A4793_00260 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces toyocaensis
Strain	NRRL 15009
Entry name	A47934
Contig	U82965
Start / Stop / Direction	57,481 / 58,581 / + [in whole cluster] 57,481 / 58,581 / + [in contig]
Location	57481..58581 [in whole cluster] 57481..58581 [in contig]
Type	CDS
Length	1,101 bp (366 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative 4-hydroxymandelate oxidase
Product (GenBank)	Hmo
Gene	hmo ORF8
Gene (GenBank)
EC number	1.1.3.46
Keyword	Hpg
Note
Note (GenBank)	p-hydroxymandelate oxidase
Reference	ACC Q8KLK1 PmId [12060705] Assembling the glycopeptide antibiotic scaffold: The biosynthesis of A47934 from Streptomyces toyocaensis NRRL15009. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2002) comment Streptomyces toyocaensis NRRL15009由来A47934生合成gene clusterの同定論文。 34のORFsからなるclusterは、A47934の生合成とその調節に必要だと予測される遺伝子をすべて含む。グリコペプチド耐性を担う酵素をコードするORFsも含む。 Hmo: p-Hydroxymandelate oxidase 配列解析のみ。ORFs 8-11は4-hydroxyphenylglycine(HPG)生合成で機能すると予想される。
Related Reference	ACC O52792 NITE Chlor_00230 PmId [11137816] Biosynthesis of L-p-hydroxyphenylglycine, a non-proteinogenic amino acid constituent of peptide antibiotics. (Chem Biol. , 2000) [12240298] Characterisation of a hydroxymandelate oxidase involved in the biosynthesis of two unusual amino acids occurring in the vancomycin group of antibiotics. (Chem Commun (Camb). , 2001) comment BLAST id64% Amycolatopsis orientalis PCZA361.2 --- [PMID: 11137816](2000) L-p-hydroxyphenylglycine(Hpg)はvancomycinグループの抗生物質のaglyconeで構造的役割をする。L-p-hydroxyphenylglycineを生合成する経路に提唱された酵素の特徴づけを、chloroeremomycin生合成gene clusterのタンパクで確認している。 Hmo(ORF22)をmaltose binding protein (MBP)とのfusion proteinとしてクローニングし、活性測定に使用。反応産物はHPLCのretention timeの一致で判断されている。 Hmoにより、D,L-p-hydroxymandelateの半分がp-hydroxybenzoylformateへと変換された。 D- and L-mandelateを基質とすると、L-mandelateのみがbenzoylformateへと変換された。以上から拡大解釈して、Hmoの基質にL-p-hydroxymandelateを割り当てた。 p-hydroxyphenylpyruvateはHmoによって変換されず、HmaS(ORF21)とHmoの両方があるときにp-hydroxybenzoylformateまで変換された。この論文で、HmaSはp-hydroxyphenylpyruvate → p-hydroxymandelateへの変換を触媒することが確認されている。 prephenate ↓　prephenate dehydrogenase (ORF1) p-hydroxyphenylpyruvate ↓　4-hydroxymandelate synthase (ORF21, HmaS) L-p-hydroxymandelate ↓　L-p-hydroxymandelate oxidase (ORF22, Hmo) p-hydroxybenzoylformate ↓　L-p-hydroxyphenylglycine transaminase (ORF17, HpgT) L-p-hydroxyphenylglycine --- [PMID: 12240298](2001) chloroeremomycin gene cluster由来ORF22がクローニング、発現、精製された。このタンパクは、4-hydroxymandelic acid または 3,5-dihydroxymandelic acidを基質として、対応するケト酸を産生することが確認された。この結果からORF22はhydroxymandelate oxidase (HmO)として特徴づけされ、(S)-4-hydroxyphenylglycine と (S)-3,5-dihydroxyphenylglycineの両方の形成に関与する。また、flavin-dependent enzymeであるHmOが、dehydrogenaseではなくoxidaseであることをH2O2の生成から確認している。

