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微生物 : Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius

微生物株情報

NBRC番号 15652
学名 Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius
別名（シノニム） Alicyclobacillus acidocaldarius
Bacillus acidocaldarius
由来 IFO 15652 <- JCM 5260 <- DSM 446 <- ATCC 27009 <- T.D. Brock, 104-IA
他保存機関番号 ATCC 27009=BCRC 14685=CCUG 28521=CIP 106131=DSM 446=HAMBI 2071=HAMBI 2073=JCM 5260=KCTC 1825=LMG 7119=NCCB 89167=NCIMB 11725=NRRL B-14509
他株番号 104-IA
参考文献
1374624
Comparative sequence analyses on the 16S rRNA (rDNA) of Bacillus acidocaldarius, Bacillus acidoterrestris, and Bacillus cycloheptanicus and proposal for creation of a new genus, Alicyclobacillus gen. nov. (Int J Syst Bacteriol. 1992)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAaci_0357
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseAaci_0706
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseAaci_0321
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須B
ARSB1
(NRULE_0015)
Arsenical pump membrane proteinAaci_0536
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseAaci_0537 Aaci_2033
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAaci_0212 Aaci_1660
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseAaci_2856
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseAaci_2857
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDAaci_2855
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseAaci_2854
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinAaci_2139
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAaci_2844 Aaci_1215 Aaci_2511 Aaci_0041 Aaci_2237
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAaci_2511 Aaci_0041 Aaci_1215 Aaci_2237 Aaci_2844
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseAaci_0298 Aaci_1959
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseAaci_2607
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseAaci_2865
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseAaci_2606
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseAaci_0339
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinAaci_2050 Aaci_0991
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseAaci_2464 Aaci_1909 Aaci_0762 Aaci_0334
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseAaci_0938
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Aaci_0938
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDAaci_0936
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseAaci_0939
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseAaci_0937
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFAaci_1439
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSAaci_0012
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTAaci_0013

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA29405
ローカスタグ
INSDC entriesCP001727
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数4
サイズ(bp) 3,205,686
遺伝子数 3,084
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Alicyclobacillus acidocaldarius type strain (104-IA). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304673

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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964.4 KB 857.8 KB 608.2 KB 236.9 KB