に関して、His255のproper orientationを仲介するためのAsp283とGlu310と共にHis255がCalO1の触媒残基であると提案した。

Sequence

>putative C-3 O-methyltransferase [CalO1]
MQRQRPPSRAGGDMDRLQSALALYEEAMGYTYAAALRAAAAVGVADHLVDGPRTPAELAA
ATGTDADALRRVLRLLAVRDVVRESDGRFALTDKGAALRSDSPVPARAGILMFTDTMFWT
MSHRVASALGPERPAFADIFGSSLDAYFDGDAEVEALYYEGMETVSAAEHLILARAGDFP
ATGTVADVGGGRGGFLLTVLREHPGLQGVLLDRAEVVARHRLDAPDVAGRWKVVEGDFLR
EVPHADVHVLKRILHNWGDEDSVRILTNCRRVMPAHGRVLVIDAVVPEGNDAHQSKEMDF
MMLAARTGQERTAAELEPLFTAAGLRLDRVVGTSSVMSIAVGVPA

>putative C-3 O-methyltransferase [CalO1]
GTGCAGCGGCAGCGTCCGCCATCACGGGCCGGAGGGGACATGGACAGGTTGCAGTCGGCG
CTGGCCCTCTACGAGGAGGCGATGGGCTACACGTACGCGGCAGCCCTGCGGGCCGCCGCC
GCCGTCGGCGTCGCCGACCACCTGGTCGACGGCCCCCGTACGCCCGCCGAGCTGGCCGCC
GCGACGGGCACCGACGCGGACGCGCTCCGCCGGGTGCTGCGCCTGCTGGCGGTCCGCGAC
GTGGTCCGCGAGTCCGACGGCCGGTTCGCGCTGACCGACAAGGGCGCGGCGCTGCGGTCG
GACTCGCCGGTGCCCGCGCGGGCCGGCATCCTCATGTTCACCGACACGATGTTCTGGACG
ATGAGTCACCGGGTGGCGAGCGCGCTGGGGCCGGAGCGACCCGCCTTCGCCGACATCTTC
GGTAGCTCGCTGGACGCCTACTTCGACGGCGACGCCGAGGTCGAGGCGCTCTACTACGAG
GGCATGGAAACGGTCAGCGCGGCGGAGCACCTCATTCTCGCCCGCGCCGGTGACTTCCCC
GCCACCGGCACCGTGGCGGACGTCGGCGGCGGCCGGGGCGGCTTCCTGCTCACCGTCCTA
CGCGAGCACCCCGGCCTGCAGGGCGTGCTGCTGGACCGCGCGGAGGTGGTCGCCCGGCAC
CGGCTGGACGCCCCGGACGTGGCGGGGCGCTGGAAGGTTGTCGAGGGCGACTTCCTCCGC
GAGGTGCCCCACGCCGACGTGCACGTGCTCAAGCGCATCCTGCACAACTGGGGCGACGAG
GACAGCGTCCGGATCCTGACGAACTGCCGCCGGGTCATGCCCGCGCACGGCCGGGTGCTC
GTGATCGACGCGGTCGTCCCCGAGGGCAACGACGCGCACCAGAGCAAGGAGATGGACTTC
ATGATGCTCGCCGCGCGCACCGGCCAGGAACGCACCGCCGCCGAGCTGGAGCCGTTGTTC
ACCGCGGCCGGGCTGCGCCTGGACCGGGTCGTCGGCACCTCGTCGGTCATGTCCATCGCG
GTCGGCGTGCCGGCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001077 O-methyltransferase, family 2 (Domain) PF00891 Methyltransf_2 IPR011991 Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (Domain) G3DSA:1.10.10.10 Wing_hlx_DNA_bd IPR016461 O-methyltransferase, caffeic acid-type (Family) PIRSF005739 O-mtase
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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