Sequence

>putative 4-hydroxymandelate oxidase [Hmo]
MGHGSETAAAPAHCLADFERAAASVLPADVRDFVAGGSGAEVTLDANRTALDRVFLVPRV
LRDVSRCTADSTLLKRPVPMPVAVAPVAYQQLVHPDGERAAARAAKAAGVPFTASTLSSV
PIEELTAIGGTVWFQLYRLRDAAQSLELVRRAEDAGCEAIMLTVDVPWMGRRLRDVRNRF
ALPSHVRAANISTGSTAHRRHADSSAVAVHTGQAFSSATTWSSLAALRKQTRLPLLLKGV
LAAEDAVRAVESGVDAVVVSNHGGRQLDGAVPSIDVLPEVAAAVNDGCEVLLDSGIRSGT
DVLRALALGASGVLVGRPLIWGLAAAGEAGARRVLDLLADELRDALGLSGCDGVAAARQL
RTLVPG

>putative 4-hydroxymandelate oxidase [Hmo]
GTGGGCCACGGCAGTGAGACGGCGGCCGCTCCGGCCCACTGCCTGGCCGACTTCGAACGC
GCCGCCGCTTCGGTCCTGCCCGCCGACGTGCGGGACTTCGTCGCGGGAGGAAGCGGAGCC
GAGGTCACGCTCGACGCCAACCGCACCGCGCTGGACCGCGTCTTCCTCGTCCCCCGGGTG
CTCAGGGACGTGTCGCGGTGCACGGCTGACTCCACCCTGCTGAAGCGGCCCGTCCCGATG
CCGGTCGCCGTCGCGCCCGTCGCCTACCAGCAACTGGTCCACCCCGATGGCGAGAGGGCC
GCCGCCCGGGCGGCCAAGGCGGCCGGCGTGCCGTTCACCGCGAGCACGCTGAGCAGTGTC
CCGATCGAAGAGCTCACGGCGATCGGCGGAACGGTCTGGTTCCAGCTCTACCGGCTCCGG
GACGCCGCGCAGTCCCTGGAACTCGTCCGCAGAGCGGAGGACGCGGGCTGTGAGGCGATC
ATGCTCACCGTCGACGTGCCGTGGATGGGGCGCCGGCTGCGCGACGTACGCAACCGTTTC
GCCCTGCCCAGCCATGTGCGGGCGGCCAACATCAGCACCGGCTCGACCGCGCACCGACGG
CATGCCGACAGCTCCGCGGTAGCCGTCCACACGGGCCAGGCCTTCTCCTCCGCGACGACG
TGGTCGTCGTTGGCGGCCCTGCGGAAGCAGACCCGGCTCCCCCTGCTGCTCAAGGGTGTC
CTGGCGGCCGAGGACGCGGTGCGGGCGGTCGAGTCCGGGGTCGACGCGGTCGTGGTCTCC
AACCACGGGGGCCGCCAGCTTGACGGAGCCGTTCCCAGCATCGATGTGCTGCCGGAGGTG
GCCGCGGCCGTGAACGACGGCTGCGAAGTGCTGTTGGACAGCGGCATCCGCAGCGGCACC
GACGTGCTCAGGGCGCTCGCTCTCGGGGCGTCCGGTGTCCTGGTGGGCCGACCGCTGATC
TGGGGCCTGGCCGCGGCCGGAGAGGCCGGTGCCCGCCGGGTGCTCGACCTGCTGGCCGAC
GAACTCCGCGACGCCCTCGGCCTGTCGGGCTGCGACGGTGTCGCCGCGGCCAGGCAGTTG
CGCACCCTCGTCCCCGGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR000262 FMN-dependent dehydrogenase (Domain) PF01070 FMN_dh IPR008259 FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site (Active_site) PS00557 FMN_HYDROXY_ACID_DH_1 IPR012133 Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent (Family) PIRSF000138 Al-hdrx_acd_dh PS51349 FMN_HYDROXY_ACID_DH_2 IPR013785 Aldolase-type TIM barrel (Domain) G3DSA:3.20.20.70 Aldolase_TIM
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

A4793_00250 A4793_00270