Chlor_00300 Chlor_00300   Chlor_00320 Chlor_00320

Chlor_00310 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainA82846UV37B
Entry nameChloroeremomycin
Contig
Start / Stop / Direction58,888 / 59,691 / + [in whole cluster]
24,644 / 25,447 / + [in contig]
Location58888..59691 [in whole cluster]
24644..25447 [in contig]
TypeCDS
Length804 bp (267 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category2.1 modification addition of extender units
Productenoyl-CoA hydratase
Product (GenBank)PCZA361.9
GenedpgD
ORF30
Gene (GenBank)
EC number4.2.1.-
Keyword
  • Dpg
Note
Note (GenBank)
  • similar to enoyl hydratase
Reference
ACC
PmId
[9545426] Sequencing and analysis of genes involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. (Chem Biol. , 1998)
[11752437] Glycopeptide antibiotic biosynthesis: enzymatic assembly of the dedicated amino acid monomer (S)-3,5-dihydroxyphenylglycine. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2001)
comment
[PMID: 9545426](1998)
chloroeremomycin生合成 gene clusterの報告。

ORF30(267aa): Carnitine racemase
配列解析のみ。詳細記載なし。

---
[PMID: 11752437](2001)
chloroeremomycin産生株A. orientalis NRRL 18098由来dpgA-D（もともとはORFs 27-30としてリストされたもの）を、E. coliで発現・精製し、酵素活性と産物同定の実験に使用している。

DpgAはmalonyl-CoAから3,5-dihydroxyphenylacetyl-CoA(DPA-CoA)とCoASHを産生。DPA-CoAはかろうじて検出できる程度だが、DpgBを追加すると劇的に産生促進された。DpgB単独ではmalonyl-CoAを基質として活性を持たない。DpgA/DpgBによるmalonyl-CoA利用のkcat and Km値測定あり。

DpgBの代わりにDpgDを加えてもDpgA活性に影響はなかったが、DpgA/DpgBにDpgDを加えるとさらに2倍の増加が見られた。

DpgB and DpgDは、β-hydroxy acyl-CoA基質→α,β-enoyl-CoAsへの可逆的dehydrationを触媒するcrotonase superfamilyのメンバーに似ていることから、いくつかのenoyl-CoA and β-hydroxy acyl-CoA基質でテストされた。crotonyl- and β-methylcrotonyl-CoAでのhydratase活性が検出されたが、kcat値が低かったのでこれらは生理学的基質ではない。Dpg生合成では逆反応のdehydratasesとして働き、DPA-SR(R = DpgA or CoA)へのaromatizationを促進するのかもしれない。

close this sectionSequence

selected fasta
>enoyl-CoA hydratase [PCZA361.9]
MSYTRVRYEKKDHVACVTMDRPDVLNAMDRRMHTELAEIWDDVEADDDIRAVVLTGAGNR
AFTVGQDLKERAQRNDAGEEESTFGSRGQAGHPRLTDRFTLSKPVVARVHGYALGGGFEL
VLACDIVIASEEAIFGLPEVQLGLIPGAGGVFRLPRQLPQKVAMGYLLTGRRMDAATALR
YGLVNEVVPLDELDQCVAGWTDSLVRAAPLSVRAIKQAALRSLDLPLEEAFTASYPWEER
RRRSEDAIEGVRAFTEKRDPVWTGHYM
selected fasta
>enoyl-CoA hydratase [PCZA361.9]
ATGAGCTACACCCGGGTGCGGTACGAGAAGAAGGATCACGTCGCCTGCGTGACGATGGAC
CGGCCCGACGTGCTGAACGCGATGGACCGGCGGATGCACACGGAGCTCGCCGAGATCTGG
GATGACGTCGAGGCCGATGACGACATCAGGGCGGTTGTACTGACCGGCGCGGGAAATCGC
GCGTTCACCGTCGGCCAGGACCTCAAGGAACGCGCGCAACGCAACGACGCGGGCGAGGAA
GAGTCGACGTTCGGCAGCCGGGGCCAGGCAGGCCATCCCCGGCTGACCGACCGTTTCACG
CTCTCCAAGCCCGTGGTTGCCCGGGTACACGGCTACGCGCTGGGCGGCGGCTTCGAGCTC
GTGCTCGCCTGCGACATCGTGATCGCCTCAGAGGAGGCGATATTCGGCCTGCCGGAGGTC
CAACTCGGCCTGATCCCCGGGGCGGGCGGCGTGTTCCGGCTGCCGCGGCAGCTGCCGCAG
AAGGTCGCGATGGGCTACCTGCTGACCGGGCGACGGATGGATGCGGCGACAGCGCTTCGA
TACGGACTGGTGAACGAGGTCGTGCCGCTGGATGAGCTGGATCAGTGCGTCGCCGGATGG
ACCGACAGCCTCGTGCGCGCCGCGCCGCTCTCGGTTCGCGCGATCAAACAGGCCGCGTTG
CGGTCGCTCGACCTCCCACTCGAGGAGGCATTCACCGCCTCGTATCCGTGGGAGGAGCGT
CGCAGGCGAAGCGAGGACGCGATCGAGGGCGTCCGGGCCTTCACTGAAAAACGGGATCCG
GTTTGGACAGGGCATTACATGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001753 Crotonase, core (Domain)
[8-257] 8.60000000000005e-62 PF00378
PF00378   ECH
IPR018376 Enoyl-CoA hydratase/isomerase, conserved site (Conserved_site)
[106-126] PS00166
PS00166   ENOYL_COA_HYDRATASE
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Chlor_00300 Chlor_00300   Chlor_00320 Chlor_00320
Page top