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微生物 : Endomicrobium proavitum

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Endomicrobium proavitum
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 JCM 30189
他株番号 Rsa215
参考文献
26184928
Complete Genome Sequence of Endomicrobium proavitum, a Free-Living Relative of the Intracellular Symbionts of Termite Gut Flagellates (Phylum Elusimicrobia). (Genome Announc. 2015)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseEpro_0017
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseEpro_0707
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IEpro_0708
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinEpro_0153
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinEpro_1196
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinEpro_1196
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseEpro_0584
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Epro_0584
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDEpro_0586
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseEpro_0583
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseEpro_0585
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFEpro_0790

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA222699
ローカスタグEPRO
INSDC entriesCP009498
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,588,979
遺伝子数 1,325
フィニッシングゴール
アセンブル方法SMRT Analysis v. 2.2.0.p2; SMRT pipe v. 2.2.0; SMRT Portal v. 2.2.0; RS_HGAP_Assembly.3
冗長度76.04x
シーケンス方法
  • PacBio RS I
参考文献
  • Complete Genome Sequence of Endomicrobium proavitum, a Free-Living Relative of the Intracellular Symbionts of Termite Gut Flagellates (Phylum Elusimicrobia). (Genome Announc. 2015) PMID: 26184928

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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