| Category | 1.4 Other |
|---|
| Product | putative MbtH-like protein |
|---|
| Product (GenBank) | Dbv15 protein |
|---|
| Gene | |
|---|
| Gene (GenBank) | dbv15 |
|---|
| EC number | |
|---|
| Keyword | |
|---|
| Note | |
|---|
| Note (GenBank) | |
|---|
| Reference | - ACC
- Q7WZ76
- PmId
[12837387] The gene cluster for the biosynthesis of the glycopeptide antibiotic A40926 by nonomuraea species. (Chem Biol. , 2003)
[17873036] Phosphate-controlled regulator for the biosynthesis of the dalbavancin precursor A40926. (J Bacteriol. , 2007)
[25986904] Two Master Switch Regulators Trigger A40926 Biosynthesis in Nonomuraea sp. Strain ATCC 39727. (J Bacteriol. , 2015) - comment
- [PMID: 12837387](2003)
Nonomuraea sp. ATCC39727由来A40926生合成gene clusterの同定論文。
A40926は半合成グリコペプチドdalbavancin (BI397 or MDL 62,397)の前駆体。
dbv ORF15: unknown
配列解析のみ。
-----
このORFの発現を調節するタンパクについての報告
[PMID: 17873036](2007)
RT-PCRとその産物のシークエンスで、dbv17-dbv8が同時転写されることを確認。
リン酸による遺伝子発現への影響がreal-time RT-PCRで調査されている。dbv15は影響を受けないが、dbv14-dbv8 operonはnegativeに影響される。
--
[PMID: 25986904](2015)
dbv clusterにあるregulatory genes dbv3, dbv4, dbv6についての調査。
dbv3の不活化株と過剰発現株からRNAを抽出してqRT-PCR解析した結果と既に確立されているオペロン構造から、Dbv3は6つのオペロン(dbv2-dbv1, dbv14-dbv8, dbv17-dbv15, dbv21-dbv20, dbv24-dbv28, dbv30-dbv35)と4つのmonocistronic transcription units dbv4, dbv29, dbv36, dbv37のpositive regulatorとして働くことが示された。
|
|---|
| Related Reference | - ACC
- Q939Y8
- NITE
- Balhi_00100
- PmId
[11932455] Nonribosomal biosynthesis of vancomycin-type antibiotics: a heptapeptide backbone and eight peptide synthetase modules. (Microbiology. , 2002)
[16907743] The small MbtH-like protein encoded by an internal gene of the balhimycin biosynthetic gene cluster is not required for glycopeptide production. (FEMS Microbiol Lett. , 2006)
[21826462] Function of MbtH homologs in nonribosomal peptide biosynthesis and applications in secondary metabolite discovery. (J Ind Microbiol Biotechnol. , 2011) - comment
- BLAST id86%
Amycolatopsis balhimycina
Putative uncharacterized protein
orf1に相当するentry.
---
[PMID: 11932455](2002)
balhimycin生合成gene clusterにおけるbpsA, bpsB, bpsC, bpsD, orf1の同定。
orf1については配列解析のみ。orf1とそれに似たタンパクをコードする遺伝子はNRPSをコードするclusterにあり、bpsC/orf1は翻訳共役される。よって非リボソーム生合成での関与が示唆される。
---
[PMID: 16907743](2006)
orf1は、ほとんどすべてのNRPS生合成gene clustersにおいて同定されるmbtH-like geneである。すべてのグリコペプチド生合成gene clustersにおいて、orf1-like geneはいつもNRPSの最後のmoduleをコードする遺伝子の下流に位置する。
orf1 deletion mutantはbalhimycin産生に影響しなかった。これはOrf1がNRPSや複合体の安定化に関与しているからか、A. balhimycina染色体上に少なくともあと2つあるOrf1-like proteinが代替しているせいかもしれない。
---
[PMID: 21826462](2011)
mbtH homologsに関するレビュー。
orf1についても述べられ、配列解析に使用されている。
|
|---|
- ACC
- Q50EC7
- PmId
- comment
- BLAST id70%
Streptomyces filamentosus (Streptomyces roseosporus)_dptG
DaptomycinはA21978C family天然産物の環状lipopeptideである。
ΔdptGHIJ mutantの相補実験でdptGHIJすべての存在がA21978Cの最大産生に必要とされることから、dptGはA21978Cの生合成でプラス効果を持つようだと述べている。
|
- ACC
- Q8GHC8
- PmId
-
[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id65%
Streptomyces roseochromogenes subsp. oscitans_cloY
MbtH-like protein
clorobiocin生合成遺伝子
---
[PMID: 17464055](2007)
cloYのin-frame deletion株を作製。
宿主大腸菌のMbtH-like proteinも不活性化させ完全に欠損させるとclorobiocin合成は劇的に減少した。相補実験もされており、CloY(MbtH-like protein)は二次代謝産物生合成に関与することを示した。
また、宿主が持つMbtH-like proteinが相補できることから、異なるmbtH-like genesはお互いに機能を補えることも示した。CloYは、clorobiocin moleculeの3-amino-4,7-dihydroxy-coumarin moietyの形成を特異的に要求すると考察。
---
[PMID: 21890635](2011)
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
|
- ACC
- E2EKP2
- PmId
- comment
- BLAST id47%
Streptomyces coeruleorubidus_pac10(pacJ)
MbtH domain-containing protein
|
- ACC
- Q8RN06
- NITE
- Vanco_00110
- PmId
[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id88%
Amycolatopsis orientalis_ORF127
Putative MbtH like protein
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
MbtH-like proteinとして使用されているOrf1vanがこのentryに相当する。対応するTyrアデニル化酵素として使用されているのは、Chloroeremomycin cluster geneのPCZA361.18(Chlor_00200)である。
|
- ACC
- A0A0A0V1G6
- PmId
- comment
- BLAST id85%
Amycolatopsis orientalis_vcm11
MbtH-like protein
vancomycin生合成gene clusterにおけるmbtH-like gene (vcm11)のdeletionはvancomycin産生を完全に廃止し、その相補株はvancomycin産生のほぼ完全な回復を示した。
同族(Vcm11)と非同族(CloY)のMbtH-like proteinの過剰発現で、vancomycin産生が増加した。
|
A4092_00200
Location
![[3-53] 2.50000909916183e-36 SM00923](../../img/R.gif "[3-53] 2.50000909916183e-36 SM00923"){kind=small}
![[1-53] 1e-28 PF03621](../../img/H.gif "[1-53] 1e-28 PF03621"){kind=small}
![[11-66] 2.80000000000001e-29 G3DSA:3.90.820.10](../../img/X2.gif "[11-66] 2.80000000000001e-29 G3DSA:3.90.820.10"){kind=small}
