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微生物 : Aerococcus viridans

微生物株情報

NBRC番号 12219
学名 Aerococcus viridans
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 12219 <- NISL <- C.F. Niven, Jr. <- NCTC 8251 <- R.E.O. Williams, M1
他保存機関番号 ATCC 11563=CCM 1914=CCUG 4311=CIP 54.145=DSM 20340=IAM 13649=LMG 17931=NCDO 1225=NCTC 8251
他株番号 M1
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0061_1284
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0061_0254
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0061_0657
E
MPH
(NRULE_0169)
Macrolide 2'-phosphotransferaseHMPREF0061_0185
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHMPREF0061_1869
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0061_1512 HMPREF0061_1098
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseHMPREF0061_1457
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2HMPREF0061_1457
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDHMPREF0061_1455
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseHMPREF0061_0527
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseHMPREF0061_1456
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFHMPREF0061_0277

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA38729
ローカスタグ
INSDC entriesADNT01000000
ステータスWGS
解析状況High-Quality Draft
コンティグ数150
サイズ(bp) 2,005,853
遺伝子数 1,929
フィニッシングゴールHigh-Quality Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.0.0-Eclipse
冗長度37.6x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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