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微生物 : Acetobacter pasteurianus

微生物株情報

NBRC番号 101655
学名 Acetobacter pasteurianus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Yamaguchi Univ. (K. Matsushita, SKU1108)
他保存機関番号 BCC 5443
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAPT_1603
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAPT_2795
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseAPT_2068
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IAPT_2067
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAPT_0760
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAPT_2795
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPT_0943
F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRAPT_2813
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRAPT_1341
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPT_0943
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AAPT_2795
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseAPT_1458
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BAPT_1457
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EAPT_1460
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseAPT_1920
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseAPT_1919
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeAPT_1916

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA65545
ローカスタグ
INSDC entriesBACF01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数294
サイズ(bp) 3,018,312
遺伝子数 2,888
フィニッシングゴール
アセンブル方法Velvet v. 0.7.55
冗長度70x
シーケンス方法
  • Illumina
  • Solexa
参考文献
  • Genome-wide phylogenetic analysis of differences in thermotolerance among closely related Acetobacter pasteurianus strains. (Microbiology (Reading). 2012) PMID: 22016572

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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