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微生物 : Enterococcus italicus

微生物株情報

NBRC番号 107825
学名 Enterococcus italicus
別名（シノニム） 該当データなし
由来 LMG 22039 <- Univ. Milan (G. Fortina, TP1.5) <- Univ. Milan (G. Ricci)
他保存機関番号 CCM 7297=CCUG 50447=DSM 15952=LMG 22039
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF9088_2129
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseHMPREF9088_0350
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF9088_1445
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF9088_0182
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeHMPREF9088_0406
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF9088_0475
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF9088_1336 HMPREF9088_0275
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF9088_0275 HMPREF9088_1336
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF9088_1342
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinHMPREF9088_1341 HMPREF9088_1343
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinHMPREF9088_1344 HMPREF9088_1539

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA53039
ローカスタグHMPREF9088
INSDC entriesAEPV01000000
ステータスWGS
解析状況Standard Draft
コンティグ数157
サイズ(bp) 2,308,476
遺伝子数 2,405
フィニッシングゴールStandard Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3-04192010
冗長度32.5x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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