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微生物 : Clostridium thermocellum

微生物株情報

NBRC番号 103400
学名 Clostridium thermocellum
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IAM 13660 <- ATCC 27405 <- L.D. Smith, VPI 7372 <- J. Alexander <- R. McBee
他保存機関番号 ATCC 27405=DSM 1237=IAM 13660=LMG 10435=NCIB 10682=NRRL B-4536
他株番号 VPI 7372
参考文献
13152068
The characteristics of Clostridium thermocellum. (J Bacteriol. 1954)
16349910
Chemically Defined Medium for Growth of Clostridium thermocellum, a Cellulolytic Thermophilic Anaerobe. (Appl Microbiol. 1971)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCthe_2697
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCthe_0874
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICthe_0875
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCthe_2305
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseCthe_0022
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseCthe_0025
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDCthe_0021
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseCthe_0020
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCthe_1862
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseCthe_0106
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Cthe_0106
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDCthe_0104
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseCthe_0107
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseCthe_0105
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFCthe_0987

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA314
ローカスタグCTHE
INSDC entriesCP000568
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,843,301
遺伝子数 3,173
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.1 MB 968.1 KB 675.5 KB 247.0 KB