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微生物 : Gemmatimonas aurantiaca

微生物株情報

NBRC番号 100505
学名 Gemmatimonas aurantiaca
別名（シノニム） 該当データなし
由来 AIST (S. Hanada, T-27)
他保存機関番号 JCM 11422=DSM 14586
他株番号 T-27
参考文献
12892144
Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov. (Int J Syst Evol Microbiol. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseGAU_1449
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseGAU_3904
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseGAU_1533
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseGAU_2840
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseGAU_2841
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDGAU_2842
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseGAU_2843
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinGAU_2884
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinGAU_2884
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinGAU_2885
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinGAU_2886

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA18501
ローカスタグGAU
INSDC entriesAP009153
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,636,964
遺伝子数 3,935
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.4 MB 1.3 MB 873.6 KB 288.1 KB