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微生物 : Lactobacillus animalis

微生物株情報

NBRC番号 15882
学名 Lactobacillus animalis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 15882 <- JCM 5670 <- ATCC 35046 <- NCDO 2425 <- R.A.D. Williams, 1535
他保存機関番号 ATCC 35046=DSM 20602=JCM 5670
他株番号 1535=NCDO 2425
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLaniK3_010100000430
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseLaniK3_010100006269
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLaniK3_010100000610
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseLaniK3_010100005967
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeLaniK3_010100006854
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseLaniK3_010100006269
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinLaniK3_010100000555
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinLaniK3_010100000550
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinLaniK3_010100000545

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA67869
ローカスタグLACAN
INSDC entriesNZ_AEOF01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数7
サイズ(bp) 1,865,693
遺伝子数 1,822
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度36.3x
シーケンス方法
  • 454
参考文献
  • Genome sequence of Lactobacillus animalis KCTC 3501. (J Bacteriol. 2011) PMID: 21183665

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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