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微生物 : Aquimarina agarilytica

微生物株情報

NBRC番号 107695
学名 Aquimarina agarilytica
別名（シノニム） 該当データなし
由来 Shantou Univ. (B. Lin, ZC1)
他保存機関番号 CCTCC AB 2010229
他株番号 ZC1
参考文献
21622833
Aquimarina agarilytica sp. nov., an agarolytic species isolated from a red alga. (Int J Syst Evol Microbiol. 2012)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAagaZ_020100013449
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAagaZ_020100013734
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAagaZ_020100015405
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAagaZ_020100015405
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinAagaZ_020100015400

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA173055
ローカスタグAagaZ
INSDC entriesNZ_AHHE02000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数131
サイズ(bp) 4,253,672
遺伝子数 3,475
フィニッシングゴール
アセンブル方法SOAPdenovo v. 1.04
冗長度50x
シーケンス方法
  • Illumina HiSeq 2000
参考文献
  • Draft genome sequence of the novel agarolytic bacterium Aquimarina agarilytica ZC1. (J Bacteriol. 2012) PMID: 22535944

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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1.2 MB 1.2 MB 779.3 KB 280.6 KB