Chlor_00200 Chlor_00200   Chlor_00220 Chlor_00220

Chlor_00210 : CDS information

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Organism
StrainA82846UV37B
Entry nameChloroeremomycin
Contig
Start / Stop / Direction47,763 / 48,956 / + [in whole cluster]
13,519 / 14,712 / + [in contig]
Location47763..48956 [in whole cluster]
13519..14712 [in contig]
TypeCDS
Length1,194 bp (397 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Productputative cytochrome P450
Product (GenBank)PCZA361.17
GenecepL
ORF20
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • Bht
Note
Note (GenBank)
  • similar to P450 related oxidase/hydroxylase
Reference
ACC
PmId
[9545426] Sequencing and analysis of genes involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. (Chem Biol. , 1998)
[12596194] Vancomycin assembly: nature's way. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2003)
comment
[PMID: 9545426](1998)
chloroeremomycin生合成 gene clusterの報告。

ORF20(397aa): P450-related oxidase
配列解析のみ。ion-heme binding motifを含んでいる。

---
[PMID: 12596194](2003)
グリコペプチド系抗生物質の生合成に関するレビュー。

chloroeremomycin-producing (Cep) A. orientalis由来約40genesのうち、明らかにグリコペプチド生合成経路に割り当てられる30genesを、タンパク名、予測された or 知られた機能、酵素活性の補助基質・補因子などと共にリスト化している。

>Orf20
metabolic pathway : beta-hydroxytyrosine
protein name : CepL
function : hydroxylation
cofactor : NADPH
クローニングと精製はされたことがあるが、解析はされていない。
Related Reference
ACC
Q939Y1
NITE
Balhi_00240
PmId
[15342578] Biosynthesis of chloro-beta-hydroxytyrosine, a nonproteinogenic amino acid of the peptidic backbone of glycopeptide antibiotics. (J Bacteriol. , 2004)
[20519494] Structural characterization of OxyD, a cytochrome P450 involved in beta-hydroxytyrosine formation in vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2010)
comment
BLAST id91%
Amycolatopsis balhimycina_oxyD
Putative P450 monooxygenase

---
[PMID: 15342578](2004)
oxyDはbeta-hydroxytyrosine(beta-HT)形成に関与するbhp, bpsDとオペロンを形成することから、この経路への関与を調査。

oxyDのin-frame deletion mutant株OP090は活性のある化合物を産生できなかったが、oxyD geneでの相補によりbalhimycin産生を回復する。

・oxyD deletion mutant OP090
・bhp deletion mutant OP696
・bpsD disruption mutant BpsD-cat
・null mutant JR1 (blocked in HPG and DPG synthesis)

を用いてcross-feeding実験を実施。OP090はJR1との組み合わせでのみbalhimycin産生を回復。よってOP090は OP696, BpsD-catと同じ経路、すなわちbeta-HT合成でブロックされることが実証された。

beta-HTを含んだ培地でOP090を培養するとbalhimycin産生を回復したこともふまえ、OP090がbeta-HT合成でブロックされることが明白に実証された。

---
[PMID: 20519494](2010)
発現・精製して得たOxyDとBpsD_PCP domainを滴定し、P450吸収スペクトルのシフトで基質結合を確認している。OxyDはBpsD_PCPに結合したアミノ酸を、基質として結合する。

