English site

微生物 : Zimmermannella faecalis

微生物株情報

NBRC番号 15706
学名 Zimmermannella faecalis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 15706 <- ATCC 13722 <- H.P. Broquist, B187
他保存機関番号 ATCC 13722=CCUG 37873=CIP 108568=IAM 15030=JCM 12866=NCTC 11398=TISTR 1514
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseG328_08985
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseG328_05680
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseG328_01630
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinG328_03220 G328_00245 G328_08510
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinG328_12565 G328_03285
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinG328_12565 G328_03285
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinG328_12570
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須C
PHEA2
(NRULE_0084)
Aromatic ring hydroxylaseG328_05435
任意 
FDR1
(NRULE_0032)
Oxygenase electron transfer componentG328_00840
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinG328_00755 G328_01455 G328_10980
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseG328_03640 G328_03955 G328_12685
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseG328_10010
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseG328_10015
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeG328_10005 G328_10150
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterG328_09620 G328_03645
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterG328_09835
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSG328_00995
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTG328_01000

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA200407
ローカスタグL167
INSDC entriesNZ_ARMM01000000
ステータスWGS
解析状況Improved High-Quality Draft
コンティグ数18
サイズ(bp) 2,847,263
遺伝子数 2,605
フィニッシングゴールImproved High-Quality Draft
アセンブル方法Velvet v. 1.1.04; ALLPATHS v. r42328
冗長度Unknown
シーケンス方法
  • Illumina HiSeq 2000
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
829.8 KB 755.9 KB 508.6 KB 178.7 KB