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微生物 : Kordia algicida

微生物株情報

NBRC番号 100336
学名 Kordia algicida
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Korea Res. Inst. Biosci. Biotec. (K.S. Bae, OT-1)
他保存機関番号 KCTC 8814P
他株番号 OT-1
参考文献
15143006
Kordia algicida gen. nov., sp. nov., an algicidal bacterium isolated from red tide. (Int J Syst Evol Microbiol. 2004)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseKAOT1_16238
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseKAOT1_04160 KAOT1_04210 KAOT1_04175 KAOT1_04170
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBKAOT1_10416
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseKAOT1_02642
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseKAOT1_14567
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseKAOT1_10021

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA19315
ローカスタグ
INSDC entriesABIB01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数34
サイズ(bp) 5,019,836
遺伝子数 4,514
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Genome sequence of the algicidal bacterium Kordia algicida OT-1. (J Bacteriol. 2011) PMID: 21622754

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1.5 MB 1.4 MB 919.1 KB 342.1 KB