OxyDの結晶構造を測定。この結果とアミノ酸配列から、OxyDのようなアミノ酸が結合したPCPsを酸化するP450sの共通motifを同定している。

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selected fasta
>putative cytochrome P450 [PCZA361.17]
MQTTTAVGDLGNPDLYTTLDRHARWRELAARDAMVWSEPGSSPTGFWSVFSHRACAAVLA
PSAPFTSEYGMMIGFDRDHPDKSGGQMMVVSEQEQHRKLRRLVGPLLSRAAARKLSERVR
TEVSGVLDQVLDGGVCDVATAIGPRIPAAVVCEILGVPAEDEDMLIELTNHAFGGEDELF
DGMTPRQAHTEILVYFDELITARRERPADDLVSTLVTDDELTIDDVLLNCDNVLIGGNET
TRHAITGAVHALATVPGLLTGLQDGSADVDTVVEEVLRWTSPAMHVLRVSTDDVTINGQD
LPAGTPVVAWLPAANRDPAEFDDPDTFLPGRKPNRHITFGHGMHHCLGSALARIELSVVL
RVLAERVSRVELVKEPAWLRAIVVQGYAELSARFTGR
selected fasta
>putative cytochrome P450 [PCZA361.17]
ATGCAGACGACGACAGCCGTCGGTGATCTCGGTAACCCGGATCTGTACACGACCTTGGAC
CGGCACGCCCGCTGGCGCGAGCTGGCCGCGCGGGACGCGATGGTGTGGAGTGAACCGGGC
AGTTCACCCACCGGTTTCTGGTCGGTGTTCTCGCACCGGGCGTGCGCCGCGGTCCTCGCG
CCCTCGGCGCCGTTCACCTCCGAGTACGGAATGATGATCGGGTTCGACCGTGACCACCCG
GACAAGTCGGGCGGTCAGATGATGGTGGTCTCCGAGCAGGAGCAGCACCGCAAACTGCGC
AGGCTGGTCGGGCCGCTGTTGTCCAGGGCGGCTGCCCGCAAGCTGTCGGAGCGGGTGCGC
ACCGAGGTCAGCGGCGTGCTGGACCAGGTGCTCGACGGCGGCGTGTGCGACGTGGCGACG
GCGATCGGCCCGCGCATTCCCGCCGCGGTCGTGTGCGAGATCCTCGGTGTGCCCGCCGAG
GACGAGGACATGCTCATCGAGCTGACCAACCACGCGTTCGGCGGTGAGGACGAGCTGTTC
GACGGGATGACGCCACGCCAGGCGCACACCGAGATCCTCGTCTACTTCGACGAACTGATC
ACCGCGCGCCGCGAGCGTCCCGCCGACGACCTCGTCAGCACGCTGGTGACCGATGACGAG
CTCACGATCGACGACGTGTTGCTCAACTGCGACAACGTGTTGATCGGCGGGAACGAGACC
ACGCGGCACGCGATCACCGGTGCGGTGCACGCCCTCGCCACGGTGCCCGGCCTGCTGACC
GGGCTGCAAGACGGGAGCGCCGACGTCGACACCGTCGTGGAGGAGGTGCTGCGCTGGACC
TCGCCGGCGATGCACGTCCTGCGGGTGTCGACCGACGATGTCACGATCAACGGCCAGGAC
CTGCCGGCAGGCACACCGGTGGTCGCGTGGTTGCCCGCCGCGAACAGGGATCCCGCCGAG
TTCGACGACCCCGACACGTTCCTCCCAGGGCGGAAACCCAACCGCCACATCACCTTCGGC
CACGGTATGCACCACTGCCTCGGGTCCGCGCTGGCGCGGATCGAGCTGTCGGTCGTGTTG
CGAGTGCTGGCCGAGCGGGTGTCGCGGGTGGAGCTGGTGAAGGAGCCTGCCTGGCTGCGC
GCGATCGTCGTGCAGGGGTACGCGGAGCTTTCGGCGCGGTTCACCGGGCGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001128 Cytochrome P450 (Family)
[270-361] 1.8e-19 PF00067
PF00067   p450
[10-397] 3.89999861795218e-84 SSF48264
SSF48264   Cytochrome_P450
[236-253] 4.19999771339581e-06 PR00385 [271-282] 4.19999771339581e-06 PR00385 [337-346] 4.19999771339581e-06 PR00385 [346-357] 4.19999771339581e-06 PR00385
PR00385   P450
[18-397] 1e-92 G3DSA:1.10.630.10
G3DSA:1.10.630.10   Cyt_P450
IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family)
[91-102] 1.70000295590053e-46 PR00359 [137-153] 1.70000295590053e-46 PR00359 [154-169] 1.70000295590053e-46 PR00359 [194-216] 1.70000295590053e-46 PR00359 [271-282] 1.70000295590053e-46 PR00359 [288-315] 1.70000295590053e-46 PR00359 [316-331] 1.70000295590053e-46 PR00359 [337-346] 1.70000295590053e-46 PR00359 [346-357] 1.70000295590053e-46 PR00359
PR00359   BP450
IPR017972 Cytochrome P450, conserved site (Conserved_site)
[339-348] PS00086
PS00086   CYTOCHROME_P450
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Chlor_00200 Chlor_00200   Chlor_00220 Chlor_00220
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