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微生物 : Lactobacillus casei

微生物株情報

NBRC番号 15883
学名 Lactobacillus casei
別名（シノニム） Lactobacillus casei subsp. casei
由来 IFO 15883 <- JCM 1134 <- ATCC 393 <- G.J. Hukcker, 03 <- S. Orla-Jensen, 7
他保存機関番号 ATCC 393=BCC 36987=DSM 20011=JCM 1134
他株番号
参考文献
8573516
Reclassification of Lactobacillus casei subsp. casei ATCC 393 and Lactobacillus rhamnosus ATCC 15820 as Lactobacillus zeae nom. rev., designation of ATCC 334 as the neotype of L. casei subsp. casei, and rejection of the name Lactobacillus paracasei. (Int J Syst Bacteriol. 1996)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLCABL_27280
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLCABL_10200
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseLCABL_10260
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeLCABL_08060
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinLCABL_00640 LCABL_23250
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinLCABL_00650 LCABL_00630 LCABL_23260
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinLCABL_00660 LCABL_23270

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJEA30359
ローカスタグ
INSDC entriesFM177140
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,079,196
遺伝子数 3,044
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of the probiotic Lactobacillus casei strain BL23. (J Bacteriol. 2010) PMID: 20348264

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
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gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
937.8 KB 818.3 KB 569.1 KB 264.0 KB