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微生物 : Enterococcus phoeniculicola

微生物株情報

NBRC番号 100711
学名 Enterococcus phoeniculicola
別名(シノニム) 該当データなし
由来 KCTC 3818 <- P.R. Meyers, JLB-1
他保存機関番号 ATCC BAA-412=CCUG 48923=CIP 108361=DSM 14726=KCTC 3818
他株番号 JLB-1
参考文献
12807187
Enterococcus phoeniculicola sp. nov., a novel member of the enterococci isolated from the uropygial gland of the Red-billed Woodhoopoe, Phoeniculus purpureus. (Int J Syst Evol Microbiol. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseI589_00596
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseI589_03166
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseI589_00740 I589_03286
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseI589_01756
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseI589_01745
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseI589_02668
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinI589_02765
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI589_01425 I589_00108
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI589_01425 I589_00108
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseI589_03166
Tyramine biosynthesis(NFUNC_0079)
必須A
TYRDC
(NRULE_0248)
Pyridoxal-dependent tyrosine decarboxylaseI589_01264
任意 
TYRP
(NRULE_0249)
Tyrosine permeaseI589_01265
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinI589_00617
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinI589_00618 I589_00616
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinI589_00619 I589_00677

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA191910
ローカスタグ
INSDC entriesASWE01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数11
サイズ(bp) 3,910,972
遺伝子数 3,512
フィニッシングゴール
アセンブル方法allpaths v. R44557
冗長度138.0x
シーケンス方法
  • Illumina
  • PacBio
参考文献

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
gz
FASTA
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TSV
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