Balhi_00200 : CDS information

Location

Organism	Amycolatopsis balhimycina
Strain	DSM 5908
Entry name	Balhimycin
Contig	Y16952
Start / Stop / Direction	46,265 / 47,119 / + [in whole cluster] 46,265 / 47,119 / + [in contig]
Location	46265..47119 [in whole cluster] 46265..47119 [in contig]
Type	CDS
Length	855 bp (284 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	putative SAM-dependent N-methyltransferase
Product (GenBank)	putative N-methyl transferase
Gene
Gene (GenBank)	bmt
EC number	2.1.1.-
Keyword	Leu1
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q939Y5 PmId [12404385] The Biosynthesis of Vancomycin-Type Glycopeptide Antibiotics-The Order of the Cyclization Steps This work was supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (SFB 323) and by a grant of the EU (MEGATOP, QLK3-1999-00650). R. D. S. gratefully acknowledges the support of a Feodor-Lynen Fellowship granted by the Alexander-von-Humboldt Stiftung. We thank Corina Bihlmaier and Volker Pfeifer for help with transformation and Southern hybridization, J. A. Moss (La Jolla (USA)) for critical comments on the manuscript and Prof. Dr. M. E. Maier and Prof. Dr. H.-P. Fiedler (Tubingen) for generous support. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2001) [12596194] Vancomycin assembly: nature's way. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2003) comment Amycolatopsis balhimycina_bmt Putative N-methyl transferase このORFを同定した論文は不明。 --- [PMID: 12596194](2003) グリコペプチド系抗生物質の生合成に関するレビュー。 PMID: 12404385で、balhimycin生合成において架橋形成を担う遺伝子のmutant株で蓄積した線状の前駆体と部分的に架橋形成された前駆体はN-メチル化されていなかったことから、N-メチル化はおそらく完全に架橋形成がされた後に起こり、それからglycosylationが起こると示唆される。（しかしPMID: 12404385では、完全に環化されていないbicyclic C-O-D-O-E ring中間体が、1LeuのN-methylationと、4HpgのO-glycosylationの基質となりえることがわかっている。）
Related Reference	ACC O52805 NITE Chlor_00170 PmId [19389626] Structure and function of the glycopeptide N-methyltransferase MtfA, a tool for the biosynthesis of modified glycopeptide antibiotics. (Chem Biol. , 2009) comment BLAST id78% Amycolatopsis orientalis (Nocardia orientalis) PCZA361.24 Orf16/MtfAに相当するentry. --- [PMIDなし]Expression and assay of an N-methyltransferase involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. Chem. Commun., 2000, p103-104 MtfA(ORF16)をクローニング、発現、精製して測定に使用。 N-demethylvancomycin, そのaglycone, 環化されていない線状heptapeptide, (R)- and (S)-leucineを基質としてメチル化の程度を確認。基質を2つ用いた競合実験の結果もふまえ、chloroeremomycinの生合成経路におけるN-メチル化はheptapeptide骨格の酸化的架橋形成の後、ring 4 disaccharideの付加の前に起こると示唆される。 --- [PMID: 19389626](2009) MtfAは、vancomycin骨格を持つchloroeremomycinと違いteicoplanin骨格を持つdesulfo-A47934とteicoplaninを、SAM依存的様式でメチル化することができた。さらにMtfAとMtfA複合体の結晶構造を解析している。
Related Reference	ACC R4T056 PmId [24884615] Complete genome sequence and comparative genomic analyses of the vancomycin-producing Amycolatopsis orientalis. (BMC Genomics. , 2014) comment BLAST id72% Amycolatopsis orientalis HCCB10007_AORI_1490 vancomycinの大量産生に使用されているA. orientalis ATCC 43491由来工業用菌株HCCB10007の完全ゲノムシークエンス。そこからvcm cluster(AORI_1471-1505)を同定し、いくつかの遺伝子のmutantsを作製してin vivo機能を特徴づけている。 AORI_1490(vmt): Methyltransferase mutant作成あり。vmt mutantはdemethylvancomycinを蓄積した。demethylvancomycinの生物活性はvancomycinに匹敵する。 demethylvancomycin or aglucovancomycinを基質として、異種性発現したAORI_1490はdimethylvancomycin or dimethylaglucovancomycinを生成した。2つのメチル基はLeuのN末にある。メチル化はin vitroでも抗菌活性に影響しなかった。

Sequence

>putative SAM-dependent N-methyltransferase [putative N-methyl transferase]
MSGQLERGPVRTTHADVLLASVGERGVLCDFYDEEGSNTYRDLIQDADGTPEAREFATRV
GPVPGPVLELAAGTGRLTFPFLELGWEVTALELSAPVVDGFRMRLAEAPADLRDRCTVVQ
ADMSAFSVDRRFGAAVISSGSVNELDEAGRQGLYASVREHLEPGGKFLLSLALSEVAESQ
PPERRQELPGQSGRLYVLHVSVQPAEETQDITIYPADETADPFVVCTHRRRLVPADRIVR
ELLRAGFDVIARTPFASGASGRAGHEDMLLVEAVKQEGAIPAAR

>putative SAM-dependent N-methyltransferase [putative N-methyl transferase]
GTGAGCGGTCAACTCGAGCGTGGTCCGGTGCGGACCACGCACGCCGACGTCCTGCTGGCC
TCGGTGGGTGAGCGAGGCGTTCTGTGCGACTTCTACGACGAGGAGGGCTCGAACACCTAT
CGGGACCTGATCCAGGACGCGGACGGTACCCCGGAAGCGCGGGAGTTCGCCACTCGCGTC
GGCCCGGTGCCCGGACCCGTGCTGGAGCTCGCGGCCGGCACGGGCCGGCTGACCTTCCCG
TTCCTGGAGCTCGGCTGGGAGGTGACCGCCCTGGAACTGTCGGCCCCGGTGGTCGACGGC
TTCCGGATGCGGCTGGCGGAAGCACCGGCGGACCTGCGGGACCGCTGCACAGTGGTTCAG
GCGGACATGAGCGCTTTCTCGGTGGACCGGCGCTTCGGGGCAGCGGTCATCAGCTCGGGT
TCGGTCAACGAACTGGACGAAGCCGGCCGGCAGGGCCTGTACGCGTCGGTTCGCGAGCAC
CTCGAGCCCGGCGGGAAGTTCCTGCTCAGCCTGGCCTTGTCGGAGGTCGCCGAGTCACAG
CCGCCGGAGCGCCGGCAAGAGTTGCCAGGCCAGAGCGGCCGGCTGTACGTGTTGCACGTG
AGTGTGCAGCCGGCGGAGGAGACCCAGGACATCACGATCTACCCCGCCGACGAAACAGCG
GATCCCTTCGTCGTCTGCACGCATCGCCGCCGGCTCGTCCCGGCGGACCGGATAGTGCGG
GAACTTCTTCGGGCCGGCTTCGACGTGATCGCGCGGACGCCGTTCGCGTCCGGTGCGTCC
GGCCGGGCGGGCCATGAAGACATGTTGCTGGTGGAAGCGGTGAAGCAGGAGGGCGCTATC
CCAGCCGCGCGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Balhi_00190 Balhi_00210