微生物 : Salinispora arenicola
微生物株情報
| NBRC番号 | 105043 |
|---|---|
| 学名 | Salinispora arenicola |
| 別名（シノニム） | 該当データなし |
| 由来 | JCM 13856 <- DSM 44819 <- P.R. Jensen, CNH-643 |
| 他保存機関番号 | ATCC BAA-917=BCRC 16821=CIP 108942=DSM 44819=JCM 13856 |
| 他株番号 | CNH-643 |
| 参考文献 |
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推定保有機能 >>詳細
ゲノム配列情報
| BioProject ID | PRJNA84391 |
|---|---|
| ローカスタグ | Q5S |
| INSDC entries | AIIF01000000 |
| ステータス | WGS |
| 解析状況 | |
| コンティグ数 | 3823 |
| サイズ(bp) | 4,745,047 |
| 遺伝子数 | 0 |
| フィニッシングゴール | |
| アセンブル方法 | Newbler v. 2.3 |
| 冗長度 | 8x 454 GS FLX; 0.5x Sanger |
| シーケンス方法 |
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参考文献
- The natural product domain seeker NaPDoS: a phylogeny based bioinformatic tool to classify secondary metabolite gene diversity. (PLoS One. 2012) PMID: 22479523
データダウンロード
| ゲノム塩基配列 | CDS塩基配列 | CDSアミノ酸変換配列 | 遺伝子/ORF リスト |
|---|---|---|---|
| FASTA gz |
FASTA gz |
FASTA gz |
TSV uncompressed |
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| 1.4 MB | 1.1 MB | 786.7 KB | 478.8 KB |
