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微生物 : Gluconobacter frateurii

微生物株情報

NBRC番号 101659
学名 Gluconobacter frateurii
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Yamaguchi Univ. (K. Matsushita, CHM43)
他保存機関番号 BCC 36198
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseGfraN1_010100008901
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseGfraN1_010100004704
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseGfraN1_010100009217
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AGfraN1_010100012751
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseGfraN1_010100002888
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IGfraN1_010100002893
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseGfraN1_010100007742
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須A
ARSB1
(NRULE_0015)
Arsenical pump membrane proteinGfraN1_010100014356
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseGfraN1_010100014361
任意 
ARSH
(NRULE_0021)
ArsH proteinGfraN1_010100014351
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseGfraN1_010100002263
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AGfraN1_010100012751
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinGfraN1_010100004295
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AGfraN1_010100012751
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseGfraN1_010100006391
任意 
PQQA
(NRULE_0090)
Coenzyme PQQ synthesis protein AGfraN1_010100006381
 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BGfraN1_010100006386
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EGfraN1_010100006401

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA178735
ローカスタグD639
INSDC entriesNZ_BADZ01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数145
サイズ(bp) 3,148,763
遺伝子数 2,955
フィニッシングゴール
アセンブル方法Velvet v. 0.7.55
冗長度213x
シーケンス方法
  • Illumina
  • Solexa
参考文献
  • High-temperature sorbose fermentation with thermotolerant Gluconobacter frateurii CHM43 and its mutant strain adapted to higher temperature. (Appl Microbiol Biotechnol. 2012) PMID: 22434571

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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