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微生物 : Lentisphaera araneosa

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Lentisphaera araneosa
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 HTCC2155
参考文献
15142250
Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, a transparent exopolymer producing marine bacterium, and the description of a novel bacterial phylum, Lentisphaerae. (Environ Microbiol. 2004)
20363947
Genome sequence of Lentisphaera araneosa HTCC2155T, the type species of the order Lentisphaerales in the phylum Lentisphaerae. (J Bacteriol. 2010)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLNTAR_10596
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseLNTAR_16793
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ILNTAR_20763
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLNTAR_17203
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinLNTAR_10361
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLNTAR_12236 LNTAR_08734 LNTAR_15437
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLNTAR_08734 LNTAR_15437 LNTAR_12236

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13437
ローカスタグLNTAR
INSDC entriesABCK01000000
ステータスContig
解析状況
コンティグ数81
サイズ(bp) 6,023,180
遺伝子数 5,104
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, a transparent exopolymer producing marine bacterium, and the description of a novel bacterial phylum, Lentisphaerae. (Environ Microbiol. 2004) PMID: 15142250
  • Genome sequence of Lentisphaera araneosa HTCC2155T, the type species of the order Lentisphaerales in the phylum Lentisphaerae. (J Bacteriol. 2010) PMID: 20363947

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
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1.8 MB 1.7 MB 1.1 MB 381.2 